如何分析质谱碎片?

2026-01-09 13:59:25, 色谱冢 月旭科技



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在质谱分析的过程中,我们往往只需要记录质谱碎片的质荷比,并以其定性定量即可,然而却很少对具体的碎片结构进行构建。

那么,为什么要对碎片的具体结构进行构建呢?这是因为,通过“画”出碎片的具体结构,可以让我们更好地了解化合物在质谱中的裂解机理。

首先,我们先来了解一下化合物在质谱中是如何产生碎片的。当化合物在离子源中与相应的离子结合而完成离子化后,会进入四极杆,并在飞行过程中与氦气发生碰撞,从而产生碎片,这个过程是一个物理反应

试想一下,我们用一个锤子随机砸向一块木板的任意位置,这块木板一定会从最脆弱的地方开始裂开;如果我们事先在木板上划出一条痕,那么木板就很有可能沿着这条痕裂开。而决定这条“痕”的位置和深度的,就是化学键的极性。

没错,不但分子本身有极性,键也有极性。我们之前谈到过,分子的极性来源于正负电荷中心的差距,即偶极矩,这与基团的电负性和位置有关,其本质就是电子云的偏移。

而键也有电子云的偏移,这取决于成键的两个原子的电负性差异,如C-F键和C-H,由于F的电负性要大于H,其共用的电子对也会更偏向于F一端,因此,C-F键的极性要更大对于其他键也是一样,这决定了该共价键受到碰撞时,其碎裂方式是异裂还是均裂。

以上面的酯类化合物为例,一般情况下,酯类通过酸和醇脱水合成得到,该C-O键水解也可得到酸和醇,这是可逆反应,因此该C-O键并不牢固,在氦气的碰撞下,容易在该位置发生断裂,而断裂的方式有两种,如上图所示。

异裂,顾名思义是指C和O在分开的时候对电子的分配产生了“异议”。由于O的电负性大于C,该C-O键本身的共用电子对就会偏向于O,因此断裂时,O会带走所有电子,从而生成带O的负电离子和带C的正电离子。如果使用正模式和负模式,可分别观察到这两个碎片。

均裂则是平均分配的意思,即C和O分别各带走一个电子,形成两个独立的中性粒子。针对这个化合物而言,哪种情况更常见呢?答案显然是“异裂”。还是由于O的电负性大于C的原因,导致含O的碎片更容易带有负电。

那为什么又会出现均裂的现象呢?这是因为含C的碎片也含有C=O,其O的电负性也会在一定程度上帮助C获得电子,但是由于其对C-O键的影响有限,因此最多也只能帮C拿到一个电子。

另外,按照传统认知,中性粒子会在四极杆中丢失,但这两个碎片很可能也会带有H+、Na+等离子,因此总体上看,仍有可能以离子的形式存在于质谱中。因此,如果我们以正模式来采集碎片,那么很可能会出现以下两种碎片。



这两个碎片来源于不同的碎裂方式,但按照上述的分析来看,显然m/z 43的响应要高于m/z 44。如果缺乏这样的分析思路,我们很可能会直接认为m/z 44是m/z 43的同位素,因为其响应确实更低。

正是通过碎裂机理与结构构建的思维方式,我们才能为现象解释和机理分析提供更多可能,使结论更加严谨,而不是对问题“一棒子处理”。

作者:色谱冢(月旭公众号签约撰稿人)

排版:赵林

审核:朱晗斐

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