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喜报
2020年11月17日,由鹿明生物最新研发的发明专利证书《一种多物种GC-MS内源性代谢物数据库及其建立方法》正式授权。该专利从申请到授权仅花费了6个月时间。本专利是由鹿明生物资深技术研发人员历时2年,运用标准品以及往年过万次的GC-MS数据解析,经过严格的数据筛选、分析、建立了专属鹿明生物的本地数据库。
01.
什么是代谢组学数据库?
代谢组是生物体内发现的小分子化合物的集合。代谢组学发展的关键是代谢组学数据库的发展,正如基因组学和蛋白质组学依赖GenBank和UniProt中的参考序列来标注基因和蛋白质一样,代谢组学依赖于代谢组学数据库来标注代谢物。
02.
一种多物种GC-MS内源性代谢物数据库
此数据库中包含2500+个能够采用GC-MS检测的代谢物并且还在不断更新中,其质荷比范围在85到650之间,覆盖了包括脂类、氨基酸、脂肪酸、胺类、醇类、糖类、氨基糖类、糖醇类、糖酸类、有机磷酸盐类、羟基酸类、芳香类、嘌呤类和甾醇类等多种物质。包含了动物、植物、微生物等诸多物种来源。
03.
数据库的优势
更准确
针对GC-MS非靶向代谢组学研究,用不同的样品测试数据库的定性能力。以相似度40%为阈值时,此数据库的定性能力比知名数据库提升了10%-20%;若以相似度70%为阈值时,此数据库定性能力提升了13%-56%。
信息更全
此数据库同时具有HMDB, KEGG, CAS识别号、物质分类等内容,信息更全面,方便后续进行代谢物功能研究。
更高效
此数据库不仅节省了前期实验过程中人力试剂的损耗;同时还进一步缩短了单个项目对机时的占用,提高了实验效率和仪器通量;
04.
应用方向
该数据库主要用于GC-MS非靶向代谢组学的数据分析。GC-MS非靶向是通过GC-MS平台对限定条件下的特定生物样品中所有代谢组分的定性和定量。
应用领域:
05.
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END
Lisa 撰文
本文系鹿明生物原创
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转载请注明本文转自鹿明生物
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