2023-07-03 15:17:29, 质谱创新组学 上海欧易生物医学科技有限公司
鹿明生物完成蛋白质组学生物信息分析升级,可放心向TOP级期刊提交美图分析啦!
此次升级参考近年《Cell》、《Nature》等权威学术杂志,综合鹿明生物客户们的需求与建议,我们将报告由内而外精心打磨进行了全面的更新升级,包括优化数据预处理、多方位数据质控、多元功能富集分析、多样数据可视化,给客户更加直接全面的分析结果。
本次升级后报告共有7大模块,53项分析内容。下面让我们看看具体的更新内容吧~
(一)项目概况-提炼报告内容,基本结果一目了然
升级后的项目概况将在首页展示实验样本、分组及比较组信息、蛋白肽段鉴定及差异比较结果,除此之外还会展示全蛋白在GO、KEGG、Interpro、eggNOG、Pfam等数据库中的注释情况。
图 1 新增项目概况内容
图 2 新增全蛋白注释统计图
(二)全方位数据质控-从定性到定量,深入把控
从整体、分组、样本三个角度,充分展示鉴定数量集,不同分组,不同样本鉴定情况,辅助筛选离群样本及批次效应检测。
图 3 质控分析展示
(三)多个数据库富集-分析内容全面,图片专业美观
选取InterPro数据库补充蛋白功能注释,同时针对于物种为人、大小鼠的数据还提供了Wikipathways和Reactome数据库。对于富集分析结果可视化,除常规柱状图和气泡图之外,新增富集环状图(图4中)、蝴蝶图(图4左下)和富集分析和弦图(图4右)。
图 4 新增数据库富集内容
(四)美化PPI网络图-增加节点排序,“抓住”hub蛋白
图 5 蛋白互作网络图
(五)GSEA分析-紧跟研究热点,补充功能分析
图 6 GSEA示例图
除此之外,我们还对部分图片进行美化升级,如火山图、Motif分析等。
图 7 火山图和Motif分析
以上仅对本次升级的部分内容做简单展示,我们将持续关注老师需求与研究现状,不断进行升级优化,提供更加多样化的分析结果!想要体验的老师快快联系您的销售工程师,或者添加微信:17317724501 为您安排人员解答哦!
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文末看点|lumingbio
上海鹿明生物科技有限公司是欧易生物旗下从事蛋白质组及代谢组质谱检测的专业质谱组学服务公司。公司建有国内第一个空间代谢组商业服务平台,深耕质谱组学检测分析,具体包括空间代谢组、双平台代谢组、靶向代谢组、TMT标记定量蛋白组、翻译后修饰蛋白组、4D-DIA蛋白组、单细胞及超微量蛋白组、空间蛋白组等。创新质谱组学平台广泛应用于机制解析、分型诊断、标志物筛选、药靶发掘等多个领域。公司并先后获得高新技术企业、上海市专精特新企业并建有院士专家工作站,自有包括tims tof pro2在内的各类大型质谱近二十台套,年服务项目超2000项。鹿明生物协助合作伙伴发表SCI论文近千篇,成功打造以硬数据、好服务为基础,以空间代谢组为特色的质谱组学检测服务公司品牌。
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END
优雅小猫 撰文
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