质谱流式文献简介（14）

2022-02-11 03:51:09, FLUIDIGM 思百拓（上海）仪器科技有限公司

近日，不列颠哥伦比亚大学在medRxiv上发表研究成果，开发了一种免疫生物标志物的筛选方法，该方法有可能在患者入住ICU时为预测ICU住院时间或死亡时间提供参考。

研究人员应用一个包含35个marker的CyTOF Panel，以及一个包含38个marker的panel，对PBMC谱系的变化和它们的激活状态，以及先天免疫细胞和骨髓祖细胞进入外周血的运动进行检测。

研究表明，在患者进入ICU时对血清IL-10和CD11c经典单核细胞这两种生物标志物的组合进行检测，可能有助于确定SARS-CoV-2重症患者的ICU住院或死亡时间。这些生物标志物也可以用于对疾病发展轨迹以及治疗反应进行监测。Fluidigm质谱流式技术可同时分析单细胞表面和内部的50多种标志物，在追踪细胞群体中更细微的变化上具有无可比拟的优势！

参考文献：

Messing M, Sekhon MS, Hughes M R, et al. Prognostic peripheral blood biomarkers at ICU admissionpredict COVID-19 clinical outcomes[J]. medRxiv, 2022.

近日，来自宾夕法尼亚大学Carl June实验室的研究团队在《Nature》发表研究成果，应用包括Fluidigm质谱流式技术在内的多组学技术，利用包含40个antibody的panel，对两位十年前首批接受CAR-T治疗后获得完全缓解的慢性淋巴细胞白血病患者进行跟踪检测。检测结果显示，CAR- T细胞在输注后十多年后仍可在患者体内被检测到，且两名患者中都出现了高度激活的CD4+细胞群，它们在后期的CAR-T细胞群中占主导地位。这种转变反映在CAR-T细胞克隆组成的稳定上，由少数克隆占主导地位。单细胞分析表明，这些长期存在的CD4+CAR-T细胞表现出细胞毒性作用特征以及持续的功能激活和增殖。此外，纵向分析显示，其中一名患者的初始反应阶段，显示了伴随着CD8+CAR-T细胞的显著扩增的γδCAR-T细胞群。

该研究结果为与抗癌反应和长期缓解相关的CAR-T细胞特征提供了新的见解，且为CAR-T细胞疗法的长期治疗效果和整合到体内的安全性提供了概念证明。Carl June表示，现在可以认为CAR-T确实可以真正治愈白血病。

参考文献：

Melenhorst J J, ChenG M, Wang M, et al. Decade-long leukaemia remissions with persistence of CD4+CAR T cells[J]. Nature, 2022: 1-7.

近日，弗吉尼亚梅森大学本纳罗亚研究所（Benaroya Research Institute at Virginia Mason）的发布最新研究成果，对唐氏综合症患者的免疫系统如何随年龄变化进行了研究。

唐氏综合症患者的免疫系统失调会导致自身免疫风险增加，对感染和疫苗的免疫应答更差。研究小组应用Fluidigm质谱流式技术进行深度免疫表型分析，对与此类免疫系统失调相关的特征进行检测，并建立了免疫老化模型。

研究小组所用的分析软件IMPACD(Iterative Machine-assisted Permutational Analysis of Cytometry Data)帮助快速识别唐氏综合征与其他自身免疫性疾病的免疫失调特征。

该方法表明，唐氏综合症与免疫老化的程度相关，并为免疫老化在本病和其他自身免疫性疾病中的影响提供了见解。

参考文献：

Lambert K, Moo K G,Arnett A, et al. Deep immune phenotyping reveals similarities between aging, Down syndrome, and autoimmunity[J]. Science translational medicine, 2022,14(627): eabi4888.

免疫疗法已被证明在一些癌症中有效地恢复了T细胞介导的免疫反应，但更好地了解肿瘤微环境中的CD8和CD4 T细胞对改善治疗反应至关重要。

基于对CD4+TILs介导其他免疫细胞对抗肿瘤免疫的行为的观察，弗雷德-哈奇癌症研究中心的研究人员应用Fluidigm质谱流式技术，对人类结直肠癌和肺癌的CD4+TILs进行了分析，以更好地了解这些细胞在肿瘤微环境中的作用。

Fluidigm质谱流式系统为鉴定和表征CD4+TILs提供了助力，揭示了一个与CD8+TIL浸润密切相关的表型异质的细胞群。这些数据为涉及这种细胞类型的治疗策略的制定提供了参考依据，并有助于提高免疫治疗效率。

参考文献：

Li S, Zhuang S, Heit A, et al. Bystander CD4+ T cells infiltrate human tumors and are phenotypically distinct[J]. OncoImmunology, 2022, 11(1): 2012961.

由牛津大学领导的COMBAT联盟发布最新研究成果，为不同COVID-19严重程度的患者提供了一个综合的多组血图谱，并将其与流感和败血症患者与健康志愿者进行了综合比较。在这项研究中，借助包含Fluidigm质谱流式技术在内的多种技术，研究人员识别了导致COVID-19与流感或败血症有不同进展差异的免疫特征及宿主反应。

参考文献：

Ahern D J, Ai Z,Ainsworth M, et al. A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of diseaseseverity and specificity[J]. MedRxiv, 2021.

来自英国癌症研究中心（CRUK）曼彻斯特研究所的团队发表研究成果，应用包括Fluidigm质谱流式系统及Biomark™ HD在内的多组学平台，确定了抗炎药物迅速改变肿瘤免疫微环境以增强肿瘤免疫原性和对免疫检查点抑制剂的反应的机制。

研究人员对小鼠和人类肿瘤进行了深入的分析，包括在Biomark™ HD上通过qPCR确定免疫介质的表达水平。研究结果提供了对耐药性机制的更深入的理解，为治疗策略的制定和优化提供了参考依据。

参考文献：

Pelly V S, Moeini A,Roelofsen L M, et al. Anti-inflammatory drugs remodel the tumor immuneenvironment to enhance immune checkpoint blockade efficacy[J]. Cancerdiscovery, 2021, 11(10): 2602-2619.

迄今为止，CyTOF^®是唯一一个助力发表超过1000篇科研文献的高参数单细胞分析平台，被广泛应用于生物学和医学研究的多个领域的研究工作。其高效简洁的工作流程以及广泛的适用性，正逐渐成长为当今最先进的细胞分析工具之一。