暖冬大“放价” | 4D蛋白组学低价抢“鲜”领~

2021-11-10 20:00:51, 多层组学定制服务 上海欧易生物医学科技有限公司


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近年来,随着色谱、质谱等技术不断地突破,尤其是离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。基于Tims-TOF Pro系统和Evosep One色谱系统的4D高通量蛋白组学实现了更高通量和定性定量可靠性。4D-Proteomics™是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(mobility)的分离,进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。

图1 | 4D蛋白组示意图


2020年12月蛋白质组领域领军科学家Matthias Mann团队(Max Planck Institute of Biochemistry)、Hannes Röst团队(University of Toronto)、Ben Collins团队(ETH Zurich)以及Ruedi Aebersold团队(ETH Zurich)在Nature methods发表题为“diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition”的文章,其共同开发的基于4D平台的DIA技术——diaPASEF能够全面提升蛋白质鉴定覆盖率、重现性和定量准确性[1]。


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HOT 新一代4D蛋白组学


有老师有问,4D蛋白组学应用在哪些方面?以下是小鹿整理的4大方向,供您参考。

方向一:Biomarker研究

方向二:分子分型研究

方向三:调控机制研究

方案四:药靶与药物发掘研究

当下,4D蛋白组正处于新一代的推新技术,跟进新技术,抓住在“风口上的新技术”是寻求突破的快捷而有效的方式之一。目前,科学研究的创新性、完整性、研究的深度,以及生命科学的复杂性,导致其本身是一个慢出成果的事情。若是老师前期的基础工作比较扎实了,包括前期发表的文章和针对现有的预实验结果都有很好的结果,那可以去考虑运用4D蛋白组学开展多组学实验,做机制研究。若没有前期基础,可以待基础实验完善后再考虑,先用4D蛋白组学做一点简单的标志物筛选实验。


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Lisa撰文

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