2021-12-02 18:34:55, 多层组学定制服务 上海欧易生物医学科技有限公司
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编者按:
一个好的科学研究前提是什么?科学问题?实验设计?勤劳的双手?这些都是前提。但是,还有一样东西是决定研究成败的关键,那就是实验样本。如果想要得到一个好的实验结果,样本的采集和预处理进行严格的把控必不可少~
今天小鹿跟大家来聊一聊常规组学样本的收集与保存避坑攻略,总结归纳为以下“一要求七要素”,轻轻松松就能完成样本的收集:
一要求
减少人为的污染,降解和修饰。
七要素
一致:实验组与对照组取样一致性,如组织样本组织块的大小、取样部位,血液样本性别年龄的匹配,尿液样本取样时间等;
除杂:去除与实验无关的杂质,如动物组织去血、植物组织去除泥土等污染物、菌体及细胞去除培养基等,推荐使用PBS缓冲液或者生理盐水,吸水纸吸干残留液体;
低温:样本预处理尽量低温,可以在冰上进行杂质去除和分装的操作,低温保存,通常保存在-80℃冰箱;
分装:根据实验用量进行分装,避免反复冻融;
迅速:样本收集,制备,存储和运输应尽可能的迅速,压缩样本采集到正式实验的时间;
标记:用优质的记号笔清晰的标记好样品名称,以免混淆样本;
包装:建议使用进口的离心管、冻存管收集样本,以防在运输和操作过程中样本管破裂以及聚合物对样本造成污染,植物样本可以用锡箔纸包装,锡箔纸外面套一个自封袋以免运输过程中样本洒落。
下面小鹿就以蛋白组学和代谢组学的组织样本为例,看看“一要求七要素”在具体样本取样中的应用细节~
代谢组学组织样本
收集注意事项
动物组织(包括脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉和皮肤等;软体动物如血吸虫):
1)取适量组织器官,用预冷的PBS缓冲液或生理盐水清洗干净;
2)迅速剥去非必需的脂肪和结缔组织,再用PBS缓冲液或生理盐水冲洗干净;
3)用干净的无尘吸水纸吸干水分,将组织分成50-100 mg / 管分装待用;
4)管子上做好标记后速冻处理,-80 ℃冻存;干冰运输。
温馨提示:
1.对于动物组织样本无法满足50mg/样,如海马组织,大脑组织等,可考虑同组混样以达到50mg/样的要求。
2.尽量不要使用锡箔纸以及自封袋包装样本,建议将样本液氮研磨后使用离心管/冻存管进行分装。
3.在使用PBS缓冲液/超纯水进行漂洗时,需要尽快处理。
蛋白组学组织样本
收集注意事项
// 常规组织 //
PBS洗涤去除残留血液和污染物,剔除无关的干扰组织(血管、脂肪、结缔组织等);
冲洗干净,用组织剪或手术刀将组织分离成1cm3左右的小块;
液氮速冻5min,保存于-80℃,干冰运输。
——心、肝、脾、肺、肾、肠、脑、肌肉等样本
注意:
1)对于人体手术切除的组织,最好用PBS(磷酸缓冲盐溶液,作为溶剂,起溶解保护试剂的作用)取完之后直接去血。
2)对于小鼠、大鼠、兔子之类的组织样品,建议用灌流的方式来去血,尤其是像肝脏、胃、心脏这类大的组织,可以直接用灌流的方式去血,去得最干净。其次的方案是在后期剪碎的时候去血。
3)对于组织重量远低于100 mg的样本,如斑马鱼大脑组织、小鼠海马组织等,可考虑混样。
// 软骨组织 //
尽量选择大小相近的样品,将样品表面清洗干净,清除泥沙,将样品存放于离心管,较大的样品用手术刀将软骨切成1cm3左右的小块;
液氮速冻5min,保存于-80℃,干冰寄送。
// 软体动物 //
尽量选择大小相近的样品,将样品表面清洗干净,清除泥沙,将样品存放于离心管,较大的样品可剪成小块后存放;
液氮速冻5min,保存于-80℃,干冰寄送。
——软体动物贝壳等
// 动物毛发 //
用适量2%SDS,50mM 磷酸钠(pH7.8)缓冲液漂洗样品或用PBS进行清洗,去除污染物,干燥;
液氮速冻5min,保存于-80℃,干冰寄送。
样本量要求
蛋白组学
常规动物组织(心、肝、脾、肺、肾、肠、脑、肌肉等)-定量蛋白组学>200mg;修饰蛋白组学>500mg
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Lisa整理 撰文
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