干货｜水产方向终极研究宝典

2022-06-29 04:02:20, 小迈武汉迈特维尔生物科技有限公司

随着代谢组学的兴起,应用基于LC-MS的代谢组学技术在水产动物营养、育种、疾病预防、养殖、环境监测等方面的研究越来越深入。与传统研究方法相比,该方法通过对代谢物的定性和定量研究,能较灵敏地反映水生动物机体组织的生理变化,因此该方法对水产动物的深入研究有着重要意义。

水产研究方向

水环境污染

代谢组学通过观察代谢谱可以实时动态地检测外源性物质对有机体生理机能的影响,并且通过代谢物的变化, 寻找生物标志物以指示污染物对生物体的潜在危害。

水产养殖

养殖环境及营养的改变，引起水产动物生化特征、代谢产物发生变化，从而影响品质以及产量。代谢组学已在养殖水产动物的生化特征、代谢变化、性别鉴定、动物营养及养殖环境等方面有较多研究。

动物疾病

代谢组学可从分子水平更系统全面地揭示病理变化和发病机制，且早诊是代谢组学优势之一，已被应用于水产动物疾病诊断，为疾病的预防和治疗提供理论基础。

其他

在水产动物中，代谢组学已广泛应用于动物营养、功能基因组学、疾病预防等，但在其他方面也有一定的应用，如动物生长发育、遗传育种等。

多组学研究方案

方案一：代谢组学

Metabolic response of Mercenaria mercenaria under heat and hypoxia stress by widely targeted metabolomic approach

广泛靶向代谢组学方法检测硬壳蛤在热和缺氧胁迫下的代谢反应

期刊：Science of the Total Environment

IF：7.963

发表时间：2021.10

研究思路：

方案二：微生物组学+代谢组学

复杂微生物环境影响着水产动物代谢产物的改变，代谢产物的改变也可以影响微生物的组成和丰度。动物体内最广泛的表面是胃肠道，其中藏有种类繁多和数量众多的微生物，易受内部和外部环境影响，可通过肠道微生物组+代谢组的技术手段研究水产动物与肠道微生物互作机制。

Response mechanism of gut microbiome and metabolism of European seabass (Dicentrarchus labrax) to temperature stress

欧洲鲈鱼肠道菌群微生物组和代谢组对温度胁迫的响应机制

期刊：Science of The Total Environment

IF：8.0

发表时间：2021.12.20

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差异代谢物与差异微生物互相关联

（注：黄色框表示已筛选出与肠道微生物群相关的重要差异代谢物。红色代表上调的差异代谢物，绿色代表下调的差异代谢物）

方案三：蛋白质组+代谢组学

代谢组学的目的是以系统地研究代谢中涉及的化学过程，蛋白质组学旨在量化和表征参与生物体生物过程的所有蛋白质，蛋白质作为酶可调控生物体代谢过程，影响生物体内代谢物浓度。通过蛋白组和代谢组联合分析，可建立不同层次分子间数据关系。同时结合GO功能分析、代谢通路富集、分子互作等生物功能分析，系统全面地解析生物分子功能和调控机制，最终实现对生物变化大趋势与方向的综合了解。

Proteomic and metabolomic insights into the functions of the male reproductive system in fishes

蛋白质组学和代谢组学对鱼类雄性生殖系统功能的见解

期刊：Theriogenology

发表时间：2019

方案四：转录组+代谢组学

代谢组是生物体发育和生理状态在代谢水平的体现，是基因组与表型组之间的桥梁，差异积累的代谢物信息可辅助时序表达的众多基因进行“共表达”分析，提示基因功能，研究分子生化机制，并将基因与表型联系起来。因此，转录组+代谢组联合分析可从大量转录本信息中快速鉴定代谢相关功能基因，构建核心调控网络，找出关键候选基因，阐述生物学现象。

Integrated application of transcriptomics and metabolomics provides insights into unsynchronized growth in pearl oyster Pinctada fucata martensii

转录组学和代谢组学联合研究珍珠牡蛎非同步生长现象的潜在机制

期刊：Science of the Total Environment

IF：5.589

发表时间：2019.5.20