Circulation | SCALLOP 联盟运用Olink蛋白组学发现心力衰竭潜在新靶点

2022-07-30 11:28:10, Liang Wang 上海欧易生物医学科技有限公司




研究前沿

心血管疾病相关的风险评估、早期筛查和治疗方法的研究也是欧美老龄化社会的研究热点,在国内老龄化进程中也越来越有社会意义。心血管疾病相关生物标志物的发现,不仅可以改善对心血管相关疾病风险的评估,还可以从蛋白质组视角研究其潜在的病理生理学机制及潜在药物作用靶点。目前,截至今年6月22日使用Olink技术发表的文章已超过900篇,其中心血管疾病领域是所占比重最高的研究方向。



SCALLOP 联盟是全球范围的pQTL研究合作组织,已使用Olink PEA蛋白质组学技术来发现和跟踪与蛋白质遗传关联。到目前为止,来自28个研究机构的33个PI参与了这项工作,目前包括65,000多名患者和对照组的汇总水平数据。

近期心血管顶级期刊Circulation(IF = 29.69)再次发表了来自SCALLOP联盟的科学家的新成果,文中使用基于孟德尔随机化Mendelian Randomization, MR)的因果推断算法,对心力衰竭这种高度流行的疾病的致病机制进行了系统研究,鉴定了44个与心衰事件相关的循环蛋白,其中8个显示了因果关系的证据,7个为潜在药物靶点,包括肾上腺髓质素(Adrenomedullin),这个特别有应用前景的药物靶点。



研究解读

本次研究对四个独立来源的样本:HOMAGE  discovery、 HOMAGE replication、PIVUS和ULSAM进行荟萃分析,研究其中蛋白表达水平心力衰竭之间的关联。借助孟德尔随机化分析(Mendelian Randomization Analysis),通过双样本检测,研究循环蛋白水平与心力衰竭的遗传相关性,评估在多次检测校正中存在的蛋白质因果关系。最后,从更新的药物基因列表中分析候选靶蛋白的药物基因图谱。


为了评估靶向候选蛋白的候选药物的临床开发可行性,文中查询了第27版ChEMBL数据库,以获得相关药物分子类型、已获批适应症和临床试验中的药物靶标结果的信息。并且通过ClinicalTrials.gov网站对每个候选目标进行手动检索进一步补充信息。



研究结论

文中基于不同人群的蛋白质组学数据,通过观察性和孟德尔随机化分析评估了90多个心血管相关蛋白,并确定了7个治疗心力衰竭的候选药物靶点ADMGal-3两个蛋白目前正在进行心力衰竭临床试验评估中;CHI3L1CSF-1CTSL1FGF-23MMP-12等五个蛋白为心力衰竭的新型潜在治疗靶点

这项研究为新兴的基于人群的基因组蛋白质组数据资源所实现的人类目标优先排序提供了典型范例。通过孟德尔随机化将与靶点结果的直接关联和基于遗传的推断纳入蛋白质组研究,可能为治疗靶点的发现和优先排序提供重要的新工具。
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参考文献:

1. Henry A. et al. Therapeutic Targets for Heart Failure Identified Using Proteomics and Mendelian Randomization. Circulation. 2022 Mar 18. 
doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.121.056663.


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