暖冬大“放价” | 4D蛋白组学低价抢“鲜”领~

近年来，随着色谱、质谱等技术不断地突破，尤其是离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。基于Tims-TOF Pro系统和Evosep One色谱系统的4D高通量蛋白组学实现了更高通量和定性定量可靠性。4D-Proteomics™是在3D分离即保留时间（retention time）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度的基础之上增加了第四个维度，离子淌度（mobility）的分离，进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度，带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。

图1 | 4D蛋白组示意图

2020年12月蛋白质组领域领军科学家Matthias Mann团队(Max Planck Institute of Biochemistry)、Hannes Röst团队(University of Toronto)、Ben Collins团队（ETH Zurich）以及Ruedi Aebersold团队（ETH Zurich）在Nature methods发表题为“diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition”的文章，其共同开发的基于4D平台的DIA技术——diaPASEF，能够全面提升蛋白质鉴定覆盖率、重现性和定量准确性[1]。

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有老师有问，4D蛋白组学应用在哪些方面？以下是小鹿整理的4大方向，供您参考。

当下，4D蛋白组正处于新一代的推新技术，跟进新技术，抓住在“风口上的新技术”是寻求突破的快捷而有效的方式之一。目前，科学研究的创新性、完整性、研究的深度，以及生命科学的复杂性，导致其本身是一个慢出成果的事情。若是老师前期的基础工作比较扎实了，包括前期发表的文章和针对现有的预实验结果都有很好的结果，那可以去考虑运用4D蛋白组学开展多组学实验，做机制研究。若没有前期基础，可以待基础实验完善后再考虑，先用4D蛋白组学做一点简单的标志物筛选实验。

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Lisa撰文

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