ABI小贴士 | 实时荧光定量PCR不完全使用指南

2023-02-21 12:51:00 赛默飞世尔科技生命科学产品


看到上一期的陷阱专题大家这么喜欢,小编ABI我这颗玻璃心总算保住啦~


当然,不能光我一个劲儿的跟大家说啊,作为一个心地善良、美丽又大方的骚年~


倾听、解答是我的必备技能啊!

所以一不做二不休,小编ABI再奉上诚意干货大礼!



话不多说,上菜!


PCR结果只有熔解曲线,无扩增曲线,这是为什么?

可能是由于在PCR循环步骤没有设置采集荧光的步骤,而熔解曲线默认采集荧光,所以只有熔解曲线,没有扩增曲线。


(在set up的run methods里如果把40个扩增时601分钟下面的小方框单击可以去掉,这个时候就不会采集荧光信号了,且按理说后面的溶解曲线也是没有的,只能在multiple component那里看到图)



如果是采用FAM作为报告基团,可不可以将detector的报告基团设置为SYBR Green I

可以这样设置,但实验结果可能会有偏差。



熔解曲线有些孔单峰,有些孔出现双峰,什么原因造成的?

如果熔解曲线出现双峰,证明扩增产物中有两种产物,或者为引物二聚体。或者为非特异性产物。可以重新设计引物,或者优化PCR反应条件。



加样重复样品Ct值重复性不够好,是什么原因

重复性不好的原因很多,大部分是因为加样不准确造成的。



部分扩增曲线向下弯曲,不知道是什么原因?

可能原因为基线终止循环设置不正确,可以手动设置基线,重新分析即可。


(在analysis选项里,可以将基线的auto设置前的勾去掉,则可以对基线进行手动设置,拉动x轴下方的小三角形,往ct值大的方向拉动,重新analysis,然后选择线性图,可以看到扩增曲线会变形。或者可以在analysis settings中手动修改基线的起始和终止循环)



标准品相关系数不佳,影响因素有哪些?

1、 标准品浓度太低,即使是最高浓度标准品Ct值也大于25接近30,低浓度的DNA样品保存时间较长会有降解现象出现。因此建议将标准品浓缩。

2、 标准品倍比稀释2倍稀释造成稀释不好,建议10倍倍比稀释,且采用逐步倍比稀释的办法,比如将10v的高浓度标准品a加入90v的水中得到10倍稀释后的标准品b,彻底混匀之后再吸取10vb加入90v的水中......



扩增曲线不是标准的S形,这是为什么?

探针质量不好比如部分降解会干扰基线且使得PCR效率不高,试剂质量不好也会出现PCR效率不高等问题,这些问题都会使得扩增曲线异常,而不是标准的s形



使用非默认检测荧光HEX标记探针,信号非常弱,几乎没有,为什么?

需要通过添加customer dye,对HEX进行校正。(HEX不是ABI进行过校准的荧光,所以客户使用这类荧光标记探针时,必须使用纯的荧光(即customer dye)运行一次进行校正)



做的Realtime PCR结果,每一竖排8个是完全相同的重复,也就是把8个反应的反应混合液混在一起,分装成8管,实验结果重复性并不好。请问这是什么原因?

做一次清洗之后做背景校正,然后再用标准品做一次试验,如有上述现象,工程师要测量仪器的孔间温度



正确的开机顺序如何?

先开电脑,之后开主机,再开软件



针对三重定量,如何标记探针报告基团?

建议选择FAM、VIC、NED标记。


呼~一口气回答了这么多问题,不要拦我,我要去小憩一下……不!小编我要用最后一丝气力跟大家科普一下:


ABI小贴士


今天是世界卫生组织确定的第五个“世界肝炎日”,宣传主题是:战胜肝炎,从我做起。我国国家卫生计生委将“世界肝炎日”主题确定为“抗击肝炎,预防先行”,副标题为“疫苗接种好,铸就健康路”。赛默飞呼吁大家做好疫苗接种,防止从我做起。


各位亲们也可以好好消化一下。小编ABI与你下次再约!



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