视频实操SCI作图课(9)：如何利用upsetR快速提取多组交集信息

上周我们介绍了韦恩图，本周我们一起来看一下与与韦恩图有相同功能但是又更高级的upsetR吧，也让我们在展示集合可视化方面有更多的选择。

要了解upsetR，首先我们需要了解韦恩图，上一节我们已经分享了韦恩图的相关内容，我们知道韦恩图是集合交点定量可视化的一种解决方案，但是韦恩图的使用有组数的限制，因此需要一个可扩展的替代维恩图来可视化相交集及其属性。upSetR在这种情况下应运而生，它采用可扩展的基于矩阵的可视化来显示集合的交集、它们的大小和其他属性。

一般来说，upsetR主要用于直观展示5组以上样品的共有及特有信息，而韦恩图只能用于展示5组及以下样品中的信息交集，同时在达到5组样品时，如果样品之间交叉的信息复杂，韦恩图并不能辅助科研工作者很快的提取其中的信息，例如下图，虽然美观，但是如果要找出A组与B组之间共有的元素有多少个时，需要相加的部分非常多，也非常容易遗漏。

而此时，upsetR就能发挥较大的作用了。我们只需要在upsetR中在找到A和B中存在黑色点和连线的地方，对应上方的条形即在这两组中共有的元素个数，我们可以发现，在以下的分析中，A组和B组共有18个相同的元素。

一般upsetR图主要包括3个部分，红色区域代表的是每个集合的名称和大小；绿色区域代表的是集合交叉的大小，与下方蓝色区域一一对应；蓝色区域代表集合之间是否有交叉，以及具体的交叉情况，黑色点代表存在于该集合，黑色点及中间有连线代表有交叉，灰色点代表不存在于该交叉。