单细胞课题破局新方案:不止于单细胞转录组,单细胞蛋白组帮你忙

2023-06-26 10:59:02, 欧易生物 上海欧易生物医学科技有限公司



膜蛋白是生物膜功能的主要承担者,在生物体的许多生命活动中都扮演着重要角色,据估计药物研究中约有60%的靶点都是膜蛋白。单细胞转录组虽然能在mRNA层面上解释细胞异质性,但要更好地理解细胞过程的调控机制,检测效应分子蛋白质比mRNA更直接有效,对于理解细胞的功能更为至关重要。


BD™ AbSeq可通过高通量测序来分析单细胞水平的蛋白表达,将高质量抗体和寡核苷酸结合在一起,使研究人员能够在BD Rhapsody™单细胞分析平台上开展单细胞蛋白分析,同时分析数千个单个细胞中的RNA和蛋白质,完整揭示出基因和蛋白在生物系统中的作用。


到目前为止,BD™ 已推出近500种抗体(Human & Mouse),助力免疫学深入研究,研究人员可根据研究需求选择合适的抗体类型及数量。然而,蛋白抗体如何进行筛选往往需要研究者查询大量文献或资料从而确定。近日,BD公司特推出AbSeq Immune Discovery Panel(IDP)抗体组合,其精选30个人主要特异性免疫标志物的抗体,几乎涵盖了常见免疫细胞的蛋白marker,有效减轻研究者筛选抗体的工作负担,实现更高性价比的单细胞多组学分析。


01 操作简便--30合1

IDP以冻干粉这种固态形式对产品进行存储,保障了抗体稳定性。并将30种抗体整合到一个试管中,不再需要针对几十种抗体一一进行操作,使用非常方便,仅需在实验前按照说明对冻干粉溶解即可,避免了繁杂的操作步骤可能带来的失误。

图1 IDP包含的30种抗体


02 结果可靠--可与新鲜配制的抗体混合物所产生的数据相媲美

尽管IDP操作简便,但其结果的可靠性仍然是研究人员最为关注的问题。BD公司利用IDP或新鲜制备的相同AbSeq抗体对PBMC细胞进行处理并测序后,发现IDP和新鲜BD®AbSeq抗体染色样本之间的细胞群有很强的重叠,两者一致性非常高,相关性高达0.984。


图2 IDP与新鲜AbSeq抗体之间的性能相似


此外,当多个抗体集合在一个组合中时,确保抗体的最佳性能是免疫检测实验的关键。BD公司检测了这30种抗体的特异性,如下图所示,每个抗体都能够特异性地、可靠地检测到各自的、单独的目标。结合单细胞转录组测序数据,能够更加精细的划分出免疫细胞亚型。



图3 IDP中包含的所有30个AbSeq特异性抗体的性能


03 兼容性好--可与BD Rhapsody单细胞RNA分析和多样本检测试剂盒无缝对接

随着单细胞转录组测序技术的发展与普及,单一组学技术已经无法满足高质量发文需求。IDP可在单细胞水平上进行多组学分析(RNA+蛋白质),有助于多维度解读单细胞信息,识别细胞异质性以及发现新的细胞亚群。此外,在一个实验中同时对多个样本进行这种多组学分析还可以降低成本,最重要的是有助于避免实验间的批次效应。而IDP可与BD Rhapsody RNA分析和多样本检测试剂盒无缝配合,完美实现了这一分析需求。


图4 IDP结合转录组测序数据可改善细胞分群


上海欧易生物医学科技有限公司(简称:“欧易生物”),成立于2009年,经过十多年稳健发展,已经成长为拥有“晶准生物”“鹿明生物”“青岛欧易”三家全资子公司,近600名员工的生物科技领域集团型企业。


欧易生物始终秉持着“硬数据 · 好服务”的理念服务于大众。为大生命科学、大健康相关研究领域,以及医药、食品及日化企业的客户,提供从基础研究到药物靶点发现、药理药效及安全性评价、疾病分子标志物筛选、致病菌及耐药菌溯源等相关技术服务,全力加速客户研究与开发进程,提升客户研究与开发价值。


欧易生物携手旗下子公司,实现了中心法则上、中、下游多层组学的串联,从基因组、转录组、表观组、微生物组,到蛋白组、代谢组及近年热门的单细胞&空间多组学技术服务,为科研用户提供全面的创新多组学技术服务。



欧易生物已先后获得上海市科技小巨人企业、闵行区研发机构、闵行区企业技术中心、产权管理体系认证企业等资质。拥有授权发明专利30+项,在受理发明专利50+项,软件著作权150+项。

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排版人:七七


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