病毒检测与研究系列报道（六）: 植物病毒病原体

植物有一套明确的防御机制来对抗侵入的核酸（如病毒转录本）。沉默通路相当复杂，但在各个种之间，甚至每个种之内，效应复合物的步骤和性质也在变化。

参考文献:

Bronkhorst A. W., vanCleef K. W., Vodovar N., Ince I. A., Blanc H., et al. (2012) The DNA virusInvertebrate iridescent virus 6 is a target of the Drosophila RNAi machinery.Proc Natl Acad Sci U S A 109: E3604-3613

昆虫中的RNA病毒是以RNA干扰(RNAi)为基础的抗病毒免疫应答的目标。这项研究以无脊椎动物虹彩病毒6(IIV-6)感染后的果蝇为模型，研究了RNAi在DNA病毒感染中的作用。为了弄清dsRNA是否被加工成病毒小干扰RNA(vsiRNA)，作者利用Illumina GenomeAnalyzer对小RNA进行测序。数据表明，大量vsiRNA以RNAi途径依赖的方式产生，说明RNAi带来了对抗dsDNA病毒的抗病毒防御系统。

Rowe J. M., DuniganD. D., Blanc G., Gurnon J. R., Xia Y., et al. (2013) Evaluation of higher plantvirus resistance genes in the green alga, Chlorella variabilis NC64A, duringthe early phase of infection with Paramecium bursaria chlorella virus-1.Virology 442: 101-113

随着行业对藻类的兴趣不断增加，以及其在水生生态系统中的关键作用，我们需要了解藻类病原体的影响。在一个藻类宿主-病毒模型系统中，作者应用Illumina RNA测序来确定与那些参与高等植物中RNA沉默和病毒响应的基因同源的基因表达。这种方法检测到375个定义同源物中的325个，它们在健康以及感染的藻类细胞中表达，表明RNA沉默可被藻类用作病毒感染的响应。

绿藻（Chlorella variabilis）被用作抗植物病毒的一个模型系统

Zhang Z., Zhang P.,Li W., Zhang J., Huang F., et al. (2013) De novo transcriptome sequencing inFrankliniella occidentalis to identify genes involved in plant virustransmission and insecticide resistance. Genomics 101: 296-305

西花蓟马（WFT）是一种昆虫，通过直接喂食和间接传播番茄斑萎病毒属病毒，如番茄斑萎病毒（TSWV），造成世界范围内的农作物损失。在这项研究中，作者利用Illumina HiSeq系统进行RNA测序，鉴定了WFT的转录组以及响应TSWV感染的WFT差异基因表达。作者发现，TSWV能调控细胞过程和免疫反应，这表明存在一种不会对其载体宿主WFT造成不利影响的机制。

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