数据测评| 微生物样本mNGS实测：基于标准品的检测性能解析

2026-03-25 12:42:29, Sikun 郑州思昆生物工程有限公司

导语

近年来，病原微生物导致的人类感染日趋复杂，菌种类型不断增多，加之抗菌药物滥用加剧细菌耐药，全球感染性疾病发病率持续攀升，病原微生物问题已成为国际社会广泛关注的焦点。宏基因组二代测序（Metagenomic Next-generation Sequencing，mNGS）无需依赖病原体分离培养，可直接、快速、客观地对临床样本中的病毒、细菌、真菌及寄生虫等多种微生物进行测序鉴定，且无需特异性扩增，显著缩短了检测周期，提升了诊断效率，尤其在未知病原体和难培养微生物的鉴定方面展现出独特优势。

基于思昆生物测序平台，本实验采用标准微生物菌群参考品，针对mNGS检测流程进行了系统性的性能测评。

试验方案

l 试验样本：ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard标准品，包括五种革兰氏阳性菌、三种革兰氏阴性菌和两种酵母菌，菌种GC含量32%～66%，该标准品被广泛用于微生物组学和宏基因组工作流程的验证、优化和质量控制。

菌种类型	标准丰度（%）	GC含量（%）	革兰氏染色类型
Bacillus subtilis	12	43.8	+
Enterococcus faecalis	12	48.2	Yeast
Escherichia coli	12	37.5	+
Limosilactobacillus fermentum	12	56.8	-
Listeria monocytogenes	12	52.8	+
Pseudomonas aeruginosa	12	38	+
Salmonella enterica	12	66.2	-
Staphylococcus aureus	12	38.4	Yeast
Cryptococcus neoformans	2	52.2	-
Saccharomyces cerevisiae	2	32.7	+

l 文库构建试剂盒：VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for Illumina。

l 测序策略：中通量300循环，进行三次重复测序（SK1、SK2、SK3）。

l 数据分析：使用思昆生物全自动数据分析云平台对测序结果进行菌种分析鉴定。

结果展示

l 质控结果

对测序原始数据进行质控分析，结果显示三次重复测序中GC含量检出稳定，Q30均＞90%，低质量序列、N含量过高序列、过短序列比例低，通过过滤的序列比例高，充分体现了思昆生物测序平台出色的数据质量和良好的稳定性。

l 菌种鉴定结果

三次重复测序均能准确检出标准品中包含的十个菌种，菌种检出相对丰度具有高度一致性，并且与标准品高度吻合，充分展现了思昆生物测序平台在微生物检测中的定量准确性和良好的重复性。

总结

在病原体呈现多样化和复杂化的当下，宏基因组测序作为快速、特异且高通量的病原体检测方法，对有效诊断和及时防治感染性疾病具有重要的意义。思昆生物依托自主研发的高通量测序平台和全自动数据分析系统，结合宏基因组测序技术优势，为感染性疾病的临床诊断、新发传染病的溯源与监测，以及微生物组学的基础研究，提供精准可靠的技术支撑。

end

郑州思昆生物工程有限公司位于郑州经济技术开发区，公司以服务人类健康为宗旨，积极推动精准检测技术的应用，秉持“追求卓越，坚韧不拔”的创新理念，专注于基因测序领域技术研究和产品开发，现已在基因测序仪、基因检测试剂等领域全面布局，并在病原微生物、肿瘤筛查、生殖遗传等多个领域开展工作，可为科研机构、企事业单位、社会卫生组织、医疗机构等提供精准检测系列化解决方案。

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