中药入血成分分析经典研究案例 | 教你写好成分分析文章

2023-08-10 15:39:40, 质谱创新组学 上海欧易生物医学科技有限公司




01
研究背景


中药疗效确切、安全性高、副作用小,其多成分多靶点的作用特点已被广泛接受。研究表明中药原型入血成分和代谢产物均可能是有效活性成分,因此越来越多的中药科研工作者展开了对中药入血成分的分析研究。但据笔者了解,很多研究者并不清楚如何利用自己的研究数据去写好相关的文章。为此,本期鹿明生物小编为大家整理了一篇:可以教大家写好一篇中药入血成分分析类型文章的完美案例推文,以供大家参考。


02
前言


2022年08月,吉林延边大学药学院郑教授课题组在Food Research International期刊IF:7.452发表的题为 “Comprehensive characterization of the chemical composition of Lurongdabu decoction and its absorbed prototypes and metabolites in rat plasma using UHPLC–Q Exactive Orbitrap–HRMS的研究成果,通过高灵敏度的UPLC-HRMS的研究方法来准确地识别“鹿茸大补汤(LRDBD)”的物质基础,鉴定了122种成分,其中在血浆中鉴定出29种原型入血成分和35种代谢产物。为进一步发现潜在的药物靶点和揭示LRDBD在哮喘治疗中的作用机制提供了基础数据和方法。



03
研究思路

 


04
研究方法


研究材料

(1) 标品:标准物质,包括甜菜碱、鸟嘌呤、腺苷、(+)-儿茶素、苦杏仁苷、柚皮素和薯蓣皂苷,均购自成都普斯生物科技有限公司(中国四川)。DL-哌啶酸、L-(-)-苹果酸、次黄嘌呤、尿苷、2′-脱氧核苷、异亮氨酸、(-)-epicatechin、d-酪氨酸、d-脯氨酸、d-组氨酸和甲酸盐(纯度≥98%)购自阿拉丁试剂有限公司(上海);

(2) 生药水提物:LRDBD水提物;8种单味草药水提物;

(3) 血浆样本:LRDBD给药组(14只大鼠),生理盐水组(8只)。


研究技术

(1) 采集/数据处理:UHPLC–Q Exactive Orbitrap–HRMS 液质联用技术,QI软件/CD软件;

(2) 数据分析:PCA、火山图;

(3)数据库:mzCloudTM、mzVault、TCM、TCMSP、TCMIP数据库匹配。


05
研究结果


1、LRDBD主要成分鉴定122种

 

LRDBD的含量采用高分辨率质谱法进行分析对每个峰对应的化合物进行了初步鉴定。具体的鉴定步骤如下。首先,根据TCMSP和TCMIP建立8种单一草药的化学成分数据库。然后,使用CD筛选平台对MS数据进行处理和分析,结合在线(mzCloud、mzVault),以匹配片段信息并识别化合物结构。然后,根据准一级精确质量和二级碎片(匹配分数大于85,误差小于5.0 ppm)鉴定。图1显示了LRDBD在正离子和负离子模式下的UHPLC-MS基峰强度(BPI)色谱图谱。


此外,利用HMDB数据库和ChemDraw Pro对异构体的分化进行了补充。基于上述鉴定策略,初步鉴定了LRDBD的122种化合物(详细信息见表1),包括氨基酸、哌啶生物碱、季铵生物碱、有机胺生物碱、有机胺生物碱、苯丙类、嘌呤生物碱、黄酮、脂肪酸及其衍生物、香豆素、氰藻苷、茚生物碱、甾体、同异黄酮等。


1 通过UHPLC-HRMS分析得到的LRDBD的

基峰强度(BPI)色谱图

A: 正离子扫描,B:负离子扫描


表1利用UHPLC–Q Exactive Orbitrap–HRMS鉴定LRDBD的化学成分。

a通过与标准品比较确定;b鹿角绒;c盾叶薯蓣;d苦艾;e麻黄;f杏仁仁;g麦冬;h芦笋;i五味子的煎煮过程中产生的新成分


1.1对LRDBD主要成分进行来源归属

使用UHPLC–Q Exactive Orbitrap–HRMS对八种单一草药煎剂进行分析。然后LRDBD化合物的相对来源也得到了证实。8种单药草在正、负离子模式下的BPI色谱图见图2。

图2  用UHPLC-HRMS分析获得的8种单一草药的BPI色谱图


1.2对LRDBD主要成分进行标品比对确认

根据保留时间、一级分子量的准确测定,以及MS2片段(二级碎片)与标准品的比较结果,准确鉴定了LRDBD中的17个化合物(见图3)。

图3 基于与参考标准品比较的化合物鉴定


1.3对LRDBD122种化学成分进行结构明确


为了明确所鉴定122种化合物的结构,图4展现了鉴定的化合物的主要结构分类:图4显示了主要成分的化学结构分类。根据取代基的不同,鉴定出10种氨基酸、1种哌啶生物碱、2种季铵生物碱、6种有机胺生物碱、3种苯丙烷类、8种嘌呤生物碱、14种黄酮类化合物、17种脂肪酸化合物及其衍生物、3种香豆素类、2种氰基糖苷、2种吲哚生物碱、5种类固醇和2种同源异黄酮。


图4在LRDBD中鉴定的主要成分的化学结构


另外,还鉴定出了其他43种化合物,如图5所示。包括氨基酸、生物碱、苯丙素、氰磷酸糖苷、黄酮类化合物、脂肪酸及其衍生物。


图5 在LRDBD中鉴定出的其他化合物的化学结构


2、LRDBD中不同成分类型的化合物鉴定过程进行推导

通过对CD数据与参考文献的比较,对LRDBD中氨基酸、生物碱类、苯丙素类、糖苷类、黄酮类、脂肪酸及其衍生物、及其他化学成分类型的鉴定过程进行推导说明。质谱图见图6,具体推导鉴定过程如下:


2.1氨基酸

通过对CD数据与参考文献的比较,鉴定出了13个氨基酸。峰27在m/z 182.08127处有一个伪分子离子,在m/z136.07570([M+H-COOH]+)和m/z119.04934([M+H-COOH-NH3]+)处产生主要离子。在羧基的中性损失后,m/z 182处的碎片离子在m/z 136处产生了一个碱基峰,表明存在一个羧基。在羧基的中性损失后,m/z 182处的碎片离子在m/z 136处产生了一个碱基峰,表明存在一个羧基,因此,峰27被分配为d-酪氨酸(图6-A)。

 

图6-A d-酪氨酸质谱图和化合物可能的破碎途径


2.2 生物碱类

在LRDBD中鉴定出36种生物碱,包括哌啶生物碱、季铵盐生物碱、有机胺生物碱、嘌呤生物碱和铟生物碱。通过与参考标准的比较,峰28被明确地指定为腺苷。腺苷的质谱和可能的片段途径如图6-B所示。

图6-B 腺苷质谱图和化合物可能的破碎途径


其余类型化合物推导及图见原文:doi: 10.1016/j.foodres.2022.111852.


3、LRDBD与单一草药的多因素统计分析:复方中存在23种单一草药中没有的新化合物

在使用CD软件对原始数据进行比对和去卷积后,去除QC样品中峰面积变化系数低于30%的背景离子和化合物,用于进一步的PCA主成分和火山图的多元分析。首先,PCA评分图突出了QC样品相对紧密的聚类,证实了样品的色谱分离和质谱分析在整个分析过程中都是稳定的,数据的准确性较好。然而,在LRDBD组和单药草组的PCA评分图中明显分离(图7-A)。

图7-A  从LRDBD和8种单一草药中提取的正、负离子模式下的化合物的PCA评分图


LRDBD和8种单一草药的分析结果被总结在一个维恩图中。如图7-B所示,LRDBD汤剂中存在23种新成分。由于相容性、加热等的影响,以及中药化学成分的复杂性,LRDBD在煎煮过程中由于溶液中化学成分的络合、水解、氧化或还原反应,可能产生新的成分。根据已知化合物,结合保留时间、m/z比和MS/MS片段信息,结合结构推断,23种新成分中鉴定出9种成分:奎宁酸、原花青素A2、多聚素、氧白藜芦醇、丙豆酸、18β-甘氨酸、2-羟丙基硬脂酸酯、单烯酸和化合物49。

图7-B  维恩图显示了在LRDBD和8种单一草本植物中鉴定出的和重叠的植物化学物质的数量


其他化合物由于缺乏标准无法完全鉴定,数据库中无法检索,需要进一步鉴定。建立并生成了一个火山模型,进一步表征了其显著性差异(图7-C)。P值小于0.001和FC大于3的变量表示与LRDBD中8种单一草药成分不同的化合物。

 

图7-C  8种不同单一草药在正负离子模式下提取的LRDBD化合物的差异分析


据此,筛选出了39种化合物。总的来说,LRDBD和8种不同的单一草药之间有39种化合物不同。该分析还反映了多种药物的多种成分之间复杂的相互作用,这不同于单一药物。其具体机制有待进一步研究。


4、大鼠血浆中鉴定了LRDBD的原型成分29个和代谢物35个

口服LRDBD 4天后,在不同时间采集大鼠血浆样本。我们将在所有时间点收集的血浆样本混合,以获得用于分析的剂量血浆。空白血浆和LRDBD分别作为阴性对照和阳性对照。提取的色谱峰,出现在给药的血浆中和LRDBD中,而不是空白血浆中,即被确定为吸收的原型成分。根据这一标准,通过将准确的质量和保留时间与LRDBD中识别的成分信息进行比较,来确定LRDBD的可吸收成分。利用CD平台上精确的精确质谱和串联质谱数据进行进一步确认。具体的识别过程如图8所示。

 

图8 进入血液中吸收的LRDBD成分的成分分析


此外,使用CD软件比较了给药血浆和空白血浆的质谱数据,以鉴定代谢物。在给药的血浆中检测到代谢物,但在空白血浆和LRDBD中没有检测到,并且具有与原型成分相同的离子片段。


4.1 鉴定被血液吸收的原型成分29种


根据提取离子色谱(EIC)函数,与LRDBD成分相比,鉴定出29种原型成分作为给药血浆中的吸收成分(表2)。此外,29个原型成分中有15个原型成分来自鹿茸,这与鹿茸是主要活性成分的SM理论相一致。所吸收的成分与LRDBD中的主要活性物质相对应。我们的研究结果为LRDBD的进一步研究提供了标志性化合物和方法参考。


表2 大鼠血浆中LRDBD的原型入血成分


4.2 35种代谢产物的鉴定

如表3所示,用CD软件对大鼠血浆中16种原型成分转化的35种代谢物进行了分析。主要发生I相代谢反应,如硝基还原、氧化脱氨为醇、去饱和、还原、水化、氧化、脱水、氧化脱氨为酮、去甲基化和II相代谢反应,如乙酰化、甲基化、硫酸化。


表3 大鼠血浆中LRDBD的代谢物


以M19为例,说明代谢物的鉴定过程。M19在m/z 119.08604处有一个前体离子[M+H]+,主要特征产物离子为m/z91.054[M+H−C2H2]+和m/z115.054[M+H−H4] +。M19的前体离子比麻黄碱小47 Da,如图9-A所示,M19的特征片段与麻黄碱相似。根据M19的相关质谱裂解行为,推导是麻黄碱去饱和+硝基还原的代谢物。此外,比较M35与硬脂酰胺的精确分子量,质谱结果表明,m/z57.071[m+H- C15H30NO]+为碎片离子,与硬脂酰胺的碎片离子一致。因此,M35是硬脂酰胺的II相代谢物(图9-B)。其他的代谢物也以类似的方式被鉴定出来。

 

图9 LRDBD中原型化合物的碎片离子


06
研究结论


1、本研究建立了高灵敏度、高分辨率的UHPLC--HRMS法测定LRDBD的物质基础,并将煎煮后的LRDBD与8种单药的成分进行比较。


2、在LRDBD中鉴定出122种化合物,包括氨基酸、苯丙素、生物碱、黄酮、脂肪酸化合物及其衍生物、黄酮类等。这是第一次对LRDBD的化学成分进行了全面的表征。


3、在LRDBD中检测到23种新成分是8种单药中不存在的,可能是煎煮过程中药物之间的化学成分相互作用。此外,统计分析LRDBD和8种单一药草之间有39种化合物不同。这一结果也反映了多种药物的多种成分之间复杂的相互作用,不同于单一药物。


4、大鼠血浆中鉴定出29种LRDBD的原型成分和35种代谢物。去饱和、还原、水化、氧化、脱水、去甲基化、乙酰化、甲基化和硫酸盐化是主要的代谢途径。其中,鹿茸原型成分15种,在血浆中所占比例最大。上述结果与SM理论:鹿茸在哮喘治疗中起主要作用相一致。本研究将有助于对哮喘症状指导网络的药理分析,以及发现潜在的药物靶点,揭示LRDBD在哮喘治疗中的作用机制。


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1、这是一篇非常全面的对中药复方入血成分和代谢产物进行定性表征及研究阐述的文章。


2、全文无论从结构、研究方法、还是写作思路、结果阐述、化合物解析、结论描述等各方面,都可以作为一篇给绝大多数做中药复方药效机制研究、入血成分分析研究的科研工作者的一个非常棒的参考范例。

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参考文献:https://doi.org/10.1016/j.foodres.2022.111852


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文末看点lumingbio


上海鹿明生物科技有限公司是欧易生物旗下从事蛋白质组代谢组质谱检测专业质谱组学服务公司。公司建有空间代谢组商业服务平台,深耕质谱组学检测分析,具体包括空间代谢组、双平台代谢组、靶向代谢组、TMT标记定量蛋白组、翻译后修饰蛋白组、4D-DIA蛋白组、单细胞及超微量蛋白组、空间蛋白组等。创新质谱组学平台广泛应用于机制解析、分型诊断、标志物筛选、药靶发掘等多个领域。公司并先后获得高新技术企业、上海市专精特新企业并建有院士专家工作站,自有包括tims tof pro2在内的各类大型质谱近二十台套,年服务项目超2000项。鹿明生物协助合作伙伴发表SCI论文近千篇,成功打造以硬数据、好服务为基础,以空间代谢组为特色的质谱组学检测服务公司品牌。



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