2021-02-22 11:42:58, Dr.J 上海吉凯基因医学科技股份有限公司
2015年是中药,2016年是自噬。Bingo,您猜对了,这样的课题就是中药与自噬的研究,嘿嘿。
今天分享的文章是做黄连素与自噬的,本来是黄连素高分文章系列的第三篇,只是今年自噬拿诺贝尔奖了,就把这篇提前分享出来吧。
Berberine attenuates autophagy in adipocytes by targeting BECN1. 2014. Autophagy.
药物:黄连素。基因:BECN1。表型:自噬。疾病:肥胖相关的脂肪细胞。
我们来看看做了些啥工作,最后做个总结发发福利。
Figure 1. BBR inhibits autophagy in adipocytes.
一上来就做药物功能。黄连素能够抑制脂肪细胞的自噬。(药效评价数据-细胞实验)
大家注意下ABCD里面的柱形图,一般自噬除了展示WB图外,最好有个统计图,这里的统计图是LC3II与内存GAPDH的比例。其实最好的是用LC3II与LC3I的比例。这两个比例代表的意思是有点差异的,大家发高分文章注意下。
E图是LC3的荧光,没有做自噬流的荧光图,有点小遗憾。(啥,你不知道自噬流的荧光图咋做?联系业务员吧,有很好的工具,去年就有了。)
Figure 2. BBR suppresses Becn1 mRNA and protein expression in adipocytes.
开始探讨机理了,找到了基因。黄连素加入细胞后Becn1的mRNA和蛋白都下降了。(药物与药靶的分子相关性数据)
重点看G图,黄连素加入后同时过表达BECN1,发现黄连素造成的自噬抑制被回复了。功能回复实验。(药物与药靶的功能相关性数据,且是最好的回复实验。)
Figure 3. BEC N1 is required for basal autophagy in adipocytes.
找到药物黄连素的靶点BECN1了,那么这个药靶是否真有这个功能呢。A图是干扰BECN1,发现可以抑制自噬。B图用了ABT-737可以认为是BECN1的激动剂,促进自噬。C图是过表达BECN1,促进自噬。(药物与药靶功能相关性数据,分类中的a步骤。不清楚的联系业务员,要下中药研究的讲座PPT。)
Figure 4. BBR decreases BECN1 mRNA stability through the Mir30 family.
进一步的机理探讨。发现黄连素通过mir30家族调控了BECN1。这个图大家可以仔细看看,与我们平时讲的药靶下游机制不同,做的是药靶上游机制,需要跟药物联系起来。另外,mir30对BECN1的调控其实是报道过的,所以标题中没有说这个机制。(药靶的机制)
Figure 5.HFD-induced autophagy was partially recovered by BBR treatment in adipose tissue of mice.
动物实验,黄连素在体内可以抑制脂肪组织中的自噬。(药效评价-动物实验)
Figure 6. Expression of Mir30a, Mir30b, Mir30c, Mir30d, and Mir30e in each group.
动物实验的组织中把药靶机理分子也做了检测,黄连素加入后mir30家族上调,大家注意不是所有数据的ttest都小于0.05噢。
Figure 7. A working model summarizing the role of Beclin 1 in autophagy in adipocytes and the effect of BBR on autophagy.
最后来个模式图,肥胖导致BECN1上调,导致自噬增高。黄连素通过上调mir30家族,降低BECN1,从而降低肥胖脂肪细胞中的自噬。其实这个说法是拔高本文,文章中并没有探讨肥胖与自噬的关系。
最后我们按照中药课题的研究内容总结下:
一、药效评价
细胞实验:脂肪细胞中黄连素抑制自噬。
动物实验:肥胖动物模型上黄连素抑制脂肪细胞的自噬。
二、药物机理-药靶鉴定
1、临床相关性:动物模型数据,建模后BECN1增高。
2、药靶功能:过表达,激动剂,干扰。都做了。
3、药物与药靶相关性
分子相关性:黄连素下调BECN1。
功能相关性:回复实验。
4、药靶机制:做的上游机制,mir30家族对BECN1的调控。
药物课题的研究内容两大块都做完整了。
创新性如何分析呢,其实黄连素与自噬在这篇文章之前是有文章发表的,但在脂肪自噬中没有报道过。这篇文章的创新点有两个,1、黄连素与脂肪中的自噬,属新药。2、黄连素调控BECN1,新关系。BECN1是老基因。
发福利了。因为现在自噬拿诺贝尔奖了。如果我研究的疾病与自噬相关,而黄连素在我研究的疾病中没有人研究过,赶紧用黄连素看看。然后找个新基因,课题为“黄连素通过A基因影响B自噬信号通路治疗C疾病的机理研究”。
PS:希望和季博在学习、实验上有更多交流的朋友们,可以关注吉凯基因微信并回复“季博”两个字。
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