2023-08-17 10:51:05, 欧易生物 上海欧易生物医学科技有限公司
今天小欧向大家推荐欧易即将推出的10x Genomics 公司的Xenium组织原位多组学分析平台!
首先看看新技术抓人眼球的特点
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冰冻&石蜡整张切片均可检测
探针靶向检测目标RNA分子,组织原位表达水平检测
采用显微成像达到亚细胞分辨率,无需高通量测序
看看高大上的硬件
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集合光学元件、数据采集、解码技术于一身的10x Genomics Xenium分析仪同时检测2张Xenium玻片(每张玻片成像区域大小12mm x 24mm)
再看看工作流程
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01
将FF或FFPE组织切片放置在Xenium的载玻片上。
02
对切片透化(FF)或脱蜡/解交联(FFPE)处理,组织RNA与可环化的DNA探针进行杂交。
03
由于独特的探针结构,杂交探针连接到目标RNA片段后形成环状DNA探针,后续可进行滚环扩增,增加拷贝数。
04
将载玻片放入Xenium分析仪中,样本在其中经过连续几轮的荧光探针杂交、成像和去除,产生明亮、易于成像且高信噪比的信号。
05
生成每个基因特异性的荧光特征条码,实现目标基因的定位和识别。
06
使用细胞核和细胞形态信息来鉴定组织切片上的细胞边界,并将细胞边界信息映射到RNA表达图像上,根据位置坐标将转录本分配给每个细胞,从而构建出整张组织切片上亚细胞水平的空间图谱,后续可以用10xGenomics提供的分析软件进行数据可视化展示。
这么高级的产品其核心技术是什么呢?
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探针杂交和洗脱:基于已知细胞类型特异表达基因设计DNA探针(平均每个基因设计8对探针),该探针两端是与目标RNA杂交的区域(紫色和黄色),此外还包含基因特异性的Barcode标签序列(蓝色,荧光信号杂交区域)和引物结合位点(灰色)。
探针连接:每对探针末端与目标RNA区域杂交后会迅速成环状,在依赖RNA模板的DNA连接酶的作用下探针连接成环状的单链的DNA分子(如果探针发生非特异杂交或脱靶,则不会发生连接反应,确保了每对探针与目标RNA区域杂交的高特异性)。
探针扩增,信号放大:加入聚合酶和引物进行探针扩增,信号放大。引物吸附在环状探针上,聚合酶沿着环状DNA探针进行滚环复制,复制出“毛线球”状的多达几百个探针拷贝的长链DNA。进行细胞核染色后将组织载玻片置于Xenium分析仪中进行荧光基团杂交,一共有4种荧光,荧光基团与探针上“Gene Specific Barcode”中序列杂交,杂交位置会在激发光的照射下发出对应颜色的荧光,一轮杂交后不同探针会分别呈现4种颜色荧光中的一种荧光颜色,没有被杂交上的不发光,荧光显微镜把该轮荧光染色整张片子各个位置荧光信号拍照记录,然后把第一轮荧光基团洗掉,进行第二轮第三轮的实验,经过若干轮杂交后,每对探针会有一串特有荧光编码,基于此来确定是哪种基因,再结合整张片子的拍照记录即可获得整张组织切片上各基因亚细胞水平的空间原位图谱。
您可以选择的产品
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目前官方已经推出人类乳腺280个基因的Panel(可增加1~100 定制化基因)、小鼠脑248个基因的Panel(可增加1~100 定制化基因)、人脑266个基因的Panel(可增加1~100 定制化基因)和人肺289个基因的Panel(可增加1~100 定制化基因)。
不同应用场景的靶向基因Panel(图片引自10x Genomics官方)
未来可期
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应用场景不断拓展,更多组织类型的商品化Panel,应用于肿瘤、发育等不同领域的探索。
采用荧光探针杂交标记蛋白的DNA条码序列来检测组织切片中每种标记蛋白的表达水平,达成多组学空间图谱的绘制!
欧易10x Genomics Xenium产品即将上线,进入预售环节,买二送一,数量有限!欢迎对该技术有兴趣的老师第一时间联系销售工程师或微信后台留言哦!
上海欧易生物医学科技有限公司(简称:“欧易生物”),成立于2009年,经过十多年稳健发展,已经成长为拥有“晶准生物”“鹿明生物”“青岛欧易”三家全资子公司,近600名员工的生物科技领域集团型企业。
欧易生物始终秉持着“硬数据 · 好服务”的理念服务于大众。为大生命科学、大健康相关研究领域,以及医药、食品及日化企业的客户,提供从基础研究到药物靶点发现、药理药效及安全性评价、疾病分子标志物筛选、致病菌及耐药菌溯源等相关技术服务,全力加速客户研究与开发进程,提升客户研究与开发价值。
欧易生物携手旗下子公司,实现了中心法则上、中、下游多层组学的串联,从基因组、转录组、表观组、微生物组,到蛋白组、代谢组及近年热门的单细胞&空间多组学技术服务,为科研用户提供全面的创新多组学技术服务。
欧易生物已先后获得上海市科技小巨人企业、闵行区研发机构、闵行区企业技术中心、产权管理体系认证企业等资质。拥有授权发明专利30+项,在受理发明专利50+项,软件著作权150+项。
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