蛋白聚集与相分离:理解阿尔茨海默症的病理新机制

2025-04-11 10:27:16, 景辉 丹纳赫生命科学



阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease, AD)作为一种常见的神经退行性疾病,其复杂的病理机制至今尚未完全阐明。传统上,AD的病理主要归因于β-淀粉样蛋白(Aβ)沉积与tau蛋白异常磷酸化形成神经原纤维缠结。然而,近年来研究通过研究蛋白聚集过程中的液液相分离(Liquid–Liquid Phase Separation, LLPS)现象为理解AD病理提供了全新的视角。


LLPS是指蛋白和核酸等大分子在适宜条件下自发形成液滴样、动态平衡的相分离结构,这一过程在细胞内形成无膜结构区室,有助于调控生物化学反应和信号传导;而当LLPS调控失衡时,可能导致蛋白聚集和不可逆沉积,最终引发细胞功能异常与神经元退行性变。

 

液液相分离(LLPS)是指在适宜的温度、盐浓度和蛋白浓度等条件下,某些多价相互作用驱动的蛋白或蛋白—核酸混合物从均一溶液中分离出液滴样结构,这些液滴具有动态交换和可逆性,构成了细胞内的无膜区室。近年来,LLPS已被证明在细胞内多种生物过程中发挥重要作用,如RNA加工、信号转导及应激颗粒的形成[1]。LLPS能够通过调控生物大分子的浓度和相互作用,使生化反应得以在特定的空间范围内高效进行。例如,在RNA加工过程中,LLPS促进剪接体的组装和mRNA转运,而在应激条件下,细胞通过LLPS形成应激颗粒(stress granules),以保护mRNA免受降解。此外,LLPS在蛋白质折叠与错误折叠相关的蛋白聚集中也扮演关键角色。


P颗粒在秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)胚胎中表现LLPS 的特性(图源:doi: 10.1146/annurev-cellbio-100913-013325.)


LLPS与神经退行性疾病的关联

在神经系统中,LLPS被发现参与了突触前后的蛋白复合体形成以及神经元信号传递的调控。一些关键蛋白,如tau、FUS、TDP-43等,均显示出通过LLPS形成液滴状结构的特性,这种现象在维持正常细胞功能和应对外界刺激中具有重要意义。然而,当细胞内环境发生改变(如pH值、温度、离子浓度异常)时,LLPS平衡可能被打破,导致液滴从动态可逆状态转变为固态或不可逆的聚集物,进而形成病理性沉积[2]


近年来的研究显示,LLPS现象与多种神经退行性疾病密切相关。在AD中,tau蛋白和Aβ蛋白均被发现具有通过液液相分离实现初步聚集的能力。正常情况下,tau蛋白可通过LLPS形成动态液滴,这一过程有助于调控微管稳定性和神经元信号传递;但在病理状态下,异常的tau相分离过程可能导致液滴凝聚为不可逆的纤维或神经原纤维缠结,破坏神经元结构与功能[3]


Tau蛋白的异常相分离可导致聚集并形成NFTs,引发神经元退化(图源:doi:10.1016/j.nbd.2023.106011)


同样,部分研究表明Aβ蛋白也可能经历初期的液液相分离过程。其在AD病理中主要以淀粉样斑块的形式沉积在细胞外。但是,Aβ蛋白在初期也可能通过液液相分离形成可逆液滴状态,这一过程有助于在细胞外环境中调控Aβ的聚集;而在病理条件下,这些液滴逐渐转变为不可逆的沉积物,形成致命的神经毒性斑块[4]


LLPS过程受到多种因素的调控,包括蛋白本身的低复杂度区域(LCD)、多价相互作用、蛋白浓度以及环境条件(如温度、盐浓度和pH值)。此外,翻译后修饰(如磷酸化、乙酰化)也对LLPS过程有显著影响。在AD中,对于tau蛋白和Aβ蛋白来说,初期的液滴状态往往是可逆的,有利于调控蛋白质功能和降解;而当细胞内外环境发生改变或翻译后修饰异常时,这种可逆性可能丧失,导致蛋白聚集物的不可逆沉积。例如,tau蛋白的磷酸化状态可改变其LLPS行为,低磷酸化状态下可能形成可逆液滴,而高磷酸化状态则倾向于形成稳定、不可逆的聚集物理解这一转变的动力学过程,不仅有助于揭示AD的病理进程,还为开发干预策略提供了新靶点。例如,通过调控蛋白质磷酸化水平或增强蛋白质降解途径,可能恢复液滴的可逆性,防止不可逆聚集的形成,这一调控机制为理解AD中tau蛋白异常聚集提供了重要思路。


实验室如何研究和解析

蛋白聚集与相分离现象

在实验室中,研究者采用细胞内和胞外两种实验方法来研究蛋白的液液相分离(LLPS)现象。对于细胞内实验,研究者通常利用神经元细胞系或初级神经元培养模型,在适宜的温度、盐浓度及pH值条件下,使目标蛋白(如tau或Aβ)在细胞内自发形成液滴。随后,细胞固定后使用特异性荧光标记抗体对目标蛋白进行染色,并通过荧光显微镜或共聚焦成像系统观察细胞内液滴的形态和动态变化。此外,为了进一步解析液滴内部的分子构成和翻译后修饰,研究者会提取蛋白,并利用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS)分析聚集体,获取蛋白修饰状态和聚集模式的详细信息。


Tau蛋白经历LLPS聚集形成神经原纤维缠结(图源:doi:10.15252/embj.201798049)


Wegmann et al在2018年的研究揭示了Tau蛋白在阿尔茨海默症(AD)病理中可能经历液液相分离(LLPS),这一过程可能是Tau蛋白聚集并形成神经原纤维缠结(NFTs)的关键中间步骤[5]。为了探究这一机制,研究者首先在体外实验中利用重组Tau蛋白(磷酸化或突变型),在特定的分子拥挤环境(如Ficoll-400或PEG)下观察Tau液滴的形成,并通过荧光显微镜分析其相变特性。在细胞实验中,研究者在神经元和其他细胞中表达Tau-GFP,并利用荧光恢复实验(FRAP)测量Tau液滴的流动性,观察其在神经元轴突中的运动及其动态变化。此外,研究者对比了不同磷酸化状态的Tau蛋白,发现磷酸化显著促进了Tau液滴的形成,并最终导致不可逆聚集。在长期培养实验中,研究者对Tau液滴进行长时间(1天、10天)的观察,发现液滴经历了从“液体态→凝胶态→固态聚集体”的转变,并通过Thioflavin-S染色验证了聚集体的β折叠结构。最后,研究者从AD患者脑组织中提取高分子量磷酸化Tau蛋白,发现其同样可以经历LLPS并诱导Tau聚集。这一研究表明,LLPS可能在AD病理进展中起到重要作用,而磷酸化调控则是Tau聚集的关键因素。


对于胞外实验,研究者通常在体外重组纯化目标蛋白(如tau或Aβ),并在特定缓冲液(如Tris-HCl、PBS)中调控盐浓度、pH值和温度,以诱导LLPS的发生。在这种条件下,蛋白可自发形成液滴,研究者可利用荧光显微镜或动态光散射(DLS)技术观察液滴的形成与稳定性。此外,通过加热、超速离心或添加不同离子溶液,研究者可以探究环境因素对LLPS的影响。为了进一步分析蛋白相分离后的分子组成,研究者可采用冷冻电镜(Cryo-EM)或核磁共振(NMR)解析蛋白聚集的结构特征。


胞外诱导LLPS生成与分析(图源:doi:0.1038/s41598-024-72265-7)


Guo et al研究探讨了Aβ40在液-液相分离(LLPS)条件下的聚集行为,揭示了一种新的淀粉样纤维形成机制[6]。研究采用微流控系统生成Aβ40水-油微滴,并通过PEG和Claramine诱导LLPS。荧光显微镜观察到Aβ40形成液滴状凝聚体,并经历奥斯特瓦尔德熟化和融合,表明其最初为液态。ThT实验和TEM证实,凝聚体随后发生液-固转变,最终形成淀粉样纤维。动力学分析表明,1:1的Aβ40:Claramine比例最有利于聚集,且Claramine浓度过高或过低均会抑制成核。该研究表明,Aβ40可能通过LLPS进入高浓度凝聚体,再转变为淀粉样聚集体,为阿尔茨海默病的Aβ聚集机制提供新视角,并可能为疾病干预提供新靶点。


总结与展望

蛋白聚集与液液相分离为理解阿尔茨海默病的新病理机制提供了重要视角。展望未来,通过国际合作与多学科整合,我们有理由相信,在解析蛋白相分离与聚集动态机制以及开发针对性干预措施方面将取得重大突破。这不仅为早期诊断和治疗AD提供了新方法,也为深入理解神经退行性疾病的复杂病理机制提供了坚实的理论基础。只有在细胞、分子和系统层面实现精准调控,才能真正缓解AD病理进程,提高患者生活质量。


参考文献

1. Hyman, A. A., et al. (2014). Liquid–Liquid Phase Separation in Biology. Nature Reviews Molecular Cell Biology. [cite Hyman2014]

2. Boeynaems, S., Alberti, S., Fawzi, N. L., Mittag, T., Polymenidou, M., Rousseau, F., Schymkowitz, J., Shorter, J., Wolozin, B., Van Den Bosch, L., Tompa, P., & Fuxreiter, M. (2018). Protein Phase Separation: A New Phase in Cell Biology. Trends in cell biology, 28(6), 420–435.

3. Ainani, H., Bouchmaa, N., Ben Mrid, R., & El Fatimy, R. (2023). Liquid-liquid phase separation of protein tau: An emerging process in Alzheimer''s disease pathogenesis. Neurobiology of disease, 178, 106011.

4. Gui, X., Feng, S., Li, Z., Li, Y., Reif, B., Shi, B., & Niu, Z. (2023). Liquid-liquid phase separation of amyloid-β oligomers modulates amyloid fibrils formation. The Journal of biological chemistry, 299(3), 102926.

5. Wegmann, S., Eftekharzadeh, B., Tepper, K., Zoltowska, K. M., Bennett, R. E., Dujardin, S., Laskowski, P. R., MacKenzie, D., Kamath, T., Commins, C., Vanderburg, C., Roe, A. D., Fan, Z., Molliex, A. M., Hernandez-Vega, A., Muller, D., Hyman, A. A., Mandelkow, E., Taylor, J. P., & Hyman, B. T. (2018). Tau protein liquid-liquid phase separation can initiate tau aggregation. The EMBO journal, 37(7), e98049.

6. Morris, O. M., Toprakcioglu, Z., Röntgen, A., Cali, M., Knowles, T. P. J., & Vendruscolo, M. (2024). Aggregation of the amyloid-β peptide (Aβ40) within condensates generated through liquid-liquid phase separation. Scientific reports, 14(1), 22633. 


丹纳赫生命科学解决方案

辅助液液相分离(LLPS)研究



Leica Microsystems的STELLARIS共聚焦显微镜是研究液液相分离(LLPS)过程中蛋白质动态行为的重要工具。该显微镜采用White Light Laser(WLL)技术,提供可调波长的激光照射,实现高灵敏度的多色成像。此外,Stellaris配备TauSense技术,能够解析荧光寿命信号,以区分不同的蛋白质状态和相互作用。在LLPS研究中,Stellaris共聚焦显微镜主要用于实时追踪液滴形成、融合及相变过程。其超高分辨率模式能够精确测量液滴内蛋白质的分布,并结合荧光恢复实验(FRAP)量化液滴的流动性和可逆性。结合STED超分辨率成像,Stellaris可以解析液滴内部的分子结构,为理解蛋白聚集与阿尔茨海默症(AD)中的病理机制提供关键数据。




贝克曼库尔特生命科学的Optima XPN系列超速离心机辅助研究液液相分离(LLPS)过程中蛋白质聚集和动力学变化。该设备可在极高转速下实现高效分离和纯化,为蛋白液滴的形成与演变提供精确的实验支持。在LLPS研究中,Optima超速离心机用于分离不同相状态的蛋白质,帮助研究者分析液滴的形成、稳定性及其转变过程。例如,通过调节转速和离心力,可以实现对液滴和沉淀物的分离,从而区分可逆和不可逆聚集体。此外,结合密度梯度离心,研究者能够进一步解析蛋白质在相分离过程中的浓度分布,并评估环境因素(如pH值、离子强度)对LLPS行为的影响。




SCIEX的ZenoTOF® 7600高分辨质谱能够助力液液相分离(LLPS)研究中的蛋白质修饰和相互作用分析。该质谱仪结合Zeno trap技术和高分辨率飞行时间(TOF)分析,实现了更高的灵敏度和精确度。在LLPS研究中,ZenoTOF 7600可用于检测相分离液滴内部的蛋白组成,分析蛋白翻译后修饰(PTMs)如磷酸化、乙酰化及泛素化对LLPS的影响。此外,该仪器的高分辨率能力可用于解析蛋白质-蛋白质相互作用,揭示关键调控因子在相分离过程中的作用。



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