2023新品系列！代谢多组学联合分析全新上市，你想要的数据挖掘全都有！

多组学使得生命科学研究发生了革命性的变化，有助于加速人类对于生理病理过程的了解，从基因、转录、蛋白和代谢等多个水平进行全局性研究，同时还能够相互验证，减少单一组学分析的局限性和假阳性，有助于构建机体调控网络，深层次阐述各分子水平之间的调控关系及因果关系。因此，这种从部分到整体的研究思路也将是一种必然的趋势。

吉凯基因一直致力于提供远超行业常规标准的生信服务，为不断追求极致的用户体验，此次我们对代谢组+转录组/蛋白质组联合分析进行全新升级。自2023年5月24日起新签的代谢多组学合同，均可自动升级为2023年版最新代谢多组学生信分析套系!

究竟有哪些分析内容呢，跟着小编一起来看看吧。

1. TOP级期刊生信分析：远超行业常规交付标准，数据分析契合论文写作思路

通过阅读和整理近年来发表的代谢多组学文献思路，本套分析我们试图从“因”和“果”两个层面来探究生物学问题，实现从海量的数据中筛选出关键基因、代谢物及代谢通路，深度解析生理病理调控过程，解释生物过程的复杂性和整体性，以提升研究的完整性、广度和深度。

吉凯基因设计的此版联合分析报告内容提供多达18项分析内容，远超行业常规交付标准，且数据分析逻辑契合论文写作思路。

2. 多维度数据挖掘：KEGG直接关联&相关性间接关联分析，多角度挖掘重要基因和通路

在联合分析报告上，吉凯采用KEGG和相关性分析，从直接关联和间接关联两个维度，多角度挖掘重要基因和通路。代谢联合分析整体结果如下所示：

3. 全新的报告设计：干净整洁的网页界面，多重交互式体验报告

代谢多组学联合报告采用了全新的网页版设计，界面干净、整洁。右侧目录栏显示了报告的主体内容，点击主目录可展开其子目录，支持研究者随心所欲切换。同样，新版报告也内嵌了多重交互式体验，比如增加浮动显示窗，隐藏或展开分析结果，点击下拉按钮可切换分析结果以及网络图中的蛋白可任意拖动，让整个报告更加人性化、个性化。

在联合分析报告上，吉凯采用KEGG和相关性分析，从直接关联和间接关联两个维度，多角度挖掘重要基因和通路。本套报告究竟有哪些核心交付内容呢，一起跟小编来看看吧。

1. 两组学KEGG整合分析

KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，http://www.kegg.jp/）数据库将基因组信息和代谢物功能信息有机地结合了起来。通过对转录组分析得到的差异基因和代谢组分析得到的差异代谢物进行KEGG通路整合分析，从“因”和“果”两个层面来探究生物学问题，相互验证，有助于从海量的数据中确定关键变化的代谢通路，构建机体调控网络。

吉凯基因提供KEGG通路注释/富集比较、共有KEGG富集通路的可视化分析和共有富集通路完整信息表等多项分析内容。

1.1  KEGG通路注释/富集结果比较

对两组学差异分子KEGG注释和富集两部分结果，吉凯基因：

（1）以气泡图直观展示了各组学差异分子显著性富集到的通路信息。

（2）采用Venn分析来比较两组学KEGG通路注释/富集结果，直观展示两组学通路变化层面上的共性和特异性。

（3）以总差异数TOP10通路图对总差异分子数（差异基因数+差异代谢物数）最多的前10 条KEGG通路进行展示，以便帮助研究者了解本项目差异分子集中注释/富集到哪些异常通路上了。

（4）以共有TOP20通路图对共有通路中总差异分子数最多的前20条KEGG通路优先进行展示，以便帮助研究者了解本项目差异分子集中注释/富集到哪些共同异常的通路上了。

1.2 共有KEGG富集通路完整信息表

共有的富集通路中究竟涉及哪些差异分子，上下调变化趋势如何？这通常也是论文中需要展示的信息，为研究者核心关注。吉凯基因提供《共有KEGG富集通路完整信息表》，表格上整理了共有富集的KEGG通路名称、富集在这些通路中的差异基因和差异代谢物的差异表达信息，如差异变化倍数、差异变化显著性及差异变化趋势（上调或下调）等信息。表头示例如下所示。

1.3 共有KEGG富集通路的可视化分析

针对上述分析出的两组学共有KEGG富集通路，吉凯基因采用通路图、圈图、网络图和箱体图来展示差异基因和差异代谢物的通路归属信息、KEGG通路上的位置信息以及关键节点分子。

2. 两组学相关性分析

受限于组学技术检测能力上的限制和偏好性，可能会出现两组学KEGG关联不上或者关联上的通路较少的情况。此外，对于一些没有通路注释的代谢物和基因，如果单纯的依靠KEGG注释和富集分析，往往会漏掉这些关键的信息。但由于参与同一生物过程的基因或者代谢物往往表现出相同或相似的变化趋势，因此，可以利用相关性分析揭示基因和代谢物之间的调控机制。

本套代谢联合报告，吉凯基因对差异基因和差异代谢物在所有样本中的相对定量值进行相关性分析，计算基因-代谢物之间的相关性，并对显著性强相关的基因代谢物进行相关性热图、散点图、圈图和网络图等一系列可视化展示。结果示例如下所示。

3. 高级分析内容

除KEGG和相关性分析外，吉凯基因还提供多组学IPA功能模块分析、WCNA分析和两组学生物标志物分析。

3.1 IPA功能模块分析

Ingenuity Pathway Analysis（IPA数据库）是目前生命科学研究领域最可靠、最全面的功能研究数据库。吉凯基因购买了商业版的IPA软件，可以提供经典通路分析、疾病和功能分析、上游调控分析、调控效应分析和相互作用网络分析等5个模块的IPA分析服务内容，分析结果可直接用于论文中。

3.2 Metscape调控网络分析

MetScape是一个Cytoscape插件，该数据库集成了来自KEGG和EHMN的数据，用于在人体新陈代谢的背景下可视化和解释代谢组学和基因表达谱分析数据。通过MetScape软件构建差异基因与差异代谢物的互作网络图，追踪代谢物和基因之间的联系，可视化化合物网络并显示化合物结构以及反应类型、酶、基因和通路的信息。

3.3 两组学联合标志物筛选分析

随着高通量组学技术的发展，生物标志物的研究也开始从单一组学数据到多组学数据发展。已有多项临床研究表明，多组学标志物检测敏感性和特异性优于单一组学标志物，更精准的做法是在不同组学中同时捕捉肿瘤异常信号，把不同层次的组学信息互相补足，这才有可能通过模型构建实现更高的灵敏度和特异性。

以上为本次新版代谢联合分析报告的最主要的看点和分析内容。吉凯基因一直致力于提供远超行业常规标准的生信服务，为不断追求极致的用户体验，我们衷心的希望此次升级的2023年版代谢多组学联合分析可以助力科研用户数据挖掘更轻松。自2023年5月24日起新签的代谢多组学合同，均可自动升级为2023年版最新代谢多组学生信分析套系!有需要咨询的老师请联系吉凯当地业务员或者拨打客服热线4006210320，也可添加吉凯客服“jikaikefu”索取当地业务员联系方式。