产品快讯 | 新型冠状病毒检测新选择

2021-03-01 12:27:29, 华大智造 深圳华大智造科技有限公司

全球新冠病毒感染者已经突破百万，形势依然严峻，实时对病毒的全基因组监测能够帮助我们直观了解病毒的变异，传播和进化，对于临床的治疗和耐药研究具有指导作用。


华大智造基于ATOPlex定制化产品平台开发的超高重PCR扩增技术，可在单管中实现病毒全长基因组的富集，并结合双唯一barcode防串扰技术和DNBSEQ测序技术，最大程度真实还原病毒的全基因组序列，最低只需要1 Mreads即可满足病毒全长基因组的覆盖。



操作简单，满足定量需求



ATOPlex SARS-CoV-2 Full Length Genome Panel V1.0不仅能够对全基因组进行检测还能对病毒的浓度进行相对定量，通过掺入的已知拷贝数的人工合成DNA序列，能够准确获取样本病毒载量信息；整个实验操作只有3步，手工时间1小时，样本不需要分管，最大程度降低样本交叉污染风险。


图1：产品设计和工作流程



高灵敏度，极端样本也能有良好表现



ATOPlex SARS-CoV-2 Full Length Genome Panel V1.0能够快速准确低成本获取病毒全基因组信息，针对极端样本，也能有很好的检出，并且与水样本有显著差异，对于临床上低病毒载量样本（比如咽拭子、鼻拭子）尤为适合，能够降低假阴性，减少漏检风险。


图2 ：梯度稀释病毒培养物在1M原始数据下检测到的病毒基因组的覆盖深度


借助基于ATOPlex SARS-CoV-2 Full Length Genome Panel V1.0试剂盒产品并结合基于DNBSEQ的高通量测序方法，科学家可以快速识别并获得SARS-CoV-2病毒全基因组、病毒耐药性、病毒载量等生物学信息，用以跟踪遗传变化，并快速应对疫情爆发。


关于ATOPlex平台

ATOPlex多重PCR定制化平台是华大智造自主研发的以超高重PCR技术为核心的产品定制平台。该平台涵盖了DNA、RNA和DNA甲基化方向，可以满足科研、医药、司法、农业、DTC等相关领域的个性化基因检测产品定制。ATOPlex多重PCR定制产品平台提供产品设计、建库试剂，此外，还可以提供该系列产品基于MGISP-100或者MGISP-960 的自动化建库技术平台。

图3：ATOPlex平台







Q&A


1. ATOPlex SARS-CoV-2 Full Length Genome Panel V1.0是如何解决overlap的问题？

Padlock技术将一个目标区域的F/R特异性引物通过一个唯一的互补序列进行锁定，防止不成对引物的扩增，能够有效的避免overlap区域的扩增，因此只需要一个引物池即可完成全基因组的扩增。


2. ATOPlex SARS-CoV-2 Full Length Genome Panel V1.0扩增子长度是多少？引物设计的位点在哪儿，内参和外参分别是什么？

扩增子长度范围159-199bp，平均长度189bp，总共259个扩增子，位点覆盖整个病毒的全基因组序列，内参的靶标是GAPDH基因，外参是我们人工合成的一段已知浓度的DNA序列。






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