预警！2022年经典分析绘图软件，总有一款适合你

好不容易出来实验数据，该怎样去呈现数据呢？在SCI文章中展示科研数据有一个不成文的规则：一表毁所有，一图胜千言。能用统计图呈现，就尽量不用表格。

试问您有多少次做出来的科研图是这样的呢？（见下图）明明自己做了大量的工作却没有很好的呈现形式，只得一遍一遍打乱重画，得到的结果却仍然不尽如意~这是一件令人深思的问题，您是否考虑过可能您并没有选择好合适工具？或者您在绘图方面的知识储备是不够的呢？

表 | 标记蛋白鉴定结果表

AI是Adobe illustrator的缩写，AI能干什么？在科研作图中起了什么作用？(假设你对AI一无所知)。AI在科研绘图或者插画制作等方面有重大用处，只是平时的你让无所不能的PPT抢了AI的“饭碗”。AI容易上手又能够很好得解决包括很多PPT无法解决的问题，从而提高科研效率。AI可用于美化数据图，因此数据图尽可能保存成矢量图，矢量图导入AI能够进行深度修饰、美化、排版，最终和论文完美结合。

Origin Pro 具有两大主要功能：数据分析和绘图。

Origin Pro 数据分析包括描述统计、假设检验、方差分析、非参数检验、信号处理、图像处理、峰值分析和曲线拟合等各种分析功能。

相应的插件 Apps 能够外接 python、R 等软件，处理诸如地图、文本、数值等数据，还可以运行神经网络模型。Origin Pro 软件数据分析步骤简单，不需要额外的运行代码：准备好数据后，进行数据分析时，只需选择所要分析的数据，然后再选择相应的菜单命令即可。

Origin Pro 绘图能够制作目前所见的所有类型图形，比如桑基图、弦图、边际分析图等。

相关资源参考

https://my.originlab.com/forum/default.asp

Sigmaplot 是一款功能强大的专业科学绘图软件，对国内用户来说，无法及时更新版本是一个弊端，Sigmaplot 仍然有庞大的受众基础，其提供了众多科学选项，例如自动误差线，回归线，置信区间，轴断点，技术轴刻度，非线性曲线拟合以及用于强大数据处理的数据工作表。

Sigmaplot14.0 可以使用 Word 公式编辑器对图表进行注释，直接在 Word 或 PowerPoint 中编辑图形，或者在 SigmaPlot 内用 Excel 电子表格绘制数据，这是 Origin Pro 软件无法提供的

相关资源参考

https://https://systatsoftware.com/sigmaplot/

Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据的结合成可视化网络。

Cytoscape 源自系统生物学，用于将生物分子交互网络与高通量基因表达数据和其他的分子状态信息整合在一起，其最强大的功能还是用于大规模蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质-DNA和遗传交互作用的分析。

通过Cytoscape，可以在可视化的环境下将这些生物网络跟基因表达、基因型等各种分子状态信息整合在一起，还能将这些网络跟功能注释数据库链接在一起。Cytoscape 的核心是网络，简单的网络图包括节点（node）和边（edge），每个节点可以是基因、miNRA或蛋白质等等；节点与节点之间的连接 (edge) 代表着这些节点之间的相互作用，包括蛋白与蛋白相互作用（pp），DNA与蛋白相互作用（pd）等。

相关资源参考

https://cytoscape.org/

除了以上强大的作图软件，目前使用云平台作图也能极大的解决由于不会代码被难住的科研图脚步，小鹿推荐这款云平台登录即可使用，导入数据，快速出图，还能依据您的配色自定义设置配色~（欢迎各位科研老师积极使用，多多给与反馈意见是我们前进的动力~）

欧易/鹿明云平台：https://cloud.oebiotech.cn/task/

目前欧易/鹿明云平台可实现基础图形，聚类热图、GO/KEGG气泡图、Venn图、PCA分析、火山图、GO富集条形图等绘制~同时还有更多功能分析，统计分析功能。如果您是做转录组，蛋白组，代谢组，“墙裂”推荐尝试使用欧易/鹿明云平台。

相关资源参考

https://cloud.oebiotech.cn/task/

除了以上软件能极大地解决我们做数据分析的难题，还有更多进阶生信分析知识干货哦~

欧易/鹿明推出的专题系列，《这个R包不太冷专辑》，超多实用生信知识干货，快来领取吧~

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Lisa 撰文

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