悟空云平台交流视频第六十八期---《磷酸化位点结构属性预测》

2026-05-06 09:30:26, omicsolution.com 上海易算生物科技有限公司


悟空云

组学数据分析平台

易算生物




你好!本期悟空云带来磷酸化位点结构属性预测从局部结构环境评估位点调控潜力


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见功能圈--4.功能分析--42.磷酸化位点结构属性预测



为什么做这个分析


在磷酸化组数据分析中,差异倍数、显著性水平和位点定位概率能够告诉我们哪些位点发生了变化,但这些信息不能单独解释一个位点是否更可能参与信号调控。


磷酸化修饰发生在Ser、Thr或Tyr残基上。一个位点能否被激酶识别,除了受到邻近氨基酸序列影响,还受到局部结构环境限制。残基是否暴露在蛋白表面,是否处在无序或柔性区域,所在区域属于α螺旋、β折叠还是coil结构,都会影响该位点被酶接触和发挥调控作用的可能性。


在磷酸化组数据中,候选位点数量通常较多。结构属性预测可以帮助研究者优先选择更值得关注的位点,用于突变实验、验证或机制研究。


悟空云平台交流视频第六十八期《磷酸化位点结构属性预测》,围绕磷酸化位点的结构属性分析展开,介绍如何在平台上完成数据准备、参数设置、结果查看和结果解释。


输入数据有什么要求


  • UniProt ID:用于标识蛋白质。

  • 磷酸化位点类型:填写S、T或Y,分别对应Ser、Thr和Tyr。

  • 磷酸化位点在蛋白质序列中的位置:也就是该修饰残基在蛋白序列中的编号。


如果数据中还有其他信息,例如Fold Change、P值、校正后的P值等,平台会在结果文件中保留这些额外信息,方便后续结合结构属性一起解释。



怎么和差异结合


当一个差异磷酸化位点同时具有较高溶剂可及性、较高无序倾向,并且位于coil或柔性区域时,该位点更适合作为候选调控位点进入后续分析。


本期视频详细介绍了在悟空云平台上进行数据准备与全流程分析操作,有需要的老师和同学可以了解下,动手操作试试。磷酸化组数据分析其他模块的操作可以参考往期的视频,比如第36期《磷酸化数据前处理》,第66期《激酶底物富集分析》。


学习视频



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