2月新发高质量客户文献——肿瘤/心血管研究攻略大盘点

2022年，使用吉凯基因的产品/服务发表的文献已达800篇，截至2022年3月累计已达18000多篇！

此次小编精心挑选了13篇2月新发的高质量文章供大家欣赏，恭喜以下研究团队！同时也希望在2022年给您的科研计划提供一些思路和灵感，快来一睹为快吧！

Demethylase ALKBH5 suppresses invasion of gastric cancer via PKMYT1 m6A modification.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Molecular Cancer.    IF=27.401

发表单位：陆军军医大学

吉凯助力：ALKBH5-H204A 过表达慢病毒

文章摘要：作者通过在胃癌组织中进行甲基化 RNA 免疫沉淀测序 (MeRIP-seq)，发现ALKBH5表达降低，且与临床肿瘤远端转移和淋巴结转移有关。ALKBH5干扰促进了胃癌细胞转移，这种作用与ALKBH5的去甲基化酶活性密切相关。PKMYT1 作为 ALKBH5 的下游靶标，促进了胃癌侵袭和迁移。由 ALKBH5 敲低或其去甲基化酶活性突变引起的 PKMYT1 表达上调表明 ALKBH5 以 m6A 依赖性方式调节 PKMYT1 的表达。IGF2BP3 通过其 m6A 修饰位点帮助稳定 PKMYT1 的 mRNA 稳定性。总之，本研究建立了ALKBH5-PKMYT1-IGF2BP3在胃癌转移中的调控系统，代表了胃癌转移的新治疗靶点。

Targeting polarized phenotype of microglia via IL6/JAK2/STAT3 signaling to reduce NSCLC brain metastasis.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy.    IF= 18.187

发表单位：华中科技大学同济医学院附属同济医院

吉凯助力：firefly luciferase、Puromycin

文章摘要：本文旨在研究活化的小胶质细胞如何促进非小细胞肺癌（NSCLC）脑转移。通过单细胞 RNA 测序和转录组差异分析，确定 IL6 是脑转移细胞 (A549-F3) 中的关键调节因子，通过 JAK2/STAT3 信号传导诱导抗炎小胶质细胞，进而促进A549-F3 细胞转移中的定植过程。在临床样本中，血清中 IL6 水平较高的患者显示出较高的脑转移倾向。此外，TCGA数据显示，与 IL6 水平较高的患者相比，IL6 水平较低的 NSCLC 患者的总生存时间更长。总之，在活化的小胶质细胞中靶向 IL6/JAK2/STAT3 信号传导可能是抑制 NSCLC 患者脑转移的有希望的新方法。

Integrative molecular and clinical profiling of acral melanoma links focal amplification of 22q11.21 to metastasis.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Nature Communications.    IF=14.919

发表单位：斯坦福大学/中南大学湘雅医院/耶鲁大学

吉凯助力：慢病毒GV298

文章摘要：肢端黑色素瘤是非白人个体中最常见的黑色素瘤亚型，与预后不良有关。本文对在北美 (n = 37) 或中国 (n = 67) 接受治疗的 104 名患者的肢端黑色素瘤进行综合基因组和临床分析，发现细胞带22q11.21 的复发性、迟发性局灶性扩增是低生存率的主要决定因素，与转移密切相关，并与免疫检查点阻断反应相关的免疫调节基因下调有关。出乎意料的是，LZTR1 - 其他癌症中已知的肿瘤抑制因子 - 是该细胞带中的关键候选癌基因。黑色素瘤细胞系中 LZTR1 的沉默导致凋亡和死亡，与主要热点突变或黑色素瘤亚型无关。反过来，LZTR1 在正常人黑色素细胞中过表达启动了与转移相关的过程，包括不依赖锚定的生长、球状体的形成以及 MAPK 和 SRC 活性增加。本文的结果提供了对肢端黑色素瘤病因的见解，并暗示 LZTR1 是关键的肿瘤促进剂和治疗靶点。        

Copy number amplification of ENSA promotes the progression of triple-negative breast cancer via cholesterol biosynthesis.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Nature Communications.    IF=14.919

发表单位：复旦大学附属上海肿瘤中心

吉凯助力：ENSA cDNA

文章摘要：通过对302名三阴性乳腺癌 (TNBC)患者的综合拷贝数和转录组分析表明，基因 α-硫磺素 (ENSA) 在 1q21.3 区域表现出反复扩增，并在 TNBC 中高表达。ENSA 促进肿瘤生长并表明 TNBC 患者存活率低。机制上，ENSA 是 TNBC 中胆固醇生物合成的重要调节剂，它上调 SREBP2 表达，SREBP2 是胆固醇生物合成中的关键转录因子。ENSA可以增加p-STAT3（Tyr705）的水平，并且活化的STAT3与SREBP2的启动子结合以促进其转录。此外，作者揭示了 STAT3 抑制剂 Stattic 在 ENSA 高表达的 TNBC 中的功效。总之，ENSA 在 1q21.3 区域的扩增促进了 TNBC 进展并表明对 STAT3 抑制剂的敏感性。

EEF2K silencing inhibits tumour progression through repressing SPP1 and synergises with BET inhibitors in melanoma.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Clinical and Translational Medicine.    IF=11.492

发表单位：中南大学湘雅医院

吉凯助力：EEF2K shRNA

文章摘要：本文旨在研究EEF2K在黑色素瘤中的功能。结果显示：EEF2K 沉默显著减弱了黑色素瘤细胞的恶性表型，包括增殖、迁移、侵袭和转移。相反，EEF2K 过表达促进黑色素瘤细胞增殖、迁移和侵袭。机制上，EEF2K 上调 STAT3 (p-STAT3) 在 Tyr705 的磷酸化，它与 SPP1 的启动子区域结合并增强其转录，从而促进黑色素瘤进展。转染诱导的 SPP1 重新表达部分否定了 EEF2K 沉默对黑色素瘤的抑制作用，而 SPP1 或 STAT3 的抑制显著消除了 EEF2K 对黑色素瘤细胞的功效。有趣的是，EEF2K 沉默结合 BET 抑制剂治疗可进一步抑制黑色素瘤的细胞增殖并促进细胞凋亡。总之，EEF2K/p-STAT3/SPP1 可能是黑色素瘤进展中的一种新的致癌途径，可能是黑色素瘤新型联合治疗的靶点。

The CTCF/LncRNA-PACERR complex recruits E1A binding protein p300 to induce pro-tumour macrophages in pancreatic ductal adenocarcinoma via directly regulating PTGS2 expression.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Clinical and Translational Medicine.    IF=11.492

发表单位：上海交通大学医学院附属瑞金医院、中国科学院大学上海营养与健康研究所

吉凯助力：PACERR 过表达质粒、PTGS2–promoter-reporter质粒

文章摘要：本文旨在研究在胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中，调节促肿瘤 M2 极化肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的表观遗传机制。结果显示，与单核细胞相比，转录因子 CTCF（CCCTC 结合因子）在 TAM 中高表达，且预计在超易接近的染色质区域中显著富集。CTCF的高浸润性+TAMs与 PDAC 患者的不良预后显著相关。在 THP1 衍生的 TAM 中敲除 CTCF 会导致 M2 极化 TAM 的特定标志物下调，包括 CD206 和 CD163。当 THP1 衍生的 TAM 被 CTCF 敲低时，侵袭和转移能力下降。对多组学数据的进一步综合分析表明，前列腺素内过氧化物合酶 2 (PTGS2) 和 PTGS2 反义 NF-κB1 复合物介导的表达调节子 RNA (PACERR) 是 CTCF 的关键下游靶点，且彼此呈正相关，它们在一条染色体上，位置非常接近。PACERR 的敲除表现出与 CTCF 敲除 THP1 衍生的 TAM 中观察到的相似的表型。此外，PACERR 可直接与 CTCF 结合，将组蛋白乙酰转移酶 E1A 结合蛋白 p300 募集到 PACERR 和 PTGS2 的启动子区域，从而增强组蛋白乙酰化和基因转录，促进 PDAC 中 TAM 的 M2 极化。本文证明了在 PDAC 肿瘤微环境中促进促肿瘤 M2 极化 TAM 的一种新的表观遗传调控机制。   

Targeting macrophagic SHP2 for ameliorating osteoarthritis via TLR signaling.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Acta Pharmaceutica Sinica B.    IF=11.413

发表单位：南京大学医学院附属鼓楼医院

吉凯助力：RNA-seq、慢病毒

文章摘要：本文报告了 SHP099通过抑制 M1 巨噬细胞极化来减轻骨关节炎进展。M1 巨噬细胞极化伴随着 OA 患者和 OA 小鼠模型滑膜组织中 SHP2 的过表达。与野生型 (WT) 小鼠相比，髓系条件性 Shp2 敲除 (cKO) 小鼠表现出 M1 巨噬细胞极化降低和滑膜炎严重程度减轻，软骨表型蛋白 II (COL2) 表达升高，软骨退化表达降低标记 OA 软骨中的胶原蛋白 X (COL10) 和基质金属蛋白酶 (MMP3)。进一步机制分析表明，SHP099 抑制LPS 诱导的 Toll 样受体信号传导，这是由NF-κB和 PI3K-AKT 信号介导的。此外，关节内注射 SHP099 还可显著减缓 OA 进展，包括关节滑膜炎和软骨损伤。总之，SHP2 的变构抑制可能是 OA 的有希望的治疗策略。          

FOXQ1-mediated SIRT1 upregulation enhances stemness and radio-resistance of colorectal cancer cells and restores intestinal microbiota function by promoting β-catenin nuclear translocation.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Journal Of Experimental & Clinical Cancer Research.    IF=11.161

发表单位：重庆市荣昌区人民医院、川北医学院附属医院

吉凯助力：双荧光素酶工具质粒GV354

文章摘要：FOXQ1在结直肠癌(CRC)组织和细胞中高表达，与结直肠癌患者预后不良呈正相关。FOXQ1 过表达导致 CRC 细胞对辐射的抵抗力。敲低FOXQ1抑制了 CRC 细胞的干性并逆转了它们的放射抗性。FOXQ1增强了SIRT1的转录表达，SIRT1增强了β-catenin的表达和核转位。FOXQ1 的敲低抑制了 SIRT1 的表达，从而降低了 CRC 细胞的干性和放射抗性。此外，FOXQ1 敲低通过抑制 SIRT1 和 β-catenin 来抑制 CRC 异种移植物的形成，从而降低 CRC 中上调的病理细菌的含量。总之，FOXQ1介导的SIRT1上调增强了β-catenin的表达和核转位，有利于CRC相关肠道病理细菌，从而增强CRC细胞的干性和放射抗性。

The effects of extracellular vesicles derived from Krüppel-Like Factor 2 overexpressing endothelial cells on the regulation of cardiac inflammation in the dilated cardiomyopathy.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Journal Of Nanobiotechnology.    IF=10.435

发表单位：南京大学医学院附属鼓楼医院

吉凯助力：HitransG P

文章摘要：本文旨在研究KLF2 过表达的内皮细胞(KLF2-EVs) 的细胞外囊泡 (EVs) 在扩张型心肌病（DCM）中的作用。通过梯度离心从过表达 KLF2 的内皮细胞的上清液中分离出 EVs。小鼠反复服用低剂量多柔比星，然后将KLF2-EV静脉注射到小鼠。用 KLF2-EV 治疗可预防多柔比星引起的左心室功能障碍，并减少心肌中 Ly6^highMo/Mø 的募集。流式细胞术检测骨髓和脾组织中的Ly6^high单核细胞，并阐明这种有益作用的机制。KLF2-EVs 增加了骨髓中Ly6^high单核细胞的保留率，而不是脾脏组织中的单核细胞。KLF2-EVs 还显著下调骨髓细胞中CCR2的表达。总之，源自 KLF2 过表达 ECs 的 EV 通过靶向 CCR2 抑制来自骨髓的 Ly6C^high单核细胞动员，减少了 DCM 小鼠的心脏炎症并改善了左心室功能障碍。

PBLD inhibits angiogenesis via impeding VEGF/VEGFR2-mediated microenvironmental cross-talk between HCC cells and endothelial cells.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Oncogene.    IF=9.867

发表单位：南方医科大学南方医院

吉凯助力：PBLD过表达和干扰慢病毒

文章摘要：在 HCC 细胞中，PBLD 通过 ERK/HIF-1a/VEGF 轴抑制缺氧诱导的血管生成。TCGA 数据库和临床样本验证的生物信息学分析也确定了 PBLD 与血管生成相关基因表达（包括 HIF-1a）之间的负相关。除了下调  HIF-1a/VEGF 表达外，PBLD 还通过 HCC 衍生的外泌体 miR-940 阻断内皮细胞上的 VEGF 受体 2 (VEGFR2)。PBLD 通过直接与 miR-940 相互作用来激活 TCF4 对 miR-940 的转录促进作用。PBLD 不仅通过阻断内皮细胞中 VEGFR2 的表达，还通过下调 HIF-1a 诱导的 HCC 细胞中 VEGF 的表达和分泌来抑制血管生成。这些可能为寻求新靶点以克服抗血管生成治疗的耐药性提供理论基础。        

The m6A reader IGF2BP3 promotes acute myeloid leukemia progression by enhancing RCC2 stability.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Experimental and Molecular Medicine.    IF=8.718

发表单位：重庆医科大学第二附属医院

吉凯助力：IGF2BP3过表达和干扰慢病毒

文章摘要：IGF2BP3 在急性髓性白血病 (AML) 中特异性过表达，这是一种与预后不良和高遗传风险相关的白血病亚型。IGF2BP3 是以 m6A 依赖性方式维持 AML 细胞存活所必需的，而 IGF2BP3 的敲低可显著抑制细胞凋亡，减少增殖，并在体内外削弱 AML 细胞的白血病能力。机制上，IGF2BP3 与 RCC2 mRNA 相互作用并稳定 m6A 修饰 RNA 的表达。总之，m6A 阅读器 IGF2BP3 有助于 AML 的肿瘤发生和预后不良，并可作为癌症治疗开发的靶点。    

Circ-PKD2 promotes Atg13-mediated autophagy by inhibiting miR-646 to increase the sensitivity of cisplatin in oral squamous cell carcinomas.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Cell Death & Disease.    IF=8.469

发表单位：青岛大学附属医院

吉凯助力：circ‐PKD2 慢病毒

文章摘要：circ-PKD2 的过表达增加了口腔鳞状细胞癌 (OSCC)细胞中自噬体的形成和蛋白质的激活，如 LC3 II/I。然而3-MA 减轻了其对自噬的激活作用。生物信息学分析和双荧光素酶报告基因分析证实了 circ-PKD2 和 miR-646 以及 miR-646 和 Atg13 之间存在靶向关系。功能实验进一步揭示了 miR-646 在顺铂处理的 OSCC 细胞中逆转了 circ-PKD2 的自噬和凋亡作用。此外，circ-PKD2 通过吸附 miR-646 促进 ATG13 的表达，其对Atg13的干扰减轻了circ-PKD2对miR-646自噬和凋亡的激活作用。体内实验也证实了circ-PKD2 抑制了肿瘤增殖并激活了 OSCC 细胞中的自噬。本研究为以circ-PKD2为靶点调节OSCC患者对顺铂的敏感性，从而提高其化疗效果提供了理论依据。

RIPK1-RIPK3 mediates myocardial fibrosis in type 2 diabetes mellitus by impairing autophagic flux of cardiac fibroblasts.（点击阅读原文>>）

发表期刊：Cell Death & Disease.   IF=8.469 

发表单位：苏州大学、南京医科大学附属苏州科技城医院

吉凯助力：RIPK1 和 RIPK3干扰慢病毒

文章摘要：分别用高糖脂肪（HGF）培养基和饮食建立了2型糖尿病的体内外模型。HGF 诱导心肌纤维化，通过激活 RIPK1/RIPK3 通路损害心脏舒张和收缩功能，增加自噬相关蛋白如 LC3-II、P62 和活性组织蛋白酶 D 的表达。抑制 RIPK1 或 RIPK3 通过恢复受损的自噬流来减轻 HGF 诱导的心脏成纤维细胞死亡和纤维化。自噬阻滞剂中和了 RIPK1 抑制剂 necrostatin-1 (Nec-1) 和 RIPK3 抑制剂 GSK872 (GSK) 的作用。RIPK1/RIPK3 的抑制分别降低了 RIPK3/p-RIPK3 和 RIPK1/p-RIPK1 的水平。P62 与 RIPK1-RIPK3 形成复合物并促进 RIPK1 和 RIPK3 的结合，RIPK1 的沉默降低了 RIPK1 与 P62 的结合以及 P62 与 LC3 的结合。此外，在 HGF 处理的成纤维细胞中，结合低剂量的 Nec-1 和 GSK 抑制这两种激酶可显著减少细胞死亡和纤维化，并恢复自噬流。在糖尿病大鼠模型中，Nec-1 (1.65 mg/kg) 给药 4 个月可显著缓解心肌纤维化，下调自噬相关蛋白，改善心脏收缩和舒张功能。总之，HGF 通过激活 RIPK1-RIPK3 通路和削弱自噬流来诱导心肌纤维化和心功能不全，而 RIPK1/RIPK3 的药理学和遗传抑制可以避免这种情况。