2021-03-09 16:07:31, 请关注→ 深圳华大智造科技有限公司
如何利用10 ng - 1 μg total RNA快速制备NGS文库,更准确地得到转录本序列、丰度信息,发现新转录本,分析转录本结构变异?华大智造MGIEasy RNA文库制备试剂套装了解一下!全文约800字,阅读时长1min。
背景介绍
与DNA相比,RNA的种类更多,包括mRNA、小RNA、长链编码RNA、核糖体RNA、环状RNA等。不同类型的RNA在测序文库的制备过程中,需要不同的制备工具和平台。基于华大智造高通量测序平台BGISEQ/MGISEQ的RNA文库制备,已基本涵盖RNA-seq、转录组测序、total RNA测序、lncRNA测序和小RNA测序等多个研究方向,可搭配不同RNA富集方法及不同测序读长。
针对RNA测序,华大智造MGIEasy RNA文库制备试剂套装可利用10 ng - 1 μg total RNA快速制备NGS文库,更准确地得到转录本序列、丰度信息,发现新转录本,分析转录本结构变异,适用于人、动物、植物等多物种的基因表达和转录组研究。
数据测评
以Universal Human Reference RNA(UHRR)标准品为测试样本,利用华大智造MGIEasy RNA文库制备试剂套装进行文库构建,在MGISEQ-2000上采用PE100测序。在基因组比对率、基因比对率、基因检出数、转录本检出数、重复性等性能方面进行评估,不同样本起始量下构建的文库均具有出色的测序数据质量。特别地,通过与不同平台不同试剂盒的转录本覆盖度对比分析表明,华大智造MGIEasy RNA文库制备试剂套装能够高度均匀的覆盖转录本5’端至3‘端,具有更优异的3’端覆盖度。
基因组/基因区比对率
图1 不同样本起始量下的基因组/基因区比对率
基因检出数及转录本检出数
图2 不同样本起始量下的基因检出数及转录本检出数
重复性

(点击查看大图)
转录本覆盖度
图4 不同平台不同试剂盒的转录本覆盖度
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