4篇连发，篇篇9分+的文章到底是怎么炼成的？

小鹿导读

古人云“凡事预则立、不预则废”。想要发表高水平文章，在最初的实验设计阶段，就要考虑到方方面面。将本领域其他研究手段与组学技术有机结合，围绕着研究的实验目标去设计实验，绝对是事半功倍的不二法宝。老师对于整个实验思路的把控，非常值得我们学习和借鉴。下面我们来看一看一作作者怎么说吧~~

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高通量数据信息很丰富，一篇文章只能展示出部分数据结果。同时生理代谢也很复杂，如基础代谢、次级代谢等。每一个代谢途径，都可以结合生理分析和组学数据进行解析相关机理，这就需要对实验有整体规划。就拿这几篇为例，做测试前就规划好，第一篇文章主要是公开组学数据，根据生理分析结果，重点梳理与生理代谢相关的组学数据。第二篇文章就是以第一篇文章数据为基础，从另外一个生理代谢角度再次进行数据的挖掘和分析。

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（1）选择的原则就是一篇文章自己想阐述的科学问题是什么，实验假设是什么。根据实验假设选择相应的实验指标。例如，第一篇实验假设是围绕矿质代谢在设计试验。第二篇则是围绕光合碳代谢和呼吸代谢在设计试验。

（2）做组学实验之前，就要规划好从哪一个切入点进行研究，这样挑选高通量数据才有目的性。而不是拿到一堆数据后，再思考哪里可以用来写文章，这样有可能造成生理指标与组学数据不能相互印证，文章结构不合理，数据分析不到位。

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铀尾矿污染区属于典型的复合污染源，其污染物可以分为两大类：一是放射性核素，如铀、钍、镭、氡等；二是伴生重金属，如铅、镉、锰等。我们课题组长期开展铀及伴生重金属环境生物学效应及修复的研究。前期重点研究了单一铀污染，后期就开展了复合污染研究，这里就选择了毒性较强、具有代表性的伴生重金属镉。

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针对铀镉复合污染研究，整个课题设计是采用多组学解析植物铀镉累积机理及生理响应策略。研究选择了高、低两种甘薯品种进行对比分析，组学的测试内容包括两个品种的代谢组学和转录组学，而我们自己在做植物全生育期元素和离子组分析。第三篇文章从代谢组水平解析了甘薯铀、镉互作机理。刚发表的文章就是从对比转录组学的角度，解析两个品种植物铀、镉吸收机理和生理响应策略。

小鹿导读

工欲善其事，必先利其器。组学技术是分子机制研究的有效手段，如何选择合适的组学技术，深入地进行研究，老师给出了自己的看法。

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植物对生物或者非生物胁迫的生理响应过程比较复杂，涉及基因表达水平（转录组）、蛋白质合成（蛋白组）和代谢产物调控过程（代谢组）。样本在转录组水平的变化，可以预示可能出现的生物学效应；代谢组学则反映了样本正出现的生物学效应。因此两个组学结合起来分析，可以相互验证代谢水平的变化及其分子机理。这两种技术相对比较成熟、数据质量可靠，也是我们做出选择的重要原因。

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第一、二篇文章选择了GC-MS和LC-MS两种平台分析代谢组的变化，目的是获取植物铀胁迫响应的完整非靶向代谢数据。经过后期数据分析发现，两种技术都能检测到相似的差异代谢产物。与GC-MS相比，LC-MS鉴定得到的代谢产物数量更多，获取的数据信息与我的研究内容更契合，因此后续文章选择了LC-MS进行分析。当然想获取完整的非靶向代谢数据，GC-MS和LC-MS联用肯定是最佳选择。

小鹿导读

他山之石，可以攻玉。一篇高水平文章的发表过程，并不总是一帆风顺。在这里，老师毫无保留地分享了投稿中遇到的问题，也总结了宝贵的经验，一定会给您带来新的启发和思考。

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在这里分享一个投稿经验，在投稿评审过程中，审稿人会询问几篇文章异同点在哪里？因此在写文章时，在前言和讨论部分就要进行详细的论述。

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讨论是对结果进一步解释，也是文章最难的地方。其实生理参数、元素含量都是属于代谢水平，如矿质营养代谢、光合代谢、呼吸代谢等。代谢组学能够提供这些代谢途径中小分子代谢产物含量的变化。通过结合代谢产物含量的变化，可以解析生理参数变化的内在机理。同理转录组数据就是从基因表达的角度解析相关机理。对这些高通量数据的解析，我们一定要熟悉生化代谢途径相关产物、酶及调控基因，这样才能快速检索到相关数据。

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组学数据的呈现方式也很重要，公司给的测试结果报告属于标准流程分析，一定要对数据图表进行二次排版，我在这几篇文章中，制图花的时间最多，甚至几个晚上才能绘制一张图表。庆幸的是，审稿人对论文高质量版图都给出了很高的评价。所以，强烈建议制作好每一个图表。我最常用的制图软件就是Excel2010，非常方便，又是矢量图，后期排版线条可以随意更改、组合。Excel绘制不了的图我选择origin。排版采用AI软件。组学数据的分析我常用的就是一些在线分析平台，基本属于傻瓜式操作。

专家简介

罗学刚教授在生物质资源开发、生物质材料、污染控制与生物修复等方面作了大量的研究工作，近5年，主持和完成《矿冶重金属废水生物质吸附材料的研制与应用》等国家科技支撑计划项目、国家863计划项目、国防科技创新团队专项等重点项目10余项。主持研究的《高纯木素的提取与产业化应用开发》等8个项目通过成果鉴定：部分成果处于国际同类研究先进水平。获国家发明专利授权10项。发表学术论文100余篇，其中被SCI、EI检索60余篇，出版专著1部，部分成果已在化工、矿冶、材料、环保和石油等行业推广应用。

一作作者：赖金龙博士，西南科技大学环境与资源学院博士研究生，专注于污染环境生物效应与修复方向，对于植物的抗逆研究与环境污染方面有丰富的研究理论知识，善于将组学技术与课题研究相结合，探讨研究机制机理。

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