CCN2的自噬降解导致舒尼替尼的心脏毒性

Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib

研究对象：小鼠

发表期刊：Autophagy

影响因子：16.016

发表时间：2021年8月

合作单位：浙江大学药学院

组学技术：iTRAQ蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)

研究背景：

心肌细胞死亡是心血管疾病和心脏毒性的主要病理生理原因。过度自噬是心肌细胞死亡的已知原因之一，然而也有研究表明自噬在压力响应中对心脏具有保护作用。因此必须精确调节自噬活动以维持心脏稳态。临床数据显示，使用舒尼替尼作为癌症治疗的患者可能会发生心力衰竭。即使在终止使用舒尼替尼后，大多数患者也不能完全逆转，这限制了其临床应用。已有报道表明自噬激活和抑制都可能导致舒尼替尼治疗后大鼠H9c2心肌细胞或周细胞的死亡。然而尚缺乏对舒尼替尼治疗后心肌细胞自噬流的精确评估。

HMGB1是一种DNA结合核蛋白，对于协调自噬反应很重要。增加的细胞质或核HMGB1表达会通过不同通路促进自噬进展。此外，已有报道表明HMGB1是心肌缺血/再灌注损伤、心力衰竭和蒽环类药物诱导的心肌病的关键介质。本文作者之前发现舒尼替尼可以在癌细胞和非癌细胞中诱导HMGB1从细胞核到细胞质的转变，并促进TP53/p53的自噬降解。然而，HMGB1是否在桥接舒尼替尼诱导的自噬、心肌细胞死亡和心脏毒性方面发挥作用尚不清楚。

研究思路：

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恭喜 | 浙江大学药学院何俏军、罗沛华团队自噬诱导心肌细胞死亡机制喜发生物一区顶刊

泛癌lncRNA PLANE调节选择性剪接程序以促进癌症发病

The pan-cancer lncRNA PLANE regulates an alternative splicing program to promote cancer pathogenesis

研究对象：细胞系、人组织、小鼠模型

发表期刊：Nature Communications

影响因子：14.919

发表时间：2021年6月

合作单位：郑州大学

组学技术：蛋白质组学质谱鉴定(由鹿明生物提供技术支持)、RNA测序、免疫沉淀、qPCR、免疫荧光

研究背景：

前体mRNA(pre-mRNA)的选择性剪接(AS)是一种基本机制，单个基因可通过这种机制生成不同的成熟转录本，从而增强基因编码能力并增加功能多样性。剪接因子包括丝氨酸-精氨酸(SR)蛋白家族成员和异质核糖核蛋白(hnRNP)，它们通过与外显子或内含子调控序列相互作用来促进或抑制特定剪接事件。异常AS事件通过解除对细胞存活和增殖等基本细胞过程的调节，参与了包括癌症在内的许多疾病的发病机制。

NCOR2作为组装功能复合物的中央组织平台，抑制靶基因的反式激活。NCOR2 N端抑制结构域招募其他转录辅助抑制因子，而其C端相互作用结构域与核受体相互作用。值得注意的是，癌细胞中NCOR2的表达常发生改变。此外，研究发现长链非编码RNA (lncRNA)与癌细胞中AS的失调有关。LncRNA主要通过与剪接因子结合、与前体mRNA结合和影响染色质重塑来调节AS。

研究思路：

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项目文章 | 又一篇NC，郑州大学张旭东团队发表lncRNA PLANE促进癌症发病机制

VN1R5上调长链非编码RNA lnc-POP1-1通过与MCM5相互作用促进头颈部鳞状细胞癌顺铂耐药

Long noncoding RNA lnc-POP1-1 upregulated by VN1R5 promotes cisplatin resistance in head and neck squamous cell carcinoma through interaction with MCM5

研究对象：肿瘤组织、细胞、小鼠

发表期刊：Molecular Therapy

影响因子：11.454

发表时间：2021年06月08日

合作单位：上海交通大学医学院附属第九人民医院

运用组学关键技术：iTRAQ标记定量蛋白组组学、蛋白质谱鉴定(由鹿明生物提供技术支持)、表达谱芯片（由欧易生物提供技术支持）

研究背景：

头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）是由口腔、鼻腔和喉部粘膜鳞状细胞发展而来的癌症，是全球第七大常见癌症，每年约有60万例新发病例。由于其高局部复发率、高转移率和不良预后，HNSCC严重影响人类健康和生活质量。尽管外科手术、放疗和化疗的技术进步改善了HNSCC的局部控制，但HNSCC患者的5年生存率仍保持在60%左右。目前，顺铂是HNSCC最广泛使用的化疗药物。然而，一些患者出现顺铂耐药性，导致癌症复发，这种获得性耐药性是HNSCC患者顺铂治疗失败的主要原因。因此，研究导致HNSCC顺铂耐药的关键调控因素，探索顺铂耐药的分子机制，对于开发有效的治疗方法，提高HNSCC疗法的临床疗效具有重要意义。

研究发现，非核转录因子受体与HNSCC病的发生和发展密切相关，缺乏蛋白质编码潜力的RNA转录产物LncRNAs被认为在顺铂耐药性中起调节作用，已发现lncRNAs如MPRL、UCA1、KCNQ1OT1、HOTAIR和HOXA11-AS的表达水平与HNSCC的顺铂反应有关。然而，仍然迫切需要确定关键的功能性非特异性单克隆抗体，并阐明其促进顺铂耐药性的分子机制，以进一步提高HNSCC疗法的疗效。

研究思路:

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项目文章 | 医学一区TOP期刊！上海九院又一佳作：头颈部鳞状细胞癌顺铂耐药机制研究

不同分子量聚乙烯颗粒改变了玉米根际土壤微生物群落组成和代谢谱

Alterations of the rhizosphere soil microbial community composition and metabolite profiles of Zea mays by polyethylene-particles of different molecular weights

研究对象：聚乙烯颗粒、玉米、根际土壤

期刊：Journal of Hazardous Materials

影响因子：10.588

发表时间：2021年8月

发表单位：西南科技大学

运用组学技术：GC-MS非靶向代谢组学和16S rRNA测序(由欧易/鹿明生物提供技术支持)

研究背景：

农用地膜覆盖栽培技术具有升温、保土、保肥、保湿、加速土壤养分转化、抑制杂草生长等优点。农用塑料薄膜通常由聚乙烯（PE）制成，其分子结构稳定，在环境中的降解周期非常长，其长期积累会造成土壤耕层环境恶化，降低土壤通透性和水肥输送效率，影响作物生长和发育。近年来，环境可降解膜被认为是解决白色污染的有效途径之一。这种农用薄膜可以在较短的时间内破碎并降解成低分子量的粉末或颗粒（即微塑料）。然而，PE颗粒仍然具有很强的疏水性，在土壤中极难降解。因此，PE-颗粒对土壤微环境和作物生长的影响值得研究。

土壤中塑料碎片或颗粒的来源、分离、鉴定、迁移和潜在风险已被广泛研究。但目前的研究并未关注微塑料在环境中逐渐解聚形成不同分子量的微塑料的问题。这些不同分子量的微塑料对土壤微环境（如土壤代谢、土壤肥力、微生物群落结构等）和作物生长的影响尚不清楚。

研究思路：

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项目文章 | 第7弹：西南科技大学罗学刚团队再发环境科学与生态学TOP期刊

利用BADH2新等位基因生产芳香三系杂交稻

Production of aromatic three-line hybrid rice using novel alleles of BADH2

研究对象：水稻

期刊：Plant Biotechnology Journal

影响因子：9.803

发表时间：2021.08.31

发表单位：中国水稻研究所

运用组学技术：GC-MS顶空代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、基因编辑技术

研究背景：

香味是决定稻米烹饪和食用特性的独特和关键指标之一。甜菜碱醛脱氢2(OsBADH2)功能的丧失影响了2-乙酰-1-吡咯啉(2- ap)的生物合成，而2-乙酰-1-吡咯啉(2- ap)是香稻香气的主要来源。高品质香米的高需求和低供给直接导致了全球市场香米价格上涨。这也促使水稻育种家加快了开发新的高产香稻品种的速度，以满足消费者日益增长的香稻需求。传统育种或标记辅助育种技术用于芳香基因导入和芳香水稻基因型的选育往往费时费力，随着植物生物技术的进步，基因组编辑技术使现有香稻品种的改良和从非香稻品种中培育出香稻成为可能。

本研究旨在利用CRISPR/Cas9基因编辑技术，在粳稻宁粳1号(NJ1)和籼稻黄花展(HHZ)品种的遗传背景下，构建BADH2新等位基因。采用GC-MS顶空技术对BADH2等位基因系成熟籽粒进行性状分析。

研究思路：

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项目文章 | 胡培松院士团队：首次利用基因编辑创制香味改良三系杂交稻

新鲜藻类和腐烂藻类对淡水鱼的生物毒性：半数致死浓度、器官损伤和抗氧化反应

Biological toxicity of fresh and rotten algae on freshwater fish: LC50, organ damage and antioxidant response

研究对象：草鱼，鲫鱼，鲢鱼

期刊：Journal of Hazardous Materials

影响因子：10.588

发表时间：2021年

发表单位：复旦大学环境科学与工程系

运用组学技术：LC-MS非靶代谢组学(由鹿明生物提供技术支持) 、16S rRNA测序(由欧易生物提供技术支持)

研究背景：

近几十年来，富营养化导致的有害藻类大量繁殖使淡水生态系统中的生物被有毒细胞和溶解的毒素包围。这些生物不仅受到摄入蓝细菌和藻类毒素的威胁，还受到相关水污染的影响。与陆生动物相比，水生生物更容易受到有害生物和藻类毒素的影响，尤其是在水生食物网中处于较高营养水平的鱼类。有毒蓝藻降解过程中，藻细胞壁破裂后，毒素等物质释放到水中。这导致微囊藻毒素浓度增加，对鱼类有毒。藻毒素在浮游动物、贻贝、甲壳类动物和鱼类等水生生物中累积，并可转移到高等脊椎动物体内，具有潜在的致死和亚致死效应。

先前的研究主要都集中在单一物质对水生生物的毒性上，很少进行FAS和RAS的毒性研究。本文研究了FAS和RAS的组成和毒性，观察了FAS和RAS对鱼类的器官损伤，抗氧化反应和肠道微生物的影响，为藻类毒性及其对水生生物危害相关领域的研究提供依据。

研究思路：

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项目文章 | 16S+LC-MS非靶向代谢组学分析助力复旦大学探究新鲜藻类和腐烂藻类的毒性效应

肺腺癌中内源性谷氨酸通过依赖于ADCY10的YAP抑制作用决定铁死亡敏感性

Endogenous glutamate determines ferroptosis sensitivity via ADCY10-dependent YAP suppression in lung adenocarcinoma

研究对象：细胞系、肺腺癌组织、小鼠

期刊：Theranostics

影响因子：11.556

发表时间：2021年3月

发表单位：上海市胸科医院

运用组学技术：TMT标记定量蛋白组学（由欧易/鹿明生物提供技术支持）、免疫荧光、免疫组化、免疫印迹、免疫沉淀、ELISA、qPCR、 ChIP

研究背景：

2012年Dixon等人首次描述了铁死亡（Ferroptosis），这是一种与细胞凋亡和坏死不同的新型细胞程序性死亡方式。铁死亡的特征是通过铁依赖性机制对磷脂进行了过度的氧化修饰。许多方法通过抑制Xc-系统引发铁死亡[1]。索拉非尼，erastin及其衍生物是铁死亡激活剂，这些分子阻止胱氨酸进入细胞，从而减少谷胱甘肽（GSH）的产生。而抑制摄取胱氨酸的同时会降低内源性谷氨酸外排[2]。迄今为止，许多研究已经报道了胱氨酸的关键作用，但是对于内源性谷氨酸积累后的结果知之甚少。

肺腺癌（LUAD）是常见的恶性肿瘤，手术切除是早期LUAD最有效的治疗方法，而晚期患者可从辅助细胞毒性疗法中受益。但是耐药性通常是LUAD复发的主要原因。最近有研究报道对顺铂耐药的肿瘤细胞对铁死亡很敏感[3]。但是不同的LUAD细胞对铁死亡的敏感性不同，其潜在机制仍不清楚。

研究思路：

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项目文章 | 上海市胸科医院孙加源团队揭示肺腺癌中铁死亡敏感性的机制

HOXC6通过协调DKK1/Wnt/β-catenin轴促进右半结肠癌转移的机制研究

HomeoboxC6 promotes metastasis by orchestrating the DKK1/Wnt/β-catenin axis in right-sided colon cancer

研究对象：细胞系、结肠癌组织、小鼠

期刊：Cell Death & Disease

影响因子：8.469

发表时间：2021年4月

发表单位：浙江大学医学院附属第二医院

运用组学技术：蛋白质质谱鉴定、免疫组化、免疫荧光、免疫印迹、qPCR、ELISA、Co-IP、双荧光素酶报告基因检测

文章中蛋白质质谱鉴定由欧易/鹿明生物提供技术支持

研究背景：

结直肠癌（CRC）是全球范围内发病率与死亡率排第三的恶性肿瘤。临床发现，右半结肠癌（RCC）患者的预后比左半结肠癌（LCC）患者明显差。对左右半结肠癌的分子差异方面进行研究，发现与LCC相比，HOXC6是RCC中上调最显著的基因。有诸多研究表明HOXC6在各种癌症如乳腺癌，肺癌，前列腺癌，白血病等中均被上调并起着至关重要的作用，然而目前有关HOXC6在CRC中作用的具体机制尚不清楚。

大肠癌的治疗方法除手术、放疗、化疗及靶向治疗之外，免疫治疗已经进入大肠癌领域。免疫微环境中成分复杂，虽已有研究表明M2型肿瘤相关巨噬细胞（TAM）、辅助性T细胞以及肿瘤相关成纤维细胞均有促进肿瘤的作用，M1型TAM、CD8+T细胞及NK细胞具杀伤肿瘤的作用，但对肿瘤微环境（TME）的了解仍然有待进一步研究，对揭示造成肿瘤免疫逃逸的原因以及开发新的免疫治疗靶点至关重要。

研究思路：

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项目文章 | 浙大二院郑树/胡望雄团队揭示HOXC6促进右半结肠癌转移机制

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