2024-03-27 12:04:27, 4D-组学老虎队 布鲁克(北京)科技有限公司-质谱仪器
近期,浙江大学化学系方群教授团队在国际权威期刊《Nature Communications》上发表了题为“Pick-up single-cell proteomic analysis for
quantifying up to 3000 proteins in a Mammalian cell”的研究成果,创新性地提出了PiSPA(Pick-up Single-cell Proteomic Analysis)技术用于单细胞蛋白组分析。该工作流程利用纳升级微流控液滴操控机器人,可以实现单细胞精准捕获、样本前处理以及自动进样,利用布鲁克tims TOF Pro质谱仪在单个哺乳动物细胞内实现了超过3000种蛋白的定量深度。作者通过此项技术对三种不同的哺乳动物细胞(HeLa、A549和U2OS细胞)进行单细胞蛋白质组学研究,以及研究了HeLa细胞在迁移过程中的细胞异质性,均展现了超高的定量分析深度。
PiSPA单细胞蛋白质组分析流程示意图
哺乳动物单细胞样本蛋白质组分析结果
迁移过程中HeLa单细胞样本差异蛋白质组分析结果
1. Wang
Y, Guan ZY, Shi SW, et al. Pick-up single-cell proteomic analysis for
quantifying up to 3000 proteins in a Mammalian cell. Nat Commun.
2024;15(1):1279.
2. Meier
F, Brunner AD, Koch S, et al. Online Parallel Accumulation-Serial Fragmentation
(PASEF) with a Novel Trapped Ion Mobility Mass Spectrometer. Mol Cell
Proteomics. 2018;17(12):2534-2545.
3. Meier
F, Brunner AD, Frank M, et al. diaPASEF: parallel accumulation-serial
fragmentation combined with data-independent acquisition. Nat Methods.
2020;17(12):1229-1236.
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