50W+条代谢物一键搜索 | 国内首个免费功能代谢组网站平台FunMeta全新上线！

近年来“功能代谢组学”一直是代谢组学研究的热门领域，了解代谢物的作用和功能对于理解化学、生物化学、分子生物学和生物学的许多领域至关重要。

一方面，代谢物在信号传导、通讯、能量产生、新陈代谢、分解代谢和合成代谢中发挥着关键作用，包括大分子（DNA、RNA、蛋白质、脂质）、细胞和组织的组装和合成等；

另一方面，代谢物的应用广泛，代谢物或者合成化合物不仅可以用作药物、毒药、营养素、生物标志物和废物，还可用作调味剂、气味剂、着色剂、驱虫剂、催化剂、缓冲剂、稳定剂、抗氧化剂和絮凝剂等多种功能。同样，了解食品、化妆品、药物、环境和我们自己身体中化学物质的来源，以及它们如何影响我们自己和其他生物体，对生命科学研究者有重要意义。

然而，关于代谢物的功能效应、生物过程、作用或来源的信息，目前还鲜有网站提供，这意味着代谢物相关大量重要的生化知识难以访问。出于此目的，鹿明生物推出了国内首个功能代谢组学网站平台Functional Metabolomics (FunMeta)，可以通过链接 http://funmeta.oebiotech.cn/ 快速访问，目前完全开放，无需登陆！

FunMeta致力于快速发现和探索功能代谢组学信息，当前版本1.0从KEGG, HMDB, LipidMaps, Metlin, PubChem 等权威资源整合了50W+条代谢物记录，包括通路、疾病、功能、OMIM、位置和酶等信息。同时，网站内嵌了国际疾病分类系统 ICD11 来查看疾病的分类及详细信息，还提供了多种快速检索和代谢物-疾病网络分析工具。

FunMeta1.0中主要包括六个功能模块：

（1） Pathway 代谢物相关的代谢通路

（2） Disease 代谢物相关的疾病

（3） Ontology 代谢物的功能，生理效应

（4） Enzyme 代谢物相关的酶

（5） Location 代谢物存在于生物体的位置

（6） OMIM 代谢物关联的OMIM链接

FunMeta的三大搜索引擎和分析模块

FunMeta当前支持从不同方面切入代谢功能网络，目前包括代谢物、通路和疾病：

（1） 代谢物搜索：支持以代谢物的名称、分子式以及公共库的ID作为输入，来切入代谢功能网络

（2） 通路搜索：支持以通路名称和通路ID作为输入，检索通路相关的代谢物、酶、药物和参考文献等

（3） 疾病搜索：以疾病名称作为输入，检索疾病相关的疾病分类、代谢物、文献和生理效应等。

（4） 代谢物-疾病互作网络分析：支持差异代谢物列表作为输入，来生成与疾病的相互作用网络，发现核心节点

http://funmeta.oebiotech.cn/

通过输入化合物名、分子式、SMILES、InChI、InChIKey等方式以及KEGG, HMDB, LipidMaps, Metlin, PubChem的ID编号来搜索化合物。

以代谢物Sphingosine-1-Phosphate为例，进入后的页面如下图。页面左边部分为代谢物的信息，包含代谢物名称和标识符、结构和属性、化学分类、描述信息等。页面右边部分为代谢物的功能网络，同时点击右边部分网络节点（疾病、酶、通路、功能、亚细胞定位信息等），点击后可查看对应信息。

右侧网络图展示代谢物的关联信息，Graph图上的每个节点都是可点击的，这里以点击通路为例，跳转到以下页面：

代谢物相关功能网络中的其他功能模块，包括疾病、功能、酶、位置和OMIM，类似于通路模块，提供了便捷的详情链接和外部超链接，详情页如下：

代谢物关联的疾病信息

代谢物关联的功能信息

代谢物关联的酶信息

代谢物关联的位置信息

代谢物关联的OMIM信息

http://funmeta.oebiotech.cn/metDiseaseNetworkAnalysis

在化合物ID类型一栏，可以选择搜索的识别符，支持HMDB ID、KEGG ID（KEGG compound编号，即C number）、PubChem ID、Comound Name、cid查询。注：对于没有其它ID注释的，建议可以使用注释更全的cid编号（鹿明自建FunMeta库）查询。

例如想查询以下20个化合物的疾病网络，将HMDB ID输入搜索框，点击search -> Network Analysis！

输入差异代谢物id页面

 查询到的代谢物信息页面

 网络分析结果页面

 支持核心网络高亮突出显示

其中红色的圆圈代表代谢物，蓝色的方形代表疾病，节点的大小由degree决定。除此之外，网络中的代谢物和疾病节点都是可点击的，能快速跳转到其详情页面。

引人国际疾病分类系统,用于快速检索和查看疾病的分类和详细信息。

以上是功能代谢网站FunMeta v1.0版本的主要内容，具体的分析和功能还请感兴趣的小伙伴自行探索，当然如果有任何问题或建议，请通过公众号或添加微信：17317724501 为您安排专业人员解答哦！未来，我们将对FunMeta进一步更新，已提供更全面、更有价值的功能和服务。