创新卓越！高端质谱仪timsTOF Pro2助力吉凯4D蛋白质组『硬核』升级

4D 蛋白质组学在传统3D保留时间（retention time）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度分离基础之上增加了第四维离子淌度（mobility）的分离，实现了临床蛋白质组学在鉴定准度、鉴定深度、定量准确性、检测周期等性能上全面提升。

一直以来吉凯质谱平台致力于为临床科研用户提供一流的质谱检测服务，自2020年购买timsTOF Pro质谱仪以来，开发了4D label free，4D-DIA，4D修饰以及4D-PRM等多款重量级产品。随着最新型号timsTOF Pro2的发布，吉凯4D蛋白质组也随之更新，开启timsTOF Pro2新模式！

相比于timsTOF Pro，timsTOF Pro 2 配备了最新一代双TIMS分析器，离子容量可提高三倍，最大限度地提高了离子传输效率和灵敏度，让蛋白质组学分析再上一个新的台阶。CCS 值的加入让组学结果更精准，也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具。

1. 更低的样本量要求：助力微量样本蛋白组分析

随着某些特定细胞、少量细胞群或生物穿刺样本的生物研究越来越重要，低样本量蛋白组定量变得至关重要。而如此低的样本量对于质谱灵敏度提出了很高要求。使用高灵敏度的质谱仪对如此低的样本量进行原型定量至关重要。

基于dda-PASEF方法，timsTOF Pro 2 在30分钟梯度下对20 ng HeLa检测到4200多个蛋白质组和近30000个肽。

2. 高深度检测：助力更多肽段和蛋白的鉴定

基于dia-PASEF方法，timsTOF Pro 2 单针检测200ng HEK酶切样本，在60分钟梯度能够鉴定7000多个蛋白质组和60000多个肽。

3. 高扫描速度：助力临床大队列项目研究

由 PASEF驱动的 timsTOF Pro 2 可以实现超过 100 Hz 的扫描速度，而不会损失灵敏度和分辨率。将timsTOF Pro 2 和Evosep One的强大组合应用于COVID-19感染患者血清蛋白质组学研究，基于PASEF和Evosep 60样本/天的数据采集方法，从720个患者样本中定量了310±18个蛋白质，包括70多个潜在的生物标志物，涵盖了五个数量级的蛋白质丰度，为分析大队列研究提供了宝贵视角。

 4. 高可信度：助力蛋白质组鉴定更准确

TIMS 分离提高了选择性，而且可以将单电荷母离子排除掉，从而降低本底噪音干扰。在 LC-MS/MS分析中， dia-PASEF 能够采集包含 m/z，离子淌度值（ CCS ），保留时间和离子强度的 4D 数据，比传统的 DIA 方法有更高灵敏度和选择性，提升了传统DIA检测结果的可信度。

5. 高灵敏度磷酸化蛋白组学分析和同分异构体分离：助力修饰蛋白组分析

当肽段在色谱上发生共洗脱时，由于等重性和信号重合，不能测量 CCS 值的传统蛋白质组学是不能实现磷酸化肽异构体的定量的。PASEF 技术使得基于 TiO2 富集时，使用 150 ug 蛋白富集起始量就能够鉴定 27768 个磷酸化肽，展现了淌度偏离质量对齐（ MOMA ）的优点。1946 条鉴定的共洗脱异构体中，20% 的异构体可以被TIMS 完全分离，这可以使得我们可以更好地理解邻位蛋白磷酸化位点信息。