2023-02-15 03:38:51, 多层组学定制服务 上海欧易生物医学科技有限公司
质谱技术凭借其高特异性、高灵敏度、同时分析多种化合物的优势被不断应用于科研样本的检验中,但其在应用过程中存在如标准化困难、自动化程度低、仪器复杂、对操作人员要求高等不足,这些不足会对结果的准确性和可比性造成影响。我们知道临床样本检验在临床诊断和治疗的辅助信息中达到了80%的比例,可见检验结果准确性和可比性的重要性。因此保证检验结果在时间和空间上的可比性和准确性,临床质谱技术的标准化仍然是一个非常值得挑战的问题。
为了增强差异性带来的影响鹿明生物花费大量人力、物力、财力从硬件标准化入手,采用Waters i-class+Thermo QE系列色谱质谱硬件体系打造更标准的实验技术中心,提供更标准,质量更可靠的数据。为LC-MS联用的代谢组学研究提供质量可靠的数据保驾护航。
硬件标准
LUMINGBIO
鹿明生物根据多年的色谱质谱使用经验,目前已确定采用Waters公司液相:Waters i-class plus系列串联Thermo QE/QE plus/QE HF等Orbitrap质谱系列,打造“硬件标准化”用“好服务,硬数据”服务于更多的科研用户,截止日前我司已配备多套完备体系的Waters i-class+Thermo QE系列色谱质谱硬件体系,实景实拍如下图所示:
图 | Waters i-class+Thermo QE系列多套色谱质谱硬件体系
数据库标准
LUMINGBIO
当硬件标准保持一致时,同一个实验室产生的数据就能在一定程度上形成自己的数据库,基于鹿明生物打造的上述多套标准的液质联用体系,鹿明生物已开发建立了含保留时间,MS1,MS2三维鉴定的自建代谢组数据库-EMDB2.0,其含有超过2500+标准品(已全部上机,并已获取到标准保留时间,MS1,MS2等维度信息);
标准数据库保留时间一览:
图 | 同一平台连续4月保留时间稳定性
图 | 同一月份不同平台的内标保留时间
如上图所示可知,同一平台在连续使用一定时间维度内,保留时间稳定性优秀,而在保证硬件体系基本上完全一致的情况下,不同平台的保留时间稳定性良好,保留时间偏移不超过0.2min(12s);
优势升级
LUMINGBIO
鹿明生物2023年LCMS非靶向产品线优势升级:
鹿明代谢自建库鉴定标准描述
LUMINGBIO
In practice, Identification of metabolites must meet three strict criteria: matching by accuratemass (±5/10 ppm), retention time (±12 s), and MS/MS spectra for MS1 identification. Typically, when a given metabolic feature was matched differently between different matching methods, we choose the matching based on the identification level: Standards (Standards database from Shanghai LuMing Biotech Co, Ltd. (Shanghai, China) > MS/MS > Universal Metabolism Database(HMDB,Metlin,Lipidmaps);
.
文末看点|lumingbio
上海鹿明生物科技有限公司(“鹿明生物”),从事蛋白组及代谢组质谱检测业务的专业质谱组学服务公司。以“鹿明质谱”服务品牌,携手母公司,实现了中心法则上、中、下游多层组学的串联,从基因组、转录组、表观组、微生物组,到蛋白组、代谢组,为客户提供全面的创新多组学技术服务。
经过多年发展,鹿明生物建立起了单细胞/微量蛋白质组学、4D-DIA/LFQ/PRM、iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白组学技术平台;PROTAC降解组学、蛋白从头测序、糖蛋白组学、肿瘤新抗原及免疫肽组筛选与生物药物表征于一体的药用质谱研发平台;空间代谢组学、全谱代谢组、靶向代谢组、拟靶向代谢组、脂质组、精准靶向等代谢组学技术平台,以及相应的大数据整合分析平台。通过持续的设备引进、技术开发、流程优化、人才汇聚、管理提升,建立起了成熟的质量标准、严格的质控体系以及科学的服务流程,广泛服务生命科学基础研究、疾病标志物发掘、疾病分型诊断、精准用药、药代药动、药物表征等多个领域。
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绪 撰文
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