差异表达蛋白的分析方法

仪器简介:Ettan DIGE系统包括CyDye DIGE荧光标记物,IPGphor 3/Ettan DALT电泳系统,Typhoon多功能激光共聚焦扫描仪和DeCyder 2D差异分析软件。CyDye DIGE荧光标记物专门为Ettan DIGE系统设计,这些荧光标记物是分子量和电荷匹配的,具有信号强,光谱分开,吸收和发射峰窄等特点。这些特点使不同的CyD......

随着质谱技术的灵敏度和分辨率的提高,样本分离分级方法进一步优化,PTM的测序深度不断增加。单就磷酸化而言,深度测序技术在人类、拟南芥等生物中已可坚定到6万多个修饰位点。而在其他PTM上的表达谱研究也不断刷新着研究者们的已有认知。这无不向我们展示出PTM表达谱巨大的研究潜力。实验流程应用方向生物领域各个研究方面,如:▶ 磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育及癌......

Cluster聚类 / 热图聚类分析可以反映不同样本间蛋白质表达量的变化,还可以选取能决定不同样本间差异的关键靶点。互作网络PPI蛋白质互作网络分析可以为通路之间的关系和相互作用的研究提供思路,对于在系统层次上研究不同生理、病理条件下样本生物学过程的变化机制、疾病的发生机制、药物作用机理等有重要意义。COG / KOG注释COG/KOG注释是通过结合进化关系......

Millipore核酸提取仪纯化产品参考多项行业标准Novagen。完成蛋白、核酸的检测。可以用在蛋白行业领域中的蛋白、核酸提取和制备项目。 抗原和抗体的高水平生产中,上游表达系统的合理选择和优化是核心技术。默克密理博Novagen的大肠杆菌/昆虫细胞/哺乳动物细胞表达工具各有特点,是特定蛋白表达的最佳选择。而蛋白抽提、纯化、浓缩/除盐/换液、复性、高通量操......

赛默飞液相色谱仪EASY-nLC 1200适用于复杂糖蛋白完整糖肽项目,参考多项行业标准暂无。可以检测重组表达的高度糖基化蛋白等样品。可应用于多个行业领域。 Thermo ScientificTM EASY-nLC 1200TM 是纳升级LC系列产品EASY-nLC家族中的zei新成员。该系统具有在更高高压(1200bar)条件下分离生物分子(比如蛋白质和......

赛默飞UltiMate™ 3000 快速分离四元系统适用于分析几种蛋白的 胰蛋白酶酶解多肽产物的条件优化项目,参考多项行业标准] Kauffman, J.S. Analytical Testing to Support Biopharmaceutical Products. Biopharm.International, 2007, April, 20-2......

赛默飞 组合式质谱仪Orbitrap Elite™可用于测定重组表达的高度糖基化蛋白,适用于复杂糖蛋白完整糖肽项目。并且参考多项行业标准暂无。可应用于多个行业领域。      Thermo ScientificTM Orbitrap EliteTM 组合式质谱仪具有高场Orbitrap以及先进的信号处理技术......

赛默飞气质Orbitrap Exploris GC 240用于测定酱香型白酒A, 酱香型白酒B, 清香型白酒A,清香型白酒B, 保健酒,威士忌,白兰地,朗姆酒,符合行业标准。适用分析酒中的风味物质及其差异性标记物项目。 • 卓越的分析性能Orbitrap Exploris GC 240 为所有应用领域的研究人员带来了高达 240,000超高分辨率......

为检验所选取的差异表达蛋白质或特征差异表达蛋白质的合理性和准确性,可以通过聚类分析将蛋白按照表达量的趋势聚合在一起,可以实现更为直观的蛋白质组学数据分析。1. 层次聚类分析对筛选出的差异表达蛋白做层次聚类分析,将具有相同或相似表达模式的蛋白进行聚类。差异表达蛋白聚类结果如下图:图1 差异表达蛋白层次聚类图注:图中不同的列代表不同的样品,不同的行代表不同的蛋白......

蛋白质差异性分析能够极大地推动发现新的生物标志物,提升生物标志物鉴定的精准度,对临床疾病分析具有重要价值。百泰派克能够基于统计学数据提供更精准的蛋白质差异分析,以发现在不同生理状态下和不同组织中的蛋白质水平表现的显著差异。在差异表达蛋白统计过程中,将FC≥1.3(或≤1/1.3)作为差异蛋白的统计标准。FC≥1.3的蛋白认为是上调(up-regulation......