2023-11-27 16:22:45, Create 科瑞恩特(北京)科技有限公司
关键词:Maize玉米;Polysaccharides多糖;Mass spectrometry imaging质谱成像;Oligosaccharides低聚糖;Enzymes酶
酶是在生物细胞里产生的、以蛋白质为主要成分的生物催化剂,它广泛应用于食品加工业、饲料加工业、环境保护和医药工业等诸多领域。酶也广泛应用于玉米湿磨工业,在玉米湿磨过程中,利用酶降解包裹淀粉颗粒的细胞壁多糖已被证明可以提高淀粉和蛋白质的提取率。玉米中含有复杂的阿拉伯木聚糖,且与小麦、黑麦、大麦和高粱中的阿拉伯木聚糖相比,玉米中的阿拉伯木聚糖结构更具多样性,酶底物也更复杂。为了进一步了解酶在玉米种子中对多聚糖的分解能力,本研究通过AP-SMALDI MSI来可视化分析经过酶处理后玉米种子中寡糖的分布情况,以期获得更多玉米种子中酶底物的化学和分布信息。
2022年11月,丹麦哥本哈根大学Jonatan R. Granborg团队在Journal of Cereal Science发表了题目为“Variation in oligosaccharide profiles observed with AP-MALDI in different regions of maize kernels after treatment with xylanases”的文章,该文章在用淀粉酶预处理过的玉米种子冷冻切片表面喷洒三种不同的木聚糖酶(GH5_21, GH5_34和GH30_8),并利用AP-SMALDI MSI对三种木聚糖酶处理后形成的低聚糖降解产物及其在玉米种子中的分布进行比较,结果显示玉米种子中阿拉伯木聚糖的结构和组成因种子中的位置而不同。
将干玉米粒在超纯水中浸泡17 h,然后进行冷冻切片,在玉米种子内胚乳和胚芽共同存在部分收集厚度为10 μm的冷冻切片,之后放置在真空干燥器中使样品干燥并去除包埋剂。
为了去除淀粉,将干燥后的样品转移到装有10 mM醋酸铵缓冲液(内含50 ppm的α-淀粉酶(GH13_1))的50 mL离心管中,于40 ℃孵育24小时。
孵育后,样品用超纯水冲洗两次,并在通风柜中干燥2 h。
用盖玻片覆盖住载玻片上样品的1/2,另一半用含有50 ppm的GH5_21、GH5_34或GH30_8的10 mM醋酸铵缓冲液(pH 5.0)喷涂。
喷涂后,将样品快速转移到含有500 mL饱和硫酸钾溶液的密封塑料容器中,以保持顶空相对湿度为96%。
将样品连同塑料容器在40 ℃孵育17 h之后,再将样品在真空干燥器中干燥30 min。
干燥后的样品表面喷涂THAP后进行AP-SMALDI质谱成像分析。
图1 样品制备和数据采集的工作流程。1. 干玉米粒的复水。2. 对包埋在冰中的冷冻玉米种子进行冷冻切片。3. 用α-淀粉酶(GH13_1)孵育去除淀粉。4. 在冷冻切片的一半上应用不同的酶溶液,同时用盖玻片覆盖另一部分。5. MALDI基质溶液的喷涂。6. MALDI成像实验和数据采集。
图2 两个玉米粒经木聚糖酶处理后,仅由戊糖或己糖组成的低聚糖的累积强度的质谱图像,以TIC的百分比表示。
GH5_21和GH5_34处理后,含有己糖醛酸的寡糖位于2号玉米种子的角质胚乳中和1号玉米种子的大部分胚乳中。当用GH30_8处理时,己糖酸在1号玉米种子中明显可见,主要位于种子左下的角质胚乳中的一小部分区域。(图3)
图3 左边是1号玉米种子和2号玉米种子的照片。右边红色部分为Pen4FA(m/z 745.2162),蓝色部分为Pen4HexA(m/z 745.2009),绿色部分为己糖胺(m/z 524.2062)的质谱图像。
如图4所示,单一阿魏酸取代基修饰的低聚糖一般在胚芽附近的胚乳中聚集,在内果皮内和糊粉层内也有少量分布。相反,由两个阿魏酸单位修饰的低聚糖或由脱羧的8-5′-脱氢阿魏酸修饰的低聚糖则分布在整个胚乳中。
图4 左图为低聚糖PenxFA2和PenxFA1Hex1在玉米种子中的质谱图像,右图为Penx-8-5′-DFAdc和PenxFA1在玉米种子中的质谱图像,强度显示为TIC的百分比。
含有乙酰基的低聚糖主要在玉米种子的胚芽、糊粉层和种皮边缘分布较多,在胚乳内分布较少;而未乙酰化的低聚糖则主要分布在玉米种子的核部分。但PenxAc1HexA1类寡糖是个例外,PenxAc1HexA1是最丰富的寡糖种类,在很多方面都不同于其它乙酰化的寡糖,其在整个玉米种子内都有分布。(图5)
图5 左图为乙酰基修饰的低聚糖在玉米种子中的质谱图像,右图为没有乙酰基修饰的低聚糖在玉米种子中的质谱图像,强度显示为TIC的百分比。
通过对质谱图像的观察以及对玉米种子不同区域提取的离子信号平均强度进行对比,对经过酶处理后玉米种子中的低聚糖谱进行比较,发现从胚乳向外,寡糖强度逐渐下降。在不同玉米切片中,寡糖的强度不同,但经同种酶处理后的低聚糖图谱总体趋势相似。
图6 顶部:1号玉米种子(左)和2号玉米种子(右)的照片,并绘制了数据提取区域。蓝色区域代表胚芽附近的胚乳。灰色区域代表远离胚芽的胚乳(仅存在于1号玉米种子的冷冻切片中)。红色区域代表靠近胚芽的胚乳。绿色区域代表远离胚芽的胚乳。底部:如表S1中所述的低聚糖的所有平均离子强度的累积总和,即TIC的百分比。
GH5_21和GH5_34给出了非常相似的寡糖谱,表明在用这些木聚糖酶处理后可检测到相同的寡糖。然而用GH5_34处理的样品的低聚糖丰度明显较高,并且受所分析样品来源的位置的影响较小,详情见图6。另一个有趣的趋势是,低聚糖在玉米种子上的分布随低聚糖的长度而变化,最长的低聚糖通常位于胚芽附近,而短的低聚糖则主要在胚乳中分布,详情见图7。
图7 Pen2-13在1号玉米种子(上)和2号玉米种子(下)中的分布,左列为经GH5_21处理后,右列为经GH5_34处理后,强度显示为TIC的百分比。
总的来说,GH30产生的寡糖少于GH5_21和GH5_34。如图8所示,GH30发生了变化,而GH5没有变化,表明除了种子内不同区域的寡糖分布变化外,种子之间也发生了变化。种子间阿拉伯木聚糖醛酸修饰的差异可能与GH30是一种葡萄糖醛酸木聚糖特异性木聚糖酶有关。此外,与GH5_21和GH5_34相比,1号玉米种子中GH30分解得到的寡糖更长,低聚糖的修饰种类也更多。
图8 1号玉米种子和2号玉米种子经GH5_21、GH5_34和GH30处理后的修饰较少的低聚糖分布(左列)和修饰较多的低聚糖分布(右列)。
本研究开发了一种新的基于AP-SMALDI的MSI方法来分析玉米种子中木聚糖酶降解阿拉伯木聚糖后形成的低聚糖,提供了降解产物的化学信息和空间信息。研究结果显示了几种带侧链的寡糖的分布,增加了对玉米种子中不同区域多糖成分的了解。
该方法还为玉米种子中不同区域底物的酶活性提供了新的见解,表明阿拉伯木聚糖的结构和组成因种子中的位置而不同。这一发现对于确定靶向降解玉米中保留淀粉颗粒的阿拉伯木聚糖结构的合适酶具有重要意义。
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