水产专题 | 蛋白组+代谢组学探究斑马鱼、草鱼、牡蛎的相关机制研究，平均IF:8.7+

2022-01-21 01:17:45, 多层组学定制服务上海欧易生物医学科技有限公司

编者按

本期小鹿为各位看官盘点3篇经典的蛋白组学和代谢组学在水产动物中的研究。水产动物的研究不仅是保障我国海水养殖业的健康可持续发展，同时可为良种创制、海洋环境研究、生态研究等提供重要理论基础和技术支撑~因此在水产生物研究方面蛋白组学、代谢组学在其中起到什么作用呢？期望这3篇经典文章能给您思路~

代谢组学在农药联合暴露效应机制研究

中文标题：基于代谢组学分析的百菌清、多菌灵、咪鲜胺及其二元和三元混合物对斑马鱼胚胎和仔鱼的健康风险

研究对象：斑马鱼胚胎和仔鱼

发表期刊：Journal of Hazardous Materials

影响因子：10.588

运用生物技术：代谢组学环境毒理学

浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展，作者：杨桂玲，王彦华，李健，王豆，鲍志伟，王强（通讯作者），靳远详（共同通讯作者），在Journal of Hazardous Materials期刊发表的文章，通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。研究认为获得的数据可以为不同类型杀菌剂及其混合物对水生生物的毒性提供理论依据。

代谢组学分析是一个强有力的工具应用于环境毒理学，它可以表征环境化学品的代谢变化，从代谢组学分析中获得的数据为研究三种不同类型杀菌剂或其混合物对水生生物的作用机制提供重要信息。

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代谢组学在藻类毒性中研究

中文标题：新鲜藻类和腐烂藻类对淡水鱼的生物毒性：半数致死浓度、器官损伤和抗氧化反应

研究对象：草鱼，鲫鱼，鲢鱼

发表期刊：Journal of Hazardous Materials

影响因子：9.038

发表时间：2021年

合作单位：复旦大学环境科学与工程系

运用欧易/鹿明生物技术：LC-MS非靶代谢组学(由鹿明生物提供技术支持) 、16S rRNA测序(由欧易生物提供技术支持)

本文为2021年新鲜出炉的欧易/鹿明生物项目文章，由复旦大学环境科学与工程系郑正教授课题组在Journal of Hazardous Materials期刊发表的题为的研究成果，通过LC-MS非靶向代谢组学研究方法，检测了腐烂藻类溶液（RAS）的组成成分和其中的毒性物质，探究了富藻水体对鱼类的致死机理。通过16S rRNA测序，发现经新鲜藻类溶液（FAS）和腐烂藻类溶液（RAS）处理后鱼类肠道微生物多样性和丰度的显著差异，探讨了由微生物的差异导致肠道微生物的失衡，炎症、吸收功能障碍，甚至鱼类死亡等问题。该研究为藻类毒性的相关研究提供了依据。

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蛋白组学探究海洋与生态环境

中文标题：CO2诱导的海洋酸化损害了太平洋牡蛎对金氏弧菌的免疫功能:细胞和蛋白质组学的综合研究

研究对象：牡蛎

发表期刊：Science of the Total Environment

影响因子：6.551

合作单位：中国科学院海岸带研究所

运用欧易/鹿明生物技术：iTRAQ标记定量蛋白质组学（由鹿明生物提供技术支持）

本文为中国科学院海岸带研究所赵建民课题组在Science of the Total Environment期刊发表了的文章，通过iTRAQ标记定量蛋白质组学研究弧菌感染加剧了海洋酸化造成的牡蛎免疫抑制效应。海洋酸化可能增加海洋软体动物疾病加剧的风险。从而将产生重大的经济和生态影响，因此本研究结果具有重要的指导意义。

在本研究中，研究者将太平洋牡蛎暴露于酸化海水（约2000 ppm）中28天，然后用金氏弧菌进行感染处理，以此研究海洋酸化是否会影响牡蛎对病原菌感染的免疫反应。此外，利用基于iTRAQ的定量蛋白质组学方法，对牡蛎鳃这一潜在的造血部位进行了研究，以分析对OA和金氏弧菌共同作用较敏感的生理过程。

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小鹿嘚吧嘚

针对淡水及海洋生物的研究是产业发展的根本需要。从长远利益出发研究海洋及淡水动物不仅是针对最突出的品种问题—在基因组和蛋白、代谢组学水平可以全面解析海水养殖动植物基因组的结构与特征，明确重要经济性状的分子基础及基因调控网络。更是对未来提出良种分子设计做有效支撑。同时通过水产动物的研究来探究环境问题目前也是一个热点的研究方向。更多的研讨及获取以上文章原文，扫码添加小助力即可领取~