寡核苷酸药物 | 从精准定量到代谢产物鉴定SCIEX整体分析方案

2025-08-19 09:59:19, SCIEX 飞诺美



随着寡核苷酸药物的快速发展,其液质联用分析检测也面临巨大挑战:“分子量大易产生多电荷、存在金属加合离子干扰、色谱保留行为差、基质前处理复杂、代谢物和杂质复杂、解析难度大等”。


SCIEX三重四极杆+高分辨质谱技术结合智能化Molecule Profiler软件,为寡核苷酸药物的定量分析和代谢研究提供了系统化解决方案。


SCIEX Triple Quad™系统用于血浆中寡核苷酸的精准定量


应用案例:

SCIEX Triple Quad™系统结合飞诺美固相萃取(SPE) 前处理方案,实现大鼠血浆中寡核苷酸药物Inotersen的定量分析


技术优势:

1. 优异的灵敏度与重复性

方法定量下限(LOQ)为0.2 ng/mL,空白中无干扰,方法选择性好,灵敏度高;定量下限样品连续重复进样6针,RSD%<3.5%,重复性良好

图1. 在空白血浆样品、0.2 ng/ml和0.5 ng/ml 典型色谱图


2. 处理方法简单,回收率高

采用飞诺美Clarity OTX™ 萃取试剂盒对大鼠血浆样品进行处理,能够有效的实现对样品的净化,提取回收率大于71%。


3. 线性关系好

线性范围0.2-500ng/mL内线性关系良好,相关系数大于0.998,标曲各点准确度在91.9%-109.1%之间,确保定量准确。


SCIEX ZenoTOF 7600®系统结合Molecule Profiler™软件用于寡核苷酸代谢分析


应用案例:

Automatic identification of oligonucleotide metabolites in complex biological samples using ultra high-performance liquid chromatography high-resolution mass spectrometry combined with the molecule profiler software


技术优势:

1. 简单自动化的分析流程

基于SCIEX ZenoTOF 7600系统和Molecule Profiler软件自动鉴定Fomivirsen体内体外代谢物,工作流程如下图


2. 优异的灵敏度与采集速度

SCIEX ZenoTOF 7600高分辨系统具有高灵敏度和扫描速度快的特点,一次进样同时采集到更全面的一级和二级谱图信息。Zeno™ Trap离子阱集功能,在进行数据采集时可提高低丰度代谢物的二级灵敏度,得到更高质量的二级谱图用于寡核苷酸序列覆盖度分析和代谢物鉴定。


3. 专业全面的软件数据库

Molecule Profiler软件进行代谢物分析,数据处理流程简单、灵活、高效,该软件可对寡核苷酸药物相关代谢物的碱基序列进行预测并通过二级谱图比对给出序列覆盖度信息。同时软件中包含352种核酸修饰库和83种核酸相关生物转化类型(均可手动添加),可以满足更多类型寡核苷酸药物代谢物鉴定工作。


4. 准确鉴定多种代谢产物

从体外和体内样本中共鉴定出 17 种Fomivirsen代谢物,并观察到Fomivirsen在血浆、肝脏和肾脏中被3’-外切酶代谢。



参考文献

Xinyuan Ye, Lili Jiang,Ying Xiong, Cui Zhang, Chenxi Wang, Meiling Qi, Chenyue Zhu, Yi Chen, Zhifeng Du, Zhongzhe Cheng, Hongliang Jiang; Automatic identification of oligonucleotide metabolites in complex biological samples using ultra high-performance liquid chromatography high-resolution mass spectrometry combined with the molecule profiler software. Journal of Chromatography B (2025). https://doi.org/10.1016/j.jchromb.2025.124505



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