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近年研究表明，lncRNA会广泛参与到染色体沉默、基因组印记、染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程。根据lncRNA在基因组上相对于蛋白编码基因的位置，可以将其分为sense、antisense、bidirectional、intronic、intergenic这5种类型。这种位置关系对于推测lncRNA的功能有很大帮助，这些功能包括：

1. LncRNA可以招募染色质重构和修饰复合体到特定位点，改变DNA/RNA甲基化状态、染色体结构和修饰状态，进而控制相关基因的表达；

2.  LncRNA可以结合到基因转录产生的RNA上，控制RNA转录、定位和稳定性；

3. LncRNA还会直接参与到mRNA转录后调控过程中，包括可变剪切、RNA编辑、蛋白翻译及转运等过程；

4. LncRNA通过控制miRNA表达来影响其靶基因的表达量，即ceRNA调控网络；

今天我们就给大家分享一些lncRNA研究的高分文章。

LncRNA功能：LncRNA与编码基因共表达

发表期刊：Science translational medicine

影响因子：17.161

研究领域：Schizophrenia (SCZ)

文章思路：作者假设CNV-LncRNAs可能通过调节共表达的SCZ相关基因而参与SCZ的病因学。为了验证这一假设，文章检索了带注释的lncRNA，映射到10个与SCZ风险相关的CNV缺失。基于PsychENCODE BrainGVEX和Developmental Capstone项目的脑转录组数据，使用加权基因共表达网络分析（WGCNA），从无精神病患者的死后对照脑组织样本中鉴定出与CNV-LncRNA共表达的蛋白质编码基因。然后，根据神经元模块与本征基因的相关性，将神经元模块中的枢纽CNV-lncRNAs定位为相互联系最多的lncRNA。最后，我们在人类神经祖细胞（hNPC）中使用联用GOF(DGCR5过表达质粒由吉凯基因提供)和LOF技术研究DGCR5功能，以验证CNV-IncRNA与SCZ相关蛋白编码基因之间的预测调控关系。

LncRNA功能：LncRNA与核糖核蛋白结合调控目标mRNA稳定性

发表期刊：The Journal of Clinical Investigation

影响因子：12.282

研究领域：rheumatoid arthritis (RA)

文章思路：文章鉴定出一个在在类风湿性成纤维细胞样滑膜细胞中低表达的LncRNA-LERFS，该LncRNA通过与异质核糖核蛋白Q（hnRNP Q）相互作用，进而负调控成纤维细胞样滑膜细胞(FLSs)的迁移，侵袭和增殖。在健康条件下，通过与RhoA，Rac1和CDC42（控制FLS活力和增殖的小GTPase蛋白）的mRNA结合，LERFS-hnRNP Q复合物降低了目标mRNA的稳定性或翻译并下调了它们的蛋白水平。但是在RA FLS中，低表达的LERFS会导致LERFS-hnRNP Q复合物减少，从而降低hnRNP Q与靶mRNA的结合，从而增加靶mRNA的稳定性或翻译。文章使用的LERFS过表达慢病毒同样由吉凯基因提供。

LncRNA功能：LncRNA海绵体(Sponges)功能

发表期刊：Journal of Cachexia, Sarcopenia and Muscle

影响因子：10.754

研究领域：骨骼肌萎缩

文章思路：采用Microarray微阵列分析技术鉴定成年和老年小鼠骨骼肌中lncRNA的差异表达，鉴定出一种新的lncRNA（肌肉合成代谢调节物1，MAR1）。文章通过生物信息学分析预测验证了microRNA-487b是MAR1的直接靶标。新鉴定的lncRNA MAR1可作为miR-487b海绵调节Wnt5a蛋白，从而促进肌肉分化和再生。此外，通过局部过表达或敲低（过表达慢病毒和干扰慢病毒均由吉凯基因提供）骨骼肌中lncRNA来研究lncRNA在体内的生物学功能，评估了lncRNA过表达在年龄相关性或机械性卸载引起的肌肉萎缩中的治疗效果。MAR1可能是治疗因衰老或机械负荷引起的肌肉萎缩的新型治疗靶标。

ceRNA调控网络预测结果

LncRNA功能：LncRNA与蛋白复合物相互作用

发表期刊：Nucleic Acids Research

影响因子：11.147

研究领域：前列腺癌

文章思路：首先发现了PI3K/AKT和NFkB信号通路在进展为去势抵抗性前列腺癌过程中重新被激活，通过基因沉默及蛋白免疫共沉淀等实验发现了长链非编码RNA PCAT1能够竞争性抑制PHLPP与FKBP51的结合，促进IKKalpha与FKBP51的结合，进一步在细胞以及动物层面研究了PCAT1在去势抵抗进展中的作用及调控FKBP51/PHLPP/IKKalpha蛋白复合体的分子机制。文章使用的PCAT1过表达慢病毒由吉凯基因提供。

PCAT1介导的AKT和NF-B信号通路激活模型

LncRNA功能：LncRNA海绵体(Sponges)功能/转录调控

发表期刊：Cell Death & Disease

影响因子：5.959

研究领域：前列腺癌（PCa）

文章思路：作者首先对TCGA数据库中PCa肿瘤转录组数据库进行挖掘，发现了一系列在PCa中表达上调的LncRNA，作者选取了LncRNA FOXP4-AS1进行了临床标本验证。LncRNA FOXP4-AS1在PCa的肿瘤发生中发挥致癌作用。LncRNA FOXP4-AS1通过在PCa中充当ceRNA转录miR-3184-5p来转录后调控FOXP4。进一步的机制分析表明PAX5在PCa中转录激活了LncRNA FOXP4-AS1和FOXP4。总体而言，文章确定PAX5诱导LncRNA FOXP4-AS1 / FOXP4轴上调促进了PCa的肿瘤发生。文章中使用的pcDNA-FOXP4-AS1、pcDNAFOXP4、pcDNA-PAX5过表达质粒均由吉凯基因提供。

除了上述分享的文章，2019年使用吉凯基因产品发表的LncRNA文章对应期刊还有Cancer research（IF：8.378）、Theranostics（IF：8.063）、Cardiovascular research（IF：7.014）、EBioMedicine（IF：6.68）、Cell Death & Disease（IF：5.959）、Aging-US（IF：5.515）等期刊，涉及肿瘤发生、胰腺癌、钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)、前列腺癌、胃癌、糖尿病肾病等领域。

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封面图片@Walid beno