先睹为快！海量蛋白组Demo数据已上线，提前评估你的目标蛋白检出率

还在担心目标蛋白能否被检测到？还会为没检测到目标蛋白而恼火？demo数据中早有答案，动动小手，检索一下，就能避免后续实验结果疑问啦。

最近我们整理了覆盖多物种、多样本类型、多技术/多项目类型的蛋白组Demo数据集，助力您提前“预览”检测结果，心中有底再实验！

让您在投入关键经费与珍贵样本之前，就能先行自行评估。通过demo数据集，您可以提前了解对应项目的蛋白/肽段/修饰位点整体鉴定情况，并且可以直接确认您关注的目标蛋白能否被稳定检出、其丰度水平如何，并能根据检索结果选择直接参考或者适当优化实验方案，让您在项目启动前就心中有数。

这些demo数据集直观展示了我们的扎实积累与专业能力，为您提供全面可查、可验的真实数据，高效回答您“能不能做”，以及“怎么做更好”等疑问。

登录Omicsolution官网，进入【软件平台】-【EasyDIA】，即可免费查看与检索各类项目数据集。

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✅ 人蛋白组数据（各类组织/器官、血清/血浆、FFPE等）

✅ 小鼠蛋白组数据（心、肝、脑、肾等多组织 + 血浆/血清）

✅ 空间/单细胞蛋白组数据（人/小鼠各尺寸LCM、肿瘤单细胞、人卵子单细胞）

✅ 极微量蛋白组数据（10/20/40/50个小鼠卵细胞级别）

✅ 药靶发现蛋白组数据（LIP-MS、LIP-MS升级方法、TPP等策略）

✅ 修饰组数据（磷酸化（含深度/微量/FFPE磷酸化）、乙酰化、泛素化、乳酸化、糖基化）

✅ 植物蛋白组数据（根、叶、幼苗等部位）

✅ 菌体蛋白组数据（细菌、真菌、食用菌等）

• 基因名（源自uniprot数据库中该物种蛋白组fasta文件）

• 蛋白详细描述（源自uniprot数据库中该物种蛋白组fasta文件）

• 定量值（蛋白组提供蛋白定量值，lip-ms提供肽段定量值，修饰组学提供修饰位点定量值）

• 蛋白ID（源自uniprot数据库中该物种蛋白组fasta文件）

• 对应项目的实验方案（包含从样品制备、LC-MS上机、软件搜库的完整Protocol）

1.目标蛋白检索，能否被检出

1.1 一键检索，确认有无检出

当您有关注的目标蛋白（如某个候选生物标志物、关键信号通路蛋白或药物靶点等），这些蛋白的丰度可能比较低，有可能在结果中不容易检测到，那么我们可以在相关物种和样本类型以及对应项目类型的Demo数据集中，直接输入你关注的蛋白/基因名查找看看。

比如您想通过lip-ms技术研究小分子的药物靶标，有个关注的目标蛋白是Cyclin-dependent kinase 2/CDK2_HUMAN，您可以在lip-ms 数据集中检索，如下所示，该目标蛋白在demo数据集中检测到8条肽段，并且丰度都比较高，这种情况下，后续项目结果能够检测到该蛋白的可能性极高（当然，这也看具体样本情况，demo数据集可作为参考 ，但不做绝对保证）。

还是以lip-ms技术研究药靶为例，另一个您关注目标靶标RIPK3（Receptor-Interacting Serine/Threonine-Protein Kinase 3），这同样是一个激酶，但在人体中通常属于低丰度蛋白，在全细胞裂解液中不容易稳定检测到，如下所示，通过lip-ms技术没有检测到该目标蛋白，这提示您后续能够测到的可能性比较小。

1.2 查看丰度，评估“水平高低”

有时候即使能搜到目标蛋白，也不一定后续结果就能检测到，这主要与蛋白的定量丰度水平有关。因此找到目标蛋白后，还需要查看其对应的定量值（如Quantity、iBAQ值），观察目标蛋白的定量丰度在所有鉴定蛋白中的排名区间。

同样以lip-ms demo数据为例，药靶发现相关蛋白组这类检测结果定量值高的能达到10^7或10^6水平，如果您的目标蛋白/肽段检索到10^3，这种就算是信号强度偏低了。

如下图所示，CDK2检测到的几条肽段对应定量值都比较高，并且在所有的样品中都有检测到，这意味着在对应实验条件下，该蛋白在同类样本中稳定可检出，您基本可以放心了。

那么对于在lip-ms中没有检索到的RIPK3蛋白，我们尝试在常规定量蛋白组Human Proteome Atlas demo数据集中看下（鉴定结果在1到10^4），如下所示，虽然RIPK3在部分组织/器官中有检测到，但丰度都处于低强度区间，且在不同样本中检测丰度非常不稳定，相差几个数量级或者是有和无的情况，这意味着在后续实验中该蛋白也存在较高的漏检风险。

2.参考demo实验方案，规划自己的研究设计

Demo数据集不仅展示了检测结果，还附带了对应该数据的完整实验方案，您可以预评估实验检测灵敏度与项目可行性。

2.1 直接参考与复制成熟流程

比如上述您想检测某个小分子药物在人源胶质瘤细胞系中的作用靶点，实验技术采用lip-ms，关注目标蛋白CDK2，通过 demo数据集（细胞：HeLa；药物：雷帕霉素）检索到CDK2相关肽段数据质量很好，后续检出可能性也极高（当然，不同细胞系和药物的结果会有差异，没办法绝对保证，demo结果可作为参考），那后续可以直接应用demo数据的实验方案或者我们默认的方案（包括酶解条件、色谱梯度、仪器选择等），这极大降低了预实验摸索的风险和时间成本。

如果目标蛋白没有检索到，那么就可以和技术人员交流，评估一下是否可以通过增加样品量、增加上机时长或进行预富集等方法增加检出概率。

2.2 评估技术极限，确定样本需求量，选择最合适的实验策略

以空间蛋白组为例，涉及到激光显微微切割感兴趣区域，样本比较珍贵，不确定大概可以鉴定到多少个蛋白，并且关注细胞因子或炎症相关的低丰度目标蛋白，在这种极微量的样品中能否检测到？

这里可以查看我们不同尺寸空间蛋白组的demo数据集（覆盖100μm、200μm、500μm等多个尺寸）。您可以看到不同切割大小的区域对应的蛋白检测数量，以及demo数据中有没有检测到目标蛋白。如果在大面积尺寸中整体鉴定量可观并且检测到了目标蛋白，那后续圈选与切割感兴趣区域时就不建议小于该尺寸。

如果你正在规划蛋白组、修饰组、药靶研究或空间/单细胞蛋白组等实验，不妨先来Demo区“探探路”！

✨ 小提示：所有数据均来自真实检测，覆盖常见模型与样本类型，助你科研起步更稳健！

有任何检索问题或者优化建议，欢迎随时联系我们技术支持~