2022-11-16 05:11:22, 小迈 武汉迈特维尔生物科技有限公司
Metlin数据库全称Metabolite Link(https://metlin.scripps.edu),由The Scripps Institute Gary Siuzdak于2003年创建,2005年对公众开放,最初是一个用于描述已知代谢物的特征的数据库,主要侧重用于液质非靶向代谢组学(Non-targetedMetabolomics)代谢物鉴定领域,此后扩展为识别已知和未知代谢物和其他化学实体的技术平台。
目前Metlin数据库包括超百万种小分子物质,括脂质,氨基酸,碳水化合物,毒素,小肽和天然产品等类别,超431000个高分辨率MS/MS质谱图。该库的主要特征是含有大量代谢物的二级质谱图,而且每个化合物都有多种不同碰撞能的图谱,可以清晰的找到代谢物的碎片离子,用户还可以获得分子量、化学式、化学结构等信息。
据报道,METLIN数据库中的质谱图可与多个厂商的质谱仪产生的谱图进行良好匹配,其中包括AB公司的Triple TOF 5600,安捷伦的6460 Triple Quad,Thermo的Q-Exactive和LTQ Orbitrap Velos(使用任何一种CID或HCD碰撞形式)等。
METLIN是一个强大的代谢物鉴定及代谢物信息查询的数据库。主页中有”Simple Search“和”Advanced Search”两种检索方式,网站主页如下图。
“Simple Search”模块中研究者进行单个质荷比搜索,可以输入物质的分子量、质量偏差、正/负离子模式、加和离子等信息进行搜索,还可通过设置过滤掉多肽、毒物等物质,或者直接设置所包含的元素信息,便于更精准的定性到目标物。如果我们有质谱数据,需要进行物质定性,那么可以使用这个模块。但是通常都会匹配出来多个物质,那么进一步就需要自己的专业知识去进行筛选和判断了。
“Advanced Search”为高级搜索,可根据物质的METLIN编号、英文名称、化学式、CAS号、KEGG号、分子量范围等信息进行检索,这些选项不需要全部都填,填一个或几个都可以的。
例如,假设我们想知道trimethylamine oxide(氧化三甲胺)这个物质在METLIN数据库里有没有,就可以在“Name”这里输入英文名字。如果想要精确匹配,则可以勾选下面的“Name Exact Match”选项;如果对于想要查的物质的英文名不是太确定,就无需勾选此选项,那么与这个名字相关的物质都会被搜出来。最后,
但由于METLIN网站现在已经商业化,因此以上介绍的检索功能在国内已无法免费使用,需要购买,而且价格比较昂贵。
敲重点
为了给科研工作者们提供更全面更准确的代谢物数据信息,迈维代谢购买了METLIN网站的商业版数据库用于LC-MS/MS非靶代谢组学的代谢物鉴定研究。所以各位老师可以直接把样本提供给我们,我们负责交付给您精准的鉴定结果以及全面的分析数据!
迈维代谢非靶优势
强大的检出能力直接取决于非靶的数据库以及物质鉴定方法,迈维非靶数据库现有物质数超29万+,采用4种鉴定方法,已实现代谢物的全面鉴定。
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超大数据库
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超全定性方法
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