蛋白互作分析 | String网站使用方法简介

蛋白质互作网络（Protein-Protein Interaction Networks，PPI）是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成，来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。

String数据库（https://string-db.org/）是一个搜索已知蛋白质之间和预测蛋白质之间相互作用的数据库，该数据库可应用于五千多个物种，包含两千四百万种蛋白的，大于2000万种蛋白质之间的相互作用连接。

目前一般都采用String数据库来研究蛋白互作网络，那么下面来介绍一下这个数据库的基本使用方法。

1

查询与某一个蛋白间有互作关系的蛋白有哪些？

（1）首先，打开String网站，

（2）然后（例如输入小鼠蛋白Znf706），则可得到与该蛋白有互作关系的相关蛋白信息，

（3）

2

绘制蛋白与蛋白间PPI图。

（1）首先，打开String网站，

（2）

3

使用Cytoscape软件对PPI图进行美化。

目前String上的图可能不够满足发文个性化要求，因此会需要用Cytoscape软件进行图片美化，关于Cytoscape图片绘制方法，我们有绘制相关教程，需要的话，私信小鹿哦。

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文末看点｜lumingbio

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