Taq Talk十九期 | qPCR在基因分型中的应用

2023-02-06 10:19:04, ABI 赛默飞世尔科技生命科学产品


在上一期Taq Talk中,我们了解了如何使用qPCR进行拷贝数变异分析。在本周第十九期课程中,我们来学习如何分析qPCR SNP基因分型数据


真核基因表达和单核苷酸多态 (Single nubleotide polymorphisms, SNP)需要通过检测终点荧光,确定SNP基因型。从而区分低至单核苷酸水平的差异。因此需要更高的检测特异性。


图1. 利用双重TaqMan MGB探针进行等位基因差异分析


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TaqMan基因分型检测——经充分验证,结果可靠,版式灵活

  • 全球最完整的基因分型检测产品线,具有超过1,700万种基因分型检测

  • 检测设计管线可靠严谨,具有90多个参数用于构建最佳引物/探针组合

  • 每个检测至少使用20个gDNA样本进行功能质量测试

  • 规格灵活,可以适应各种不同通量的靶标和样品

图2. TaqMan Assay版式灵活,可满足不同样本和靶标通量需求

 

TaqPath ProAmp预混液——耐抑制剂,专用于基因分型和拷贝数变异研究

  • 专为SNP和CNV研究优化:用于基因分型和拷贝数变异定量的高性能、高通量预混液

  • 耐抑制剂:可兼容人类或动物来源的样品(口腔拭子、血液和卡片穿孔)

  • 支持多重检测:两种配方(TaqPath™ ProAmp™ Master Mix/TaqPath™ ProAmp™ Multiplex Master Mix),每次反应可检测三个/四个靶标

  • 优秀的生产工艺一致性:在ISO 13485认证的设施中生产,保障优异的检测结果和批间一致性

  • 出色的数据质量:用于基因分型和拷贝数测定时,即使存在抑制剂,仍能保证高特异性、动态范围和可重复性

图3. TaqPath ProAmp预混液与其他市售预混液的基因分型结果对比。粗裂解液通过血液样本稀释20倍后制得。标准条件下三次TaqMan药物代谢SNP基因分型分析运行的结果如图所示。TaqPath ProAmp预混液在多个分析中一致生成准确的基因型指认和极佳的类间分辨率。

 

更多基因分型的讲解,请点击观看Aaron带来的Taqtalk讲解。

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