水果特刊 | 看蛋白组学、代谢组学如何助力草莓、甜瓜、桃子、榴莲、荔枝发刊

2022-07-30 11:28:10, 多层组学定制服务 上海欧易生物医学科技有限公司



要说科研界中的夏日水果图鉴是什么?那不得不说运用TMT标记定量蛋白质组学、非靶向代谢组学、转录组学等组学技术对于水果高产、高品及胁迫的研究啦~

本篇小鹿给大家整理了【五篇夏日科研水果图鉴】助力您的科学研究,一起跟着我的脚步来看看吧~


您是否对以下研究方向感兴趣?

  • 突变体中类黄酮生物合成的潜在调控机制;

  • 水果中病原菌感染的诱导抗性机制;

  • 水果中的某类活性差异性相关代谢物;

  • 果肉成熟过程中风味相关初级代谢的动态变化;

  • 水果因外界诱导因素引起的生物学机制变化。


01

水果中病原菌感染的诱导抗性机制 

中文标题:硅酸钠通过调节线粒体能量代谢和活性氧的产生来启动收获后甜瓜的防御机制

研究对象:甜瓜线粒体

发表期刊:Food chemistry

影响因子:9.231

合作单位:甘肃农业大学

运用欧易/鹿明生物技术:TMT标记定量蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)


研究结果:

欧易/鹿明生物合作客户甘肃农业大学毕阳教授课题组Food chemistry期刊发表的研究成果。本研究通过TMT标记蛋白质组学研究方法表明,Si处理后的甜瓜果实线粒体通过调节被病原菌感染的甜瓜的能量代谢和ROS的产生,启动寄主对Trichothecium roseum侵染的抗性,从而降低了甜瓜的腐烂。


发现Si处理的甜瓜果实线粒体通过调节能量代谢和ROS生成,在抗病启动过程中发挥重要作用。为进一步揭示水果对病原菌感染的诱导抗性机制提供了新的视角和信息。


点击查看原文链接



 02

突变体中类黄酮生物合成的潜在

调控机制

文章标题:基于转录组/代谢组联合分析揭开高类黄酮含量草莓突变体中类黄酮生物合成的潜在调控机制

材料:草莓  

发表期刊:Frontiers in Plant Science   

发表时间:2022.6.28    

影响因子:6.627

作者单位:四川农业大学园艺学院

主要运用技术:代谢组学+转录组学


研究结果:

在本研究中,为进一步解开该突变体出现这种代谢差异的原因,研究人员对''Benihoppe''的MT和WT草莓进行了联合非靶向代谢组和转录组学分析。代谢分析共检测出113种黄酮类化合物,并且首次在草莓中检测到一种特定的花青素,即矮牵牛基-3-O-芸香糖苷。


进一步联合转录组分析,该研究发现花青素和原花青素的上调是由于F3 '' 5 '' H的下调以及F3''H和LAR表达的上调共同引起的,并且该过程可能受到C3H、MADS 和 AP2/ERF 等转录因子上调的潜在影响。该研究还通过代谢物相关性分析表明,与总酚含量密切相关的是原花青素而非花青素,这凸显了原花青素对这些草莓酚类物质含量的贡献。


03

果肉成熟过程中风味相关初级代谢的


动态变化

文章标题:代谢组学和转录组学分析评估了榴莲果肉成熟过程中风味相关初级代谢的动态变化

发表期刊:Frontiers in Plant Science

发表时间:2021.6

影响因子:6.627

作者单位:泰国朱拉隆功大学

主要运用技术:代谢组学+转录组学


研究结果:

本研究利用毛细管电泳-气相色谱-飞行时间质谱法(代谢组学)检测到94种与榴莲栽培品种(Monthong)果肉成熟相关代谢物(尤其是与风味相关的代谢物)。


结果表明,在Monthong成熟过程中,蔗糖含量增加;棉子糖家族低聚糖含量的变化也被首次观察到。同时,苹果酸和琥珀酸含量增加,而柠檬酸含量不变。值得注意的是,包括异亮氨酸、亮氨酸和缬氨酸在内的大多数氨基酸含量增加,而天冬氨酸含量降低,谷氨酸含量不变。此外,研究者结合转录组学分析,阐明糖代谢、糖酵解、TCA循环和氨基酸途径的动态变化,并确定了关键候选基因。综上,本研究阐明了榴莲成熟过程中风味相关的代谢基础,为未来开发榴莲代谢物和遗传标记提供依据。


DOI号:10.3389/fpls.2021.687799


 04

水果中的某类活性差异性相关代谢物

文章标题:非靶向代谢组学分析鉴定桃肉中а-葡糖苷酶抑制活性差异性相关代谢物

材料:桃子果肉

发表期刊:Molecules

影响因子:4.927

作者单位:上海市农业科学院林木果树研究所

主要运用欧易/鹿明生物技术:非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)


上海市农业科学院林木果树研究所叶正文研究员团队Molecules杂志上发表的用UPLC-Q-TOF/MS(非靶向代谢组学)方法比较中国不同桃子品种的果肉中а-葡糖苷酶抑制活性差异性论文,特别致谢了上海鹿明生物科技有限公司在代谢组学分析中的工作。


结果显示:绿原酸、新绿原酸、儿茶素、低聚原花青素和根皮苷等标志性化合物对α-葡萄糖苷酶抑制活性起作用,不同α-葡萄糖苷酶抑制活性的高低组间的代谢物存在显著差异。所筛选到的9种标志性化合物可以作为桃肉α-葡萄糖苷酶抑制活性的指标,为评价桃果实的营养提供参考,以用于育种及商业鉴定。


点击查看原文链接


05

水果因外界诱导因素引起的生物学


机制变化

文章标题:花诱导期间荔枝叶的代谢组学分析揭示茎环剥的代谢改善

发表期刊:Molecules

发表时间:2021.07

影响因子:4.927

作者单位:华南农业大学园艺学院

主要运用技术:代谢组学


研究结论:

研究了荔枝茎环剥和低温处理后叶片的代谢变化。结果表明,环剥处理改善了荔枝在浅绿期的开花情况,使荔枝的顶端新梢开花。此外,茎环剥树叶片中蔗糖和D-麦芽糖等含量高,而UDP-葡萄糖、D-葡萄糖- 6p、D-半乳糖和D-果糖含量低,可能与荔枝开花有关。半乳糖醇、苯基丙酮酸、乙酰辅酶A、亚油酸、α -亚麻酸、13-HPOT、9-oxoODE和9,12,13-triHOME的稳定水平表明,环剥可以克服激活这些化合物代谢途径的低温效应,可能对荔枝开花产生负面影响。


由此可见,淀粉和蔗糖代谢、半乳糖代谢、磷酸烯醇丙酮酸代谢和亚油酸代谢可能在荔枝成花诱导中起重要作用。本研究有助于了解花诱导过程中茎环剥和低温处理的生物学机制。


夏日,是一场颜色与香气的果味交响乐。享受微风拂面般的清爽,在柔软的凉意中舒展,品味甜蜜的瓜果,这才是夏天该有的姿态。清甜、轻盈、纯粹,果香溢满舌尖,这便是瓜果里流动的香气,恍如一团团散落人间的红霞,逐渐渲染出一个粉色的国度。感谢各位科研人对水果研究的贡献,给我们带来了夏天的甜蜜暴击!


好啦~本期分享就到这里,咨询组学研究服务请扫描下方二维码,获取更多组学资料~

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家凯老师|撰文

小久|排版

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本文系鹿明生物原创

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