2024-01-10 18:32:49, ACD/Labs 李丹 Advanced Chemistry Development, Inc. (ACD/Labs)
Absolv模块批量预测疏水性物质在有机溶剂里的溶解度
ACD/Labs 内有一个独特的Absolv计算模块。该模块是Abraham溶剂化参数的计算工具。而且其发明者Abraham教授还基于溶剂化参数工具建立了很多有机溶剂与水的分配模型方程式,并且也能计算水中的溶解度预测工具。因此,基于该功能可以直接推算目标物质在有机溶剂的溶解度。本文档主要描述了如何使用Percepta Absolv模块化合物在不同有机溶剂中溶解度的预测的计算步骤。
首先,打开Percepta,找到Equations。在Water-solvent partition下找到需要预测的有机溶剂,并点击该溶剂后对应的小图标,点亮后会变成。
在Solubility下把水溶解度的功能点亮。
在结构窗口中输入结构后,软件就会给出该结构在水中的溶解度及不同有机相和水相的分配系数。下图所示为,物质在甲醇,乙腈,DMSO和正辛醇中的分配系数,根据logSs=logSw+logP,可算出物质在不同有机相中的溶解度。
如需批量预测结构在有机相中的溶解度,则可以按以下操作进行。
在Data Source中点击New project,软件会自动创建一个My Project。
点击file>import,找到存储的结构文件上传,可以是SDfile结构库文件或批量的mol结构文件。
点击Calculate>properties, 在跳出的窗口中输入Equation,软件会自动找到已经被点亮的物质在有相机中的分配系数计算公式和水溶解度计算公式,全部添加到右边的窗口,点击ok,软件开始批量计算。
计算完成后用户可自定义公式,让软件批量自动计算在不同有机相中的溶解度。点击Expression,在跳出的窗口中点击Fields/Columns。
这里显示的内容与用户勾选的有机溶剂的Equation保持一致。例如,让软甲批量计算物质在甲醇中的溶解度,则可以双击logP(Methanol,d),添加到左边的窗口中。
再点击Functions>General Operators,双击+,添加到左边窗口中后再回到点击Fields/Columns,双击logSw(mol/L)。公式编辑完成后点ok。
在预测结构显示界面会多出来一栏,该栏显示的数值即为物质在有机相中的溶解度,用户可以双击Expression,在跳出的窗口中对该栏进行重命名。
重命名后的显示结果如下图所示。用户可以重复以上步骤,设定在其它有机相中的溶解度计算公式,让软件批量完成计算。
以上功能,可以基本满足分析部门对于难溶于水的物质的溶剂的计算化筛选。当然,对于合成部门进行后处理的溶剂的筛选方面软件一次计算80种溶剂的能力还有待开发,由于功能已经齐备,相信不久的将来就会有如此的功能可供快速计算和筛选。
使用Absov 模块计算疏水性的物质会较为准确,亲水性的物质(logD或者logP低于0)的化合物请慎用此功能。
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