空代科研思路解析|基础篇：空间代谢组+差异分析发5~6分SCI，竟有这等容易的事？

近几年，空间组学（Spatial omics）的热度与日俱增，“引爆”科研界。自2020年，空间转录组技术被《Nature Methods》评为年度技术方法之后，在2021年大量科学家先后报道了该技术在不同领域重大突破和发现。2022年空间多组学技术又上榜《Nature》年度关注的七大榜单技术。同时，在国内外空间组学会议频率增加、新技术与新仪器应运而生、文章发表逐年递增。

得益于质谱仪器成像分辨率和检测灵敏度的提高，空间代谢组学技术已从实验室技术走向了成熟的商业化服务。空间代谢组学（Spatial Metabolomics）整合了质谱成像和代谢组学技术，是一种可对生物组织中代谢物的种类、含量和空间分布进行精准测定的技术，可从生物组织原位发现差异代谢物，并识别其生物学功能。这一技术突破了传统代谢组学信息维度不足的缺点，将组学信息拓展到了空间二维水平，极大地提升了对样品信息的认知。

简单来说空间代谢组学技术是常规代谢组学技术的升级版，同样可以应用于肿瘤代谢、分子病理诊断、分子机制研究和药物代谢组等医学研究领域，可以单组学发文，也可以和其他组学联合。文章写作思路如下所示：

今天跟着小编来了解入门级简单好上手的空代应用思路——空间代谢组学检测+差异分析这套科研思路吧。

文献题目：Spatial differentiation of metabolism in prostate cancer tissue by MALDI-TOF MSI

•IF：5.146

•发表时间：2021年1月29日

•团队：挪威特隆赫姆大学医院圣奥拉夫医院的研究团队

• 技术平台：质谱成像空间代谢组学

研究背景：前列腺组织样本的组成高度不均一，包含正常上皮、增生、基质和癌症的混合物。质谱成像（MSI）可以对组织切片不同区域中的潜在癌症标志物进行空间检测，有利于分析和比较不同组织类型的代谢组和脂质组学特征，了解每种组织类型特有的分子过程可以为研究癌症的分子机制提供新的、具有临床意义的见解。

实验设计：收集了15名前列腺癌患者共计45份新鲜冷冻组织核心样本，安装在氧化铟锡 (ITO) 涂层的载玻片，分别使用正负离子模式进行空间代谢组（MALDI-TOF MSI）测量。

实验流程：

实验结论：成功鉴定了27种代谢物和44种脂质，发现NCE（非癌上皮细胞）、基质细胞和癌症组织代谢存在明显差异。癌症、非癌上皮和基质的配对比较揭示了组织类型之间的一些代谢差异。我们检测到癌症中对脂质代谢至关重要的代谢物水平增加，包括肉碱穿梭物中的代谢产物，它促进脂肪酸氧化，以及脂质合成所需的构建块。与健康前列腺功能相关的代谢产物，包括柠檬酸盐、天冬氨酸、锌和精胺，在癌症中的水平低于非癌上皮。基质分析显示，与癌症和非癌上皮相比，重要能量代谢产物（如ADP、ATP和葡萄糖）的水平较高，抗氧化牛磺酸的水平较高。

文献题目：In situ metabolic profile and spatial distribution of ocular tissues: New insights into dry eye disease

• IF：6.268

• 发表时间：2022年1月3日

• 团队：中国人民解放军总医院王丽强主任医师团队

• 技术平台：质谱成像空间代谢组学

研究背景：干眼病（DED）是一种影响数百万人的慢性多因素疾病，其发病机制尚不清楚。基质辅助激光解吸电离质谱成像（MALDI-MSI）是一种结合高通量质谱和分子成像的新型原位可视化方法。旨在通过MALDI-MSI探索原位眼部代谢变化，以加速对DED发病机制的认识。

实验设计：两组雌性小鼠，对照组（Con）和干眼症组（DED），使用空间代谢组学技术（MALDI-MSI）对5种眼组织样本进行测量。

实验流程：

实验结论：空间代谢组分析了正常眼组织和干眼症之间特定眼部区域（中央角膜、周边角膜、穹窿结膜、眼睑结膜和房水）的代谢物，并鉴定了与DED相关的代谢物，具有相对丰度和空间特征的信息。此外，综合途径分析表明，在干眼症组织的某些区域，甘油磷脂、鞘脂苯丙氨酸以及甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸的代谢等几种代谢途径发生了显著变化。研究为进一步了解干眼症的病理生理机制提供了新的见解和线索，并为早期的个性化临床干预奠定了基础。

看完以上介绍，各位老师是不是也觉得空代还是很好用的。吉凯基因可以提供空间代谢组学服务，有需要的老师请联系吉凯当地业务员或者拨打客服热线4006210320，也可添加吉凯客服“jikaikefu”索取当地业务员联系方式。