免疫肽组学“闪电来袭”,免疫肽专属质谱采集方法免费送

2024-04-09 13:57:30, 质谱成像先锋队 布鲁克(北京)科技有限公司-质谱仪器


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LC-MS免疫肽组学面临与常规“鸟枪法”蛋白质组学不同的挑战,“鸟枪法”蛋白质组学通常使用胰蛋白酶进行消化,由于胰蛋白酶肽段通常是多带电的,并且单带电肽段通常是化学噪音,所以在典型的“鸟枪”法蛋白质组学工作流程中,单电荷离子通常会被排除,但MHC-I类免疫肽通常由8-14个氨基酸组成。由于其性质,它们经常以单电荷的形式出现,有时单电荷比例大于30%,常规的质谱仪不能选择性排除单电荷,因此这部分带单电荷的肽段不能进行碎裂被鉴定,影响了免疫肽的鉴定深度。如果不排除单电荷,又会影响多电荷肽段被鉴定的比例。

基于TIMS的4D-蛋白质组学则在免疫肽组学研究中具有先天优势,因为高效的捕集离子淌度可以把单电荷和多电荷完全分离开,因此可以选择性的将低m/z的单电荷离子(一般为化学背景)排除,高m/z的单电荷离子(一般为肽离子)安排做MS2分析,基于这个原理,“Thunder dda-PASEF”方法被开发出来,专门用于免疫肽组学分析。

TIMS 和 PASEF® 驱动的免疫肽组学研究

围绕基于TIMS和PASEF®核心技术的timsTOF平台,布鲁克打造的4D-Proteomics™生态系统为免疫肽组学研究提供了一套完整的革命性解决方案:

免疫肽组学解决方案

超高灵敏度

挖掘低丰度免疫肽信息,实现突破性发现;

精准聚焦

精准分析MHC I类肽;

高置信度鉴定

消除谱图的冗杂信息,准确识别相关分子;

更快数据采集

高达300Hz的采集速度加速相关研究;

强大数据解析能力

BPS Novor软件,支持实时从头测序分析,鉴定快速、准确、可靠。

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