CNS级生信分析 | 代谢报告全新升级:9大模块,56项内容,内外兼修,丰富美观全都有!

2023-08-16 15:39:43, 质谱创新组学 上海欧易生物医学科技有限公司



来了来了他来了,小鹿带着2023年代谢组学全新更新到来了!宝剑锋从磨砺出,梅花香自苦寒来,经过精心打磨雕琢、鹿明生物最新的代谢组学报告终于来到了大家面前。



此次升级参考近年《Cell》、《Nature》等权威学术杂志,综合鹿明生物客户们的需求与建议,我们将报告由内而外精心打磨进行了全面的更新升级,包括优化数据预处理、多方位数据质控、多元功能富集分析、多样数据可视化,给客户更加直接全面的分析结果。


在本次报告更新中我们增加和升级了“亿些些”新内容,可谓是改头换面,截然不同。本次升级后报告重点共有9大模块,56项分析内容,涉及3个定性数据库更新,增加1个功能代谢组学重磅内容!


更加丰富的内容、更加美观的图片?小孩子才做选择,小鹿全都要!



接下来就让小鹿带大家看看最重要的7大重点升级内容吧!


见微知著
项目内容概括呈现!
01


此次新增了数据统计模块,在第一部分系统直观以饼图和柱状图的形式展示代谢物的分类情况和差异筛选标准及结果。

厚积薄发
鹿明自建库LuMet重磅更新
02


秉承硬数据好服务理念,此次更新中,我们在数据库搜库和代谢物注释上都进行了丰富、不仅提供了HMDB、Metlin、Lipidmaps、KEGG、chEBI、PubChem、CAS、InChikey、SuperClass、Class、Subclass等各大数据库注释内容。同时为大家带来了鹿明生物精心打造的最新数据库!LuMet系列!
 
LuMet数据库是鹿明生物代谢组学自建库总库的简称,其由动物源性本地数据库及植物源性本地数据库、中药本地数据库、空间代谢组本地数据库四大模块组成。LuMet数据库中含数万自建动物源性、植物源性标准品,数万种中药代谢产物解析数据库,为广大科研工作者提供稳定可靠的代谢物鉴定解析服务!鹿明自建库介绍如下:
 
  • LuMet-Animal: 动物源代谢物质谱数据库,总库容量15000+;其中包括2500+标准品以及8000+基于标准品构建预测模型扩建的本地数据库。

  • LuMet-Plant: 植物源代谢物质谱数据库,总库容量20000+;其中包括5000+标准品、5000+基于标准品构建预测模型扩建的本地数据库以及14000+公共库。

  • LuMet-CM: 中药代谢组质谱数据库,总库容量39000+其中包括5000余种中药标准品、14000余种经过人工核对的中药活性成分结构库及20000余种基于中药标准品体外孵育产生的中药代谢产物。

  • LuMet-Space:空间代谢数据库LuMet-Space,总库容量(含动植物源性)30000+,同时含中药源性物质,涵盖中国药典及其他常见且重要的中药材1000余种。

后续还有更多数据库更新,敬请期待哦!


砥砺前行
新增功能代谢组学分析!
03


近年来“功能代谢组学”一直是代谢组学研究的热门领域,了解代谢物的作用和功能对于理解化学、生物化学、分子生物学和生物学的许多领域至关重要。一方面,代谢物在信号传导、通讯、能量产生、新陈代谢、分解代谢和合成代谢中发挥着关键作用,包括大分子(DNA、RNA、脂质)、细胞和组织的组装和合成等;另一方面,代谢物/合成化学品还可以作为药物、毒药、营养素、生物标志物、废物、调味剂、气味剂、着色剂或染料、驱虫剂、催化剂、缓冲剂、稳定剂、抗氧化剂和絮凝剂等。同样,了解食品、化妆品、药物、环境和我们自己身体中化学物质的来源,以及它们如何影响我们自己和其他生物体,对于任何从事生命科学研究的人来说都是非常感兴趣的。然而,关于代谢物的功能效应、生物过程、作用或来源的信息,目前还鲜有网站提供,这意味着代谢物相关大量重要的生化知识难以访问。


出于此目的,鹿明生物推出了国内首个功能代谢组学网站平台Functional Metabolomics(FunMeta),可复制链接打开:http://funmeta.oebiotech.cn/


网站目前完全开放,无需登陆!FunMeta致力于快速发现和探索功能代谢组学信息,当前版本1.0从KEGG, HMDB, LipidMaps, Metlin, PubChem 等权威资源整合了50W+条代谢物记录,包括通路、疾病、功能、OMIM、位置和酶等信息。同时,网站内嵌了国际疾病分类系统 ICD11 来查看疾病的分类及详细信息,还提供了多种快速检索和代谢物-疾病网络分析工具。



功能代谢组学网站介绍和使用详情,感兴趣的老师可以查看我们的另一篇专业推文:50W+条代谢物一键搜索 | 国内首个免费功能代谢组网站平台FunMeta全新上线!


精益求精
质控内容全面把控!
04


硬数据好服务,从实验端开始鹿明就秉承高标准的样本制备和实验质控体系,在此次报告升级中,我们对质控样本的可视化分析内容进行了优化和调整,从多个维度进行展示,以保证提供给客户最客观、真实、高标准的数据。


 

美轮美奂
可视化分析内容再度升级!
05


此次更新中,我们参考近年《Cell》、《Nature》等权威学术杂志,不仅丰富了分析内容,还对报告中的可视化分析结果进行了美化!



功能富集
开拓创新锦上添花!
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本次更新在通路富集模块新增Reactome富集分析、研究人、大小鼠的老师们有福了!同时对于KEGG富集和Reactome富集、我们提供了更多的分析内容和更加美观的可视化图片!



研究热点
紧跟研究热点GSEA,拓展功能分析!
07

以上仅对本次升级的部分内容做简单展示,我们将持续关注老师需求与研究现状,不断进行升级优化,提供更加多样化的分析结果!想要体验的老师快快联系您的销售工程师,或者添加微信:17317724501 为您安排人员解答哦!



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文末看点lumingbio


上海鹿明生物科技有限公司是欧易生物旗下从事蛋白质组代谢组质谱检测专业质谱组学服务公司。公司建有空间代谢组商业服务平台,深耕质谱组学检测分析,具体包括空间代谢组、双平台代谢组、靶向代谢组、TMT标记定量蛋白组、翻译后修饰蛋白组、4D-DIA蛋白组、单细胞及超微量蛋白组、空间蛋白组等。创新质谱组学平台广泛应用于机制解析、分型诊断、标志物筛选、药靶发掘等多个领域。公司并先后获得高新技术企业、上海市专精特新企业并建有院士专家工作站,自有包括tims tof pro2在内的各类大型质谱近二十台套,年服务项目超2000项。鹿明生物协助合作伙伴发表SCI论文近千篇,成功打造以硬数据、好服务为基础,以空间代谢组为特色的质谱组学检测服务公司品牌。



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NA 撰文

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本文系鹿明生物

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