高分文章的利器——翻译组测序（Ribo-seq）

翻译组测序是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序，来准确获取样本中所有可翻译分子（包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA、circRNA等）的信息与精确定量。

Ribo-seq (Ribosome profiling sequencing)是最常用的一种翻译组测序技术，该技术利用RNA酶消化细胞中的RNA，得到被核糖体保护的正在翻译的RNA片段（ribosome footprints, RFs），然后对这些被核糖体保护的30nt左右的RNA片段进行富集、深度测序、分析。可获得全基因组水平的蛋白翻译效率，发现新蛋白/短肽，翻译组测序可以和转录组数据联合计算RNA的翻译效率，可以蛋白组的数据联合，通过分析瞬时翻译与蛋白累积的关系，分析蛋白的降解效应；翻译组测序是连接RNA和蛋白的桥梁。翻译组测序可以研究细胞内基因翻译的水平、区域、速率等，结合转录组、小RNA测序、蛋白组等进行关联分析，可以更精确地研究转录后调控、翻译调控机制。

翻译组测序最初是在酿酒酵母中研究，后来慢慢在很多物种中都有研究，但是比较多的还是动物，人和小鼠研究最多，植物相对较少。

Nucleic Acids Research, 2018, Vol. 46     

rRNA的占比是Ribo-seq测序质量的一个关键指标，目前已发表的文章，甚至Cell上均显示rRNA占比较高，常规至少70%-80%，部分物种更是超过了90%，导致有效数据减少，数据利用效率降低，吉凯优势经过技术优化，大大降低了rRNA的占比。

部分项目数据

1. 了解转录本上的核糖体分布、翻译活性；

2. 推测翻译起始位点、ORF位置；

3. 确定蛋白翻译效率；

4. 探究翻译调控和基因表达情况；

5. 和ncRNA联合，鉴定具有翻译能力的ncRNA，如：LncRNA/circRNA等。