2023新品系列！基于PaSER的下一代4D蛋白质组学，刷新蛋白质组服务新标准、新高度

吉凯自2019年引入timsTOF Pro系列高精尖质谱仪，便基于4D平台开发了一系列4D蛋白质组学服务。作为市面上第二家开展4D蛋白质组商业服务的公司，吉凯与布鲁克（Bruker）结成战略合作伙伴，成立了“4D+”计划（详情可点击：“4D+”时代开启！吉凯基因—布鲁克“4D+”计划启动暨合作实验室揭牌） ，旨在将前沿、优质的蛋白质组学技术不断引入临床科研服务中，提供更高标准、更高可重复的数据质量，真正让广大研究型医生的科研工作更省心、更省力、更高效。

此次吉凯基因再次对4D蛋白质组学平台进行全面升级，开发了基于PaSER^TM的下一代4D蛋白质组学服务，在传统4D蛋白质组学技术的基础上，引入了新的鉴定维度，助力蛋白质组学开启“5D”模式。基于PaSER^TM的下一代4D蛋白质组学在保持更严格的假阳性率（FDR）的情况下，能够大幅提高肽段和蛋白质鉴定数目，刷新了业内蛋白质组服务新标准、新高度。

传统4D蛋白质组学+PaSERTM搜库算法=下一代4D蛋白质组学

究竟有哪些技术亮点呢，一起来看一看吧。

PaSER^TM搜索引擎整合了蛋白质组学领域权威专家美国Scripps研究所的John Yates III教授（2019年ASMS质谱杰出贡献奖获得者）和德国柏林Charité医学院的Markus Ralser教授的最新科研成果，相关搜库算法曾经发表在Nature Methods和Journal of Proteomics等权威期刊上，可谓当今最前沿领先的搜库算法。

“PaSER”一词是由Scripps研究所的John Yates III教授和Robin Park博士创造的，由实时并行数据库搜索引擎（Parallel Database Search Engine in Real-time）英文单词的首字母缩写组成，是布鲁克收购John Yates III教授研发的IP2软件并在此基础上进行开发的一款基于完全基于GPU计算的软件，具有三大优势：

• PaSER^TM系统是一个并行数据库搜索引擎，可以“实时”搜索（Run and Done），即在数据采集完成后，科学家们就已经可以鉴定肽和蛋白质组。同时PaSER^TM可以智能化决定样本列队分析进程，每个样本采集结束时，通过将实验结果与预设的蛋白质或肽段鉴定数量标准比对，来决定样品队列继续与否，该功能可核验方法的适用性、节省稀有样本、昂贵耗材和机时。

•PaSER^TM整合了TIMScore^TM算法，支持dda-PASEF数据分析。该算法为布鲁克与John Yates教授共同开发，由机器学习驱动，可帮助研究者在极痕量水平上鉴定多肽并减少鉴定的模糊性（ambiguity）。TIMScore为第一个支持CCS数据库的搜索算法，并增加了蛋白质和肽段的鉴定量，并同时保持了FDR控制。

•PaSER^TM整合了CCS-enabled DIA-NN算法，支持dia-PASEF数据分析，该功能是由布鲁克与柏林Charité 医学院的Vadim Demichev博士和Markus Ralser博士合作开发。它也可以简化并加速蛋白质的鉴定，即使在非常短的梯度中，也可以很容易地定量数千种蛋白质。

PaSER^TM软件的相关搜库算法曾经发表在Nature Methods和Journal of Proteomics等权威期刊上，同时基于PaSER^TM的下一代4D蛋白质组也已有相关科研论文发表在Nature Communications、Cell Death and Disease和Journal of Proteome Research等期刊上，所以各位临床科研工作者可以放心选用。

官方曾经对日本Yasushi Ishihama实验室2021年发表的磷酸化蛋白质组学数据进行重新搜库，对比PaSER^TM和传统MaxQuant软件的性能差异，测试结果表明基于PaSER^TM的下一代4D蛋白质组搜库后蛋白鉴定量提升47%。

实测项目情况究竟如何呢，吉凯也进行了大量测试，测试结果如下。相比传统4D蛋白质组，吉凯基于PaSER^TM的下一代4D蛋白质组蛋白鉴定数提升30~180%不等，平均提升70%。各位临床科研工作者还在等什么呢？下一代4D蛋白质组学，毫无疑问是您最好的技术选择！

吉凯基于PaSER^TM的下一代4D蛋白质组搭配的是豪华的B plus套系分析内容，累计提供多达25项标准分析内容，远超行业常规交付标准，生信美图已协助多位客户发表高水平研究成果。Bplus套系内容，可点击往期报道查看：吉凯蛋白质组学报告再更新，6大亮点助力临床科研更省心、更省力、更高效。

吉凯基于PaSER^TM的下一代4D蛋白质组学可正式对外承接商业服务，下单请联系吉凯当地销售工程师或者拨打客服热线4006210320，也可微信添加吉凯客服“jikaikefu”进行咨询。更多新品详情，我们将于3月18日携手布鲁克（Bruker）在2023 EBC第八届易贸生物产业大会上发布！发布时间14:30，欢迎前来B091展台，届时将有更多现场讲解，并且还有丰富的礼品等您来拿！