2018-12-27 12:03:01, Metabo-Profile 麦特绘谱生物科技(上海)有限公司
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为了帮助临床医生及科研工作者更好地使用代谢组学这一科研工具来深入探究各类疾病机制、疾病诊疗及药物发现等,麦特绘谱发起并创立以互联网为依托的代谢组学技术标准化和应用线上互动平台,我们将邀请业内有经验的并致力于代谢组学技术标准化和应用领域的同仁们,分享他们的研究成果和心得体会。
首期
公开课由麦特绘谱技术总监苏明明主讲,以“临床代谢组学”为主题,于6月26日晚圆满举办。整场公开课内容丰富,干货满满,更有激烈的课后互动环节,众多粉丝在分享结束后仍意犹未尽。为此小编现将公开课内容做个简单回顾,希望能对错过本期公开课的同仁们有所帮助。
本期公开课内容涉及代谢组学临床应用的机会在哪里、临床代谢组学的设计思路和注意事项等,并以急性髓性淋巴细胞白血病(AML)的代谢组学研究为例进行经验分享。
代谢组学临床应用的机会在哪里?
第一,同一个体的纵断面研究。曾经我们关注比较多的是比较型代谢组学如横断面的研究,随着技术的进步我们认为代谢组学的机会在于同一个体纵断面的研究,比如通过观察同一个人自然衰老的代谢变化过程,期望寻找一些相关的生理病理指标来预测个体疾病风险。运用该思路分析糖尿病患者,使用支链氨基酸、特征脂肪酸和胆汁酸的比例,作为代谢性疾病的预测指标。
第二,定量的、靶向的代谢组学研究。该方法目前应用最为成功莫过于新生儿遗传代谢病的氨基酸肉碱的串联质谱检测。通过代谢组学研究开发多指标同时定量检测的试剂盒,对于指导临床疾病的科学诊断和合理用药意义重大。
代谢组学实验的设计思路和注意事项
讲到实验设计,苏老师认为要利用代谢组学的研究思路,将生物标志物的组合转换成反应疾病和代谢状态的关键要素,帮助我们从传统的分子标志物的研究上升为机制性研究并进一步转化为临床药物的发现。此外,苏老师和大家一起分享了实验操作细节,包括样本取样、制备、保存的方法和技巧等。样本的数量和质量是科学合理实验设计的前提,保存时间和冻融次数、低温操作等需格外注意,同时记录饮食和生活方式有利于确保数据质量。
讲座还重点介绍代谢组学研究中建立数量庞大的内源性代谢物标准品库的重要性,着重强调其与网络数据库对比在物质鉴定准确度方面的差异性,以及检测过程中确保数据质控的必要性,从而保证数据的科学性和可靠性。
案例分享
最后,苏老师和大家分享了急性髓性淋巴细胞白血病(AML)的代谢组学研究案例,详解了实验过程及整体思路,并说明了如何层层深入得出最终的实验结果。该研究发现AML患者整体代谢谱出现显著变化,尤其是糖酵解代谢水平非常活跃,而且患者的糖酵解代谢活性越高,其生存就越差。在后续的工作中观察到,AML细胞异常活跃的糖酵解代谢可导致骨髓微环境中葡萄糖严重缺乏,在这种情况下AML细胞如何保持足量的碳源摄取以维持细胞的恶性增殖将是一个全新的癌症代谢机制。
随着研究的进一步深入,还获得了一个重要发现:在葡萄糖缺乏的情况下,AML细胞可启动一个替代机制转而利用果糖(果糖是人体血液系统中的第二大血糖,它的细胞转运由SLC2A5基因编码的GLUT5蛋白转运子介导),AML细胞表达的SLC2A5基因水平越高(即利用果糖的能力越强),则患者的预后越差,由此发现,负责果糖转运和利用的蛋白转运子GLUT5,是治疗AML的一个新的靶点。
以上为本期课程的精彩内容,如果您也对代谢组学感兴趣,如果您很遗憾错过了本场讲座,请继续关注麦特绘谱的最新消息,我们将为您带来更多启发性的在线课程。希望这个公益性的交流平台能够切实的帮助到每位科研工作者!
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