全面升级 | GC-MS&LC-MS双平台代谢组服务,加“量”不加价

2022-08-20 10:13:58, 多层组学定制服务 上海欧易生物医学科技有限公司





LC-MS和GC-MS技术是目前代谢组学研究最常用的两大技术平台,但使用单一平台物质检测的范围和种类,都有一定的偏向性和局限性。为了解决这个问题,鹿明生物提出LC-MS+GC-MS联合组合式双平台解决方案,可以大大提升代谢组学检测的覆盖度,获取更加全面的代谢物及其丰度信息。GC-MS&LC-MS双平台服务作为鹿明生物特色业务至开展以来,广受好评,目前该技术的成果也是硕果累累(见喜报)



为了提供更好的服务,鹿明生物针对GC-MS&LC-MS双平台从实验过程到代谢物质谱数据库以及项目报告进行了全面的升级。


升级一

实验升级,多维质控保障数据质量

6大质控为高质量数据保驾护航:


升级二

数据库升级,助力双平台精准分析

双平台数据库4大升级看点:

(1)数据库容量大升级,无论是标准品的数量还是总量较前一版本均有大幅度提升。


a、具有自主知识产权的GC-MS数据库—LUG 4.0(Untarget database of GC-MS from Lumingbio,Version 4.0)专利号:ZL202010401911.0,标准品库容量在原有的基础上补充至1500个,总库容量增加至3000个;


b、LC-MS数据库—EMDB数据库是鹿明生物经过数年研发,专门针对人、动物内源性代谢物建立的专属质谱数据库,包含标准品数据库和人工校对数据库。标准品库容量在原有的基础上扩充至2500个,总库容量增加至10000个。

图1 | 鹿明生物自建库(LUG库和EMDB库)升级情况


C、此外,针对商业及其他公共库,鹿明生物已于近日采购最新METLIN数据库(METLIN 2019 MS/MS Library for Progenesis QI) 百万立项计划 | 鹿明生物购入最新版Progenesis QI软件及Metlin数据库,助力科学研究!其包含85,000个代谢物标准MS/MS图谱。相较该数据库以前的版本,代谢物数据多6倍。另外HMDB已升级至5.0,目前库容217920种代谢物,涵盖含有132335种代谢途径。


(2)搜库方式升级:自建库中所有代谢物均包含保留时间信息,搜库采用保留时间+标准质谱图匹配(代谢物鉴定金标准),定性更准确; 百万立项计划 | 代谢组学鉴定新据力证-代谢物鉴定金标准!

图2 | 不同数据库搜库匹配实例

(注:上图为通过不同数据库及不同搜库方式得到的定性结果,通过实际的匹配情况及得分情况,可以发现通过保留时间及标准质谱图匹配可靠性最高)


(3)代谢物信息更丰富:提供保留时间、一级精确质量信息、二级质谱碎片信息、代谢物分类信息、分子量、分子式、CAS号、主流数据库ID编号(HMDB编号、METLIN编号、LIPIDMAPS编号、Pubchem编号)、KEGG号、InChIKey,方便研究者对代谢物进行信息溯源。


(4)聚焦功能代谢组:LUG4.0和EMDB2.0全面覆盖糖酵解/糖异生、TCA循环、苯丙氨酸代谢、色氨酸代谢、类固醇生物合成、类固醇激素生物合成、初级胆汁酸生物合成、甘油磷脂代谢等几十余条重要代谢通路。

图3 | 部分重要通路标准品覆盖情况


升级三

报告升级,分析内容更丰富

新版报告新增了代谢物的分类情况统计、差异代谢物箱型图、联合分析相关性网络图等。


代谢物定性数据矩阵信息更丰富:

  • 新增定性等级,方便研究者了解哪些代谢物是通过标准品自建库注释,哪些是通过其他库注释;

  • 新增当前主流数据库对应ID,方便研究者信息溯源。

图4 | 定性数据矩阵实例


鹿明生物百万立项计划动态关注

鹿明生物自2022年初推出百万立项计划以来,经过半年的研发和升级,特推出数据库的全面升级,为关注鹿明生物百万立项数据库计划的科研老师带来“福音”,本次数据库的升级将大大提升精准分析的准确度,为助力GC-MS/LC-MS双平台代谢组学、非靶向代谢组学、靶向代谢组学、功能代谢组学研究,为您的科研课题加“码”助力!!


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3、百万立项计划 | 突破代谢组学化合物鉴定技术瓶颈:标品库管理背后的故事

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END

小久|排版

Zoe|撰文

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本文系鹿明生物原创

转载请注明本文转自鹿明生物

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