硬数据,好服务——中药数据有多硬?服务好在哪里?

2023-08-07 15:25:44, 质谱创新组学 上海欧易生物医学科技有限公司






鹿明生物中药产品部


致中药科研工作者的一封信





大家好!

鹿明生物于2023年6月19号对中药组学研究平台做了正式的发布,很开心与大家正式见面,也很开心因此获得大家更多的认可和关注。在此,我谨代表鹿明中药研究平台向各位老师致以真诚感谢!


或许很多老师在听说我们的中药研究服务平台之后会好奇问:中药的数据库很多,鹿明为啥还要再花那么大的投入做中药数据库建设?鹿明生物的中药研究服务平台跟其它公司相比有啥特点?目前有很多开源的中药数据库,可以给广大的中药研究者提供不同维度的信息,比如:











一、精准数据库







1.Tasly-TCM中药数据库

https://cloud.tasly.com/#/tcm/home 

 

该数据库包含:48126个处方、9122种植物、34967种有效成分和13109个靶标,供用户查询中医的症状、处方、草药和成分。


2.  HERB数据库

http://herb.ac.cn/ 


该数据库包含:中药材7263、中药材有效成分49258、靶点12933、疾病28212种,并提供高通量实验和参考挖掘数据的浏览、搜索、查看、下载等功能。


3. TCMID中医药综合数据库

http://www.megabionet.org/tcmid/  


该数据库包含:47000个处方,8159个草药,25210个化合物,6828个药物,3791个疾病和17521个靶标,是广大中药科研工作者在物质基础研究中的常用数据库。

除了上述3个数据库,目前还有很多为方便中医药研究而建立的数据库。比如:

1、中药材数据库:由中国科学院中药资源中心提供,收录了5000多种中药材的信息,包括中药材的形态、化学成分、药理作用、临床应用等方面的内容。

2、中药方剂数据库:由中国中医科学院中药所提供,收录了2000多种中药方剂的信息,包括方剂的组成、功效、用法用量等方面的内容。

3、中药化学成分数据库:由中国药科大学提供,收录了2000多种中药的化学成分信息,包括化学结构、分子量、药理作用等方面的内容。

4、中药药理数据库:由中国中医科学院中药所提供,收录了中药的药理作用、机制、临床应用等方面的信息。

5、中药临床应用数据库:由中国中医科学院中药所提供,收录了中药在临床应用中的效果、用法用量、不良反应等方面的信息。

6、中药质量标准数据库:由国家药典委员会提供,收录了中药的质量标准、检测方法、评价标准等方面的信息。


既然已经有这么多好的数据库,那我们鹿明生物为什么要不遗余力的打造一个本地标品数据库呢?是为了能够对中药物质基础进行准确鉴定!前这些公共数据库存在两个问题:


1.仅有化合物的一级分子量、二级碎片两个维度信息,有些甚至没有真实的二级信息。中药成分极其复杂,同分异构体,糖苷和苷元普遍同时存在,如果不引入标品的保留时间信息,仅靠一级分子量和二级质谱碎片信息是无法准确定性的,况且公共数据库中的二级信息可能还来源不同的质谱型号,不同的质谱参数,这些都会导致质谱的二级碎片谱图杂乱,数据质量无法保证;


2. 公开数据库缺乏中药代谢产物的信息。众所周知代谢产物也很可能是发挥药效的活性成分,但目前还没有针对中药代谢产物的数据库。以上种种限制了对于中药有效成分分析,活性物质筛选、药理作用机制的物质基础等方面的研究,也远远够不上应用的需要。

因此,为了打破传统模式数据库壁垒,建立新型数据库范式,更好的解决中药基础研究中最重要的问题——准确性。鹿明生物以标准品为核心构建了三大类型特色数据库,从四个维度(保留时间、一级精确分子量、二级碎片、同位素峰)保证对中药化学成分的准确定性,可以实现一针检测分析,通过同时搜索不同本地数据库,达到分析鉴定中药单体和复方的入血或入靶活性成分和代谢产物的目的,为中药物质基础的研究工作多方位保驾护航。


以上3大类数据库提供:保留时间、一级精确质量(理论、实测、误差ppm)、二级质谱碎片(特征碎片结构注释)、成分分类、成分药材来源信息、分子式、分子量误差、CAS号、KEGG号、InChIKey、标品货号、厂家等信息,方便中药成分的精准注释与相对定量分析。


虽然我们不是第一家以标准品打造中药数据库的公司!但我们一定是目前唯一一家不计成本打造中药化学成分全标品数据库的公司!



所有自建库均为:实际购买标准品在自已仪器上建立本地自建库,非外买库。且样本实际检测所用液相、色谱柱、质谱仪、参数与数据库建立时完全一致,有效保证样本检测结果与自建数据库图谱的可比性!!确保定性结果准!准!准!

所以我们的数据硬,硬在真实自建的数据库本身。除了信息全面扎实的数据库,我们有高精密度灵敏度高分辨率的仪器检测和采集平台,辅以自研软件和算法,实现数据结果高质量稳定输出。



现在来回答大家的第二个问题:鹿明生物的中药研究服务平台的特点是什么?




二、为什么我们做得更好?










1、我们的核心优势


2、涵盖6大检测分析服务

基于核心数据库结合仪器平台与自研软件及算法,我们实现中药研究的6大检测分析服务内容,可助力中药现代化研究方向。



3省钱、省力、省心

基于产品质量优势的保障,鹿明中药研究平台能够实现三省:省钱、省力、省心!



我们的服务好,好在分析内容好,分析质量好好在完整的检测服务体系和完备的售后解决体系。


虽然鹿明中药组学研究平台推出不久,但服务内容扎实可靠。鹿明生物的中药检测服务质量在同行中有绝对优势,实在是因为害怕广大研究者不了解,走了弯路,所以写了这一篇不长不短的推文,以供大家交流参考。


祝大家在今后的科研和工作中顺顺利利!!!


此致!
















关于鹿明生物中药创新组学平台的更多介绍,可通过下方视频了解哟~

注:文章解释权归鹿明生物所有。如有任何疑问或想法请通过官方渠道联系鹿明生物哦!


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文末看点lumingbio


上海鹿明生物科技有限公司是欧易生物旗下从事蛋白质组代谢组质谱检测专业质谱组学服务公司。公司建有空间代谢组商业服务平台,深耕质谱组学检测分析,具体包括空间代谢组、双平台代谢组、靶向代谢组、TMT标记定量蛋白组、翻译后修饰蛋白组、4D-DIA蛋白组、单细胞及超微量蛋白组、空间蛋白组等。创新质谱组学平台广泛应用于机制解析、分型诊断、标志物筛选、药靶发掘等多个领域。公司并先后获得高新技术企业、上海市专精特新企业并建有院士专家工作站,自有包括tims tof pro2在内的各类大型质谱近二十台套,年服务项目超2000项。鹿明生物协助合作伙伴发表SCI论文近千篇,成功打造以硬数据、好服务为基础,以空间代谢组为特色的质谱组学检测服务公司品牌。



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