2021-03-01 12:26:35, 华大智造 深圳华大智造科技有限公司
作为全球日生产能力最强的基因测序仪,DNBSEQ-T7已获得NMPA认证和CE-IVD认证,同时提供全流程自动化整体解决方案。本期回顾,将与大家一起对这台超级性能怪兽进行360度围观。
超级通量模式
生产级的DNBSEQ-T7通量惊人,单张载片最大有效reads数可达5000M,最大数据量达1.5Tb,四载片连载日产数据量高达6Tb,广泛适用于全基因组测序(60例/天)、超高深度外显子组测序(400例/天)、宏基因组测序(1000例/天)、肿瘤Panel测序(6000例/天)等大型测序项目。
表1 DNBSEQ-T7测序模式适用的文库类型
*单张载片产生的数据量与测序模式相关
超级运行模式
DNBSEQ-T7拥有4联载片平台,灵活支持1-4张载片独立运行:每张载片在上机后可自动完成清洗和回收,能够在24小时内无缝衔接多轮测序。
表2 DNBSEQ-T7性能参数一览表
[1]SE50面向新冠疫情特别开发,限量供应,优先满足新冠病毒基因检测需求
[2]PE150将于2020年6月底上市
*高于Q30的碱基百分比及运行时间是特定标准文库通过整个运行平均所得,实际应用表现受样本类型、文库质量、插入片段长度等影响。
超级速度模式
SE50~5小时
PE100~20小时,PE150~24小时
以新冠病毒基因测序为例,DNBSEQ-T7使用SE50进行新冠病毒测序,5~6个小时可完成一轮测序,如高通量宏基因组测序(100M reads/样本),每轮可检测~128例样本,每天可做4轮检测;再如多重测序筛查(5M reads/样本),每轮可检测~2300例样本,每天可做3轮检测,日检测通量近万。
一站式整体解决方案
围绕DNBSEQ-T7,华大智造提供全面的自动化解决方案。在上游的样本前处理方面,可适配华大智造自动化样本制备系统MGISP系列(MGISP-960/MGISP-100);在下游的计算存储方面,华大智造推出了集计算、存储和分析软硬件为一体的“T7伴侣”:ZTRON生信自动化服务平台。在整体的实验室管理方面,华大智造ZLIMS实验室信息管理系统提供端到端的解决方案。
数据表现
DNBSEQ-T7的数据表现一直是业内关注的焦点,目前已支持10余种不同文库和测序类型,包括WGS、WES、WGBS等常见库类型,及stLFR、RNA、单细胞等特殊文库类型。此外,在DNBSEQ-T7平台上,对不同类型的文库混合、单双INDEX混合进行了测试,数据结果表现优异。

*DNBelab C系列单细胞RNA文库制备套装近期上市
表4 基于DNBSEQ-T7的人标准样本WGS案例
温馨提示:
部分原始数据可登录华大智造官网,点击菜单栏“支持”,进入“Demo”选项自行下载分析。
已发表文章
靠谱
韩国基因组学中心(KOGIC)等机构在BioRxiv发布了基于DNBSEQ-T7的多平台测序性能对比研究,结果表明:华大智造DNBSEQ测序平台和其他平台在测序质量、覆盖均匀性、GC覆盖度和变异准确性方面均有可比性,且相较之下更具成本优势。
伦敦帝国理工学院传染病流行病研究中心,潍坊疾控中心等单位基于DNBSEQ-T7的基因组数据用于对潍坊市28例新冠病毒阳性样本进行测序,基于数据分析建立了流行病学系统模型,对基因组流行病学的研究提供了地域依据。
温馨提示:
DNBSEQ-T7已获得NMPA认证和CE-IVD认证。

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