靶向神经母细胞瘤AURKA降解剂开发

2022-09-27 17:39:41 ProteinSimple




比利时根特大学科学家研究降解神经母细胞瘤(Neuroblastoma, NB)中极光激酶A(Aurora Kinase A,AURKA)靶点,AUKAR在有丝分裂中具有催化功能,同时稳定关键癌蛋白MYCN,是公认的NB药物靶点。


作者通过探索不同接头子Linker长度,及4和5位作为沙利度胺出口载体的MK-5108衍生的PROTAC构效关系。



结果表明,PROTAC SK2188可诱导AURKA最高效的降解,24h条件下DC50<10 nM,1h时Dmax 98%和24h时Dmax 80%。


在细胞增殖药物筛选实验和患者来源类器官中,SK2188作用效果显著优于母体抑制剂MK-5108。在NGP神经母细胞瘤细胞系水平实验中,会诱导伴随的MYCN降解、DNA损伤水平和细胞凋亡。


将PEG连接子的结合位点设计到沙利度胺5位,同时连接子缩短到2个PEG单位,获得的PROTAC分子能高效降解AURKA。



Digital Western(Simple Western)定量检测AURKA降解水平变化



上图数据结果表明,SK2188可实现有效且快速的AURKA靶蛋白降解。


采用毛细管Digital Western(即Simple Western)评估NGP细胞水平PROTAC作用效应,采用10、100和1000 nM化合物处理24小时候,监测AURKA倍数水平变化。除了4位点短的2 PEG单元SK3250外,其余所有PROTACs都诱导有效的剂量依赖性AURKA降解。


与其他研究相一致,使用母体抑制剂MK-5108治疗导致AURKA蛋白水平增加近2倍,基于alisertib设计JB170表现出较弱的降解活性。进一步验证说明,蛋白酶体抑制剂处理后,可防止SK2188降解活动,AURKA降解是由Cereblon介导的蛋白酶体依赖性作用机制。


AURKA抑制剂是神经母细胞瘤治疗模式活跃的领域,然而经典抑制剂治疗导致AURKA表达上调,导致临床实践中潜在治疗抵抗相关,蛋白降解剂是一个有潜力的方向。


Digital Western可在细胞水平和类器官模型等不同层面评估AURKA蛋白降解情况,是此靶点蛋白降解剂开发的有力工具。



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参考文献:

  1. https://chemrxiv.org/engage/chemrxiv/article-details/62fdcb04ceed6f39f132cc62



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